“從芯片到新一代測(cè)序”講座-上海交大醫(yī)學(xué)院（5.20）

 

表觀遺傳的改變（基因組DNA甲基化、組蛋白修飾等）以及轉(zhuǎn)錄因子與DNA的相互作用都可以在轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控基因的表達(dá)，并與生物體正常生理過程以及疾病發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。講座將介紹基于高通量芯片和Illumina GA IIx測(cè)序平臺(tái)的高通量檢測(cè)技術(shù)及應(yīng)用：包括MeDIP-chip、ChIP-chip、MeDIP-Seq、ChIP-Seq。

 

長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)作為長(zhǎng)度超過200nt的非編碼RNA,與microRNA為代表的small ncRNA, 在表觀遺傳、轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后等多個(gè)層面調(diào)控基因表達(dá)。講座將介紹非編碼RNA的多種研究方法及應(yīng)用，包括microRNA表達(dá)譜芯片，最新推出的lncRNA表達(dá)譜芯片，以及Illumina GA IIx新一代測(cè)序技術(shù)在非編碼RNA研究中的應(yīng)用。

 

實(shí)時(shí)定量PCR芯片，結(jié)合了芯片高通量和實(shí)時(shí)定量PCR準(zhǔn)確性的優(yōu)點(diǎn)，廣泛應(yīng)用于各種疾病和正常生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制的研究。講座將系統(tǒng)介紹PCR array的應(yīng)用，一次精確檢測(cè)幾十到幾百個(gè)不同基因，有超過100種不同信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路或疾病研究的方向可供選擇；講座還將介紹專門用于研究microRNA表達(dá)的PCR array。

 

全基因組表達(dá)譜芯片可一次性檢測(cè)所有已知基因（mRNA）的表達(dá)水平，是目前應(yīng)用最廣泛的生物芯片技術(shù)平臺(tái)。講座將介紹表達(dá)譜芯片技術(shù)與生物學(xué)研究尤其是疾病研究的有效結(jié)合，重點(diǎn)涉及實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)與芯片數(shù)據(jù)的深入挖掘。

 

 

時(shí)間：2010年5月20號(hào)（星期四）下午14：00-16：00（講第二、第四部分）

地點(diǎn)：上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院5號(hào)樓11樓免疫學(xué)研究所會(huì)議室

          （上海市重慶南路280號(hào)5號(hào)樓11樓會(huì)議室）

 

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