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生物信息學(xué)首選語言--Perl語言零基礎(chǔ)培訓(xùn)班通知

瀏覽次數(shù):4055 發(fā)布日期:2013-8-13  來源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請注明出處
Perl語言作為絕大多數(shù)生物信息學(xué)工作者首選語言之一。北京市計算中心生物計算事業(yè)部針對沒有任何計算機(jī)語言的生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、農(nóng)學(xué)等人員,且有從事生物信息學(xué)工作相關(guān)研究工作的需要。歡迎您報名參加!
主辦單位:北京市計算中心,生物計算事業(yè)部
舉辦地:北京,北京市海淀區(qū)豐賢中路7號北科產(chǎn)業(yè)3號樓
培訓(xùn)時間2013年8月26日-29日 
報名截止:2013年 8月25日
培訓(xùn)內(nèi)容及安排: 
日期
時間
授課題目
授課內(nèi)容
第一天
09:30-10:00
生物信息學(xué)與Perl語言概述
概括介紹生物信息學(xué)背景與Perl語言的概念及特點
10:00-10:20
軟件安裝與運行環(huán)境調(diào)試
Perl語言解釋器、編輯器安裝,Perl程序運行測試
10:20-12:00
基本操作與基本概念
DOS、Unix命令行操作基本命令;Perl語言基本變量與操作符
13:30-16:00
基本變量
變量、字符串賦值、基本運算等練習(xí)
第二天
09:30-12:00
基本語法結(jié)構(gòu)
判斷結(jié)構(gòu);循環(huán)結(jié)構(gòu);練習(xí)
13:30-16:00
數(shù)組及應(yīng)用
數(shù)組的概念及用法;練習(xí)
第三天
09:30-11:00
文件與文件夾操作
文件的讀入與輸入;文件夾操作;練習(xí)
11:00-12:00
二維數(shù)組與hash表及應(yīng)用
二維數(shù)組概念、關(guān)聯(lián)數(shù)組(hash表)概念及用法;練習(xí)
13:30-16:00
常用函數(shù)及子程序
常用Perl語言基礎(chǔ)函數(shù)學(xué)習(xí);子程序概念與應(yīng)用;練習(xí)
第四天
09:30-12:00
正則表達(dá)式及生物信息學(xué)Perl程序?qū)嵗?/DIV>
Perl特色功能正則表達(dá)式學(xué)習(xí)與應(yīng)用;生物信息學(xué)實例程序?qū)W習(xí);練習(xí)
13:30-16:00
Bioperl簡介、CPAN簡介、常用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫與軟件簡介
Bioperl簡介與安裝;Perl第三方代碼庫CPAN簡介;常用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫簡介、數(shù)據(jù)類型與應(yīng)用;常用生物信息學(xué)軟件數(shù)據(jù)格式及軟件應(yīng)用簡介
授課實例
1、生物學(xué)數(shù)據(jù)文件批量的合并、分隔、去冗余等。
2、生物信息序列數(shù)據(jù)fastq、fasta、genbank文件等格式轉(zhuǎn)換與批量自動化處理。
3、按個性化實驗需求,從生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫文件(如genbank、EMBL)中批量自動化提取特定數(shù)據(jù)信息。
4、表格矩陣型數(shù)據(jù)的行列轉(zhuǎn)換、特定數(shù)據(jù)信息的自動化過濾與數(shù)據(jù)篩選等。
5、二代測序原始數(shù)據(jù)的批量過濾處理,如barcode識別、質(zhì)量值過濾等。
6、基因、蛋白質(zhì)序列特定位點的識別,如起始、終止位點、ORF、motif、CDS等。
7、生物信息學(xué)數(shù)據(jù)序列特征提取與自動化統(tǒng)計,如GC百分含量、k-mer統(tǒng)計、基因反向互補(bǔ)轉(zhuǎn)換等。
8、生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫文件的批量自動化下載與信息提取(選學(xué))。
(此表僅供參考,授課內(nèi)容以實際授課為準(zhǔn))
培訓(xùn)特色
1、對口生物信息;    2、非嚴(yán)格語法,適合初學(xué);
3、功能強(qiáng)大、跨平臺;4、有巨大的第三方代碼庫CPAN
報名費用  注冊費:2800元/人(含聽課費、資料費、上機(jī)費、午餐,請自帶筆記本電腦以備上機(jī)實踐使用),主辦方可協(xié)助安排入住酒店,住宿費用自理。
付費方式現(xiàn)金、支票、銀行轉(zhuǎn)賬、銀行匯款
單位全稱:北京市計算中心      賬號:0200151819100023937 
開戶銀行:中國工商銀行股份有限公司北京永豐支行
(匯款信息里 備注上:“生物計算事業(yè)部——您的姓名”)
報名優(yōu)惠政策
1、開課前20天報名的學(xué)員每人可減少200元;
   2、3人以上團(tuán)體報名的學(xué)員每人可減少200元;
   3、任意兩班同時報名可減少300元;
   4、4+1團(tuán)報,可免費贈送一個名額                
   5、4種優(yōu)惠政策不能同時享受,只能享受其中一種
聯(lián)系咨詢
張利英 010-59341771 ,18618295767,QQ號:2814500767,郵箱:zhangly@bcc.ac.cn
員麗麗 010-59341773, 18701529461 ,  郵箱:yuanll@bcc.ac.cn
報名回執(zhí)表:
培訓(xùn)班類型:(可多選)
□實用生物信息學(xué)培訓(xùn)班  □論文發(fā)表所需的圖表處理實用技能
生物信息與宏基因組分析專題研討班    □Perl語言專題班
□實用生物信息技術(shù)及應(yīng)用(羅靜初教授主講)
姓名:
 
性別
 
民族:
 
職稱:
 
身份證號
 
工作單位:
 
住宿:
是□;否□
研究方向:
 
報名時間:
 
通訊地址:
 
郵編:
 
固定電話:
 
手機(jī)
 
E-mail:
 
報名種類:
A□           B□             (該選項僅報名生物信息培訓(xùn)班人員填寫)
對課程了解情況
☆☆☆☆☆
感興趣的課程:
 
信息渠道:
□中心主頁 □郵件宣傳(張利英、員麗麗)□海報 □單頁 □銷售員  □丁香園  □生物論壇  □生物通郵件、主頁  □朋友推薦               
發(fā)票抬頭:
 
發(fā)票內(nèi)容:
 
住宿明細(xì)
入住時間:
離店時間:
房間類型
□大床間
□標(biāo)準(zhǔn)間(和       合。
□拼房(與其他學(xué)員拼標(biāo)準(zhǔn)間)
備注:
 
確定報名后,請將回執(zhí)表發(fā)到上述聯(lián)系人郵箱里。如在兩日內(nèi)沒有收到回復(fù),請電話聯(lián)系確認(rèn)。


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