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NimbleGen綜合性癌癥基因捕獲進(jìn)行全面癌癥突變檢測

瀏覽次數(shù):2555 發(fā)布日期:2012-10-26  來源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請注明出處
羅氏NimbleGen綜合性癌癥基因捕獲進(jìn)行全面癌癥突變檢測
 
個人化癌癥治療是癌癥治療的發(fā)展方向與研究熱點,相關(guān)的各種分子檢測方案的發(fā)展迅猛。美國一個癌癥中心開發(fā)了一個兩步法方案用于指導(dǎo)藥物選擇、選擇合適的患者參加藥物臨床實驗。
 
這兩步檢測法包括:第一步,對少量癌癥基因的突變熱點進(jìn)行測序,這些基因通常有較為明確的針對性治療方案或者靶向藥物,此作為快速的初步篩選,使通過篩選的患者可以參與到新藥的臨床實驗中。第二步,對超過200個的癌癥基因進(jìn)行測序,發(fā)現(xiàn)額外的相關(guān)突變,獲得更全面的病人基因突變信息。
 
在對這200多個癌癥基因的測序中,首先采用了NimbleGen SeqCap液相序列捕獲產(chǎn)品,即通過探針雜交的方法在溶液中富集樣本癌癥基因序列,而然后進(jìn)行測序。采用的NimbleGen產(chǎn)品正是羅氏最新推出的綜合性癌癥基因捕獲試劑(Comprehensive Cancer Panel)。
 
這個產(chǎn)品包括了256個癌癥基因,來自于Cancer Gene Census(Sanger)及NCBI Gene Tests,這些基因都已癌癥相關(guān)研究的數(shù)據(jù)、文獻(xiàn)發(fā)表,全面覆蓋了癌癥基因。210萬個DNA探針覆蓋了這些基因的全部外顯子區(qū)域,而不僅僅是一些突變熱點區(qū)域。同時,研究人員也表示,這一方法可以用于檢測、發(fā)現(xiàn)基因拷貝數(shù)的改變。
 
在該研究中心,接受這一檢測的人數(shù)目前約有600人,而明年可能達(dá)到3000人。檢測的癌癥病人種類也將從目前的結(jié)直腸癌、乳腺癌擴(kuò)大到多種固體腫瘤、血癌,從原發(fā)癌組織到轉(zhuǎn)移癌病例的檢查,表明這一檢測方案的廣泛適用性以及全面價值。
 
研究人員也表示將利用這個綜合性癌癥捕獲方案對藥物有特殊反應(yīng)的病人進(jìn)行研究。這些病人對于某種藥物特別敏感,或?qū)λ幬锟焖俚哪褪艿鹊炔煌闆r,通過全面地癌癥基因突變檢測,可能發(fā)現(xiàn)新的分子標(biāo)記物用于確定藥物作用、敏感性、耐藥性以及獲得性耐藥的原因與機(jī)制。
 
由此可見,NimbleGen Comprehensive Cancer Panel通過全面的癌癥基因覆蓋、全面的基因區(qū)域,對于癌癥相關(guān)的研究及臨床參考提供了充分的信息,幫助該領(lǐng)域的專家進(jìn)行新的科學(xué)發(fā)現(xiàn)和有意義的臨床方案開發(fā)。


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