Sage Science和PacBio共同推廣全自動(dòng)核酸制備系統(tǒng)
瀏覽次數(shù):5555 發(fā)布日期:2013-9-25
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美國(guó)太平洋生物科學(xué)公司(Pacific Biosciences)和美國(guó)Sage Science公司宣布達(dá)成合作伙伴協(xié)議,共同推廣Blue Pippin和Pippin Prep全自動(dòng)核酸制備電泳系統(tǒng),用于第3代基因測(cè)序儀PacBio RS II的文庫(kù)制備
2013年5月16日美國(guó)加利福利亞州MENLO PARK和馬薩諸塞州Beverly,提供PacBio® RS II單分子測(cè)序系統(tǒng)的 Pacific Biosciences公司,和生產(chǎn)全自動(dòng)核酸片段回收系統(tǒng)Pippin Prep和Blue Pippin的Sage Science公司,共同宣布達(dá)成合作伙伴協(xié)議,為PacBio RS II的客戶提供Blue Pippin,以便在單分子實(shí)時(shí)測(cè)序(Single Molecule, Real-Time (SMRT®) Sequencing)時(shí)獲得更長(zhǎng)的測(cè)序讀長(zhǎng)。
“我們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)Blue Pippin全自動(dòng)核酸片段回收系統(tǒng)對(duì)于從頭測(cè)序基因組裝( de novo genome assembly)這一類需要長(zhǎng)的測(cè)序讀長(zhǎng)的應(yīng)用會(huì)有重要意義”,Pacific Biosciences公司市場(chǎng)部高級(jí)副總裁Kevin Corcoran表示,“我們的研究表明使用Sage Science公司的Blue Pippin全自動(dòng)核酸片段回收系統(tǒng)對(duì)于客戶的樣品制備流程是一個(gè)簡(jiǎn)潔又高效的補(bǔ)充,特別是PacBio RS II測(cè)序系統(tǒng)需要回收10kb或更大的DNA片段!
基于PacBio公司革命性的單分子實(shí)時(shí)測(cè)序技術(shù),PacBio RS II系統(tǒng)可以產(chǎn)生平均5kb的讀長(zhǎng)片段,最長(zhǎng)可至20kb以上。PacBio RS II系統(tǒng),包括耗材及軟件,提供一種簡(jiǎn)單、快速、條塊化的操作流水線,對(duì)傳染病學(xué)、微生物學(xué)、農(nóng)業(yè)、重復(fù)序列變異形成的復(fù)雜遺傳疾病等研究提供了一種有效的方法。
Blue Pippin系統(tǒng),是Sage Science公司Pippin系列全自動(dòng)回收系統(tǒng)中的一款,使用脈沖場(chǎng)電泳技術(shù)可以回收50bp-50kb的DNA片段。獨(dú)立研究表明,Pippin 系列片段回收系統(tǒng)可以為高通量測(cè)序樣品制備提供高重復(fù)性、高精確性以及高樣品回收率。通過(guò)去除測(cè)序文庫(kù)中小分子量模板分子(low-molecular-weight templates)的污染,自動(dòng)化回收系統(tǒng)可為實(shí)驗(yàn)者提供更長(zhǎng)的文庫(kù)樣本,從而提高測(cè)序的平均讀長(zhǎng)。
“使用BluePippin可以為文庫(kù)提供大量長(zhǎng)片段序列”,Sage Science公司的市場(chǎng)總監(jiān)Alex Vira表示,“我們期待與PacBio公司及其客戶一起合作,繼續(xù)他們領(lǐng)先的長(zhǎng)片段測(cè)序技術(shù)方面的大量研究”。
在今年早期的the Advances in Genome Biology & Technology conference會(huì)議上展示的數(shù)據(jù)表明,Pacific Biosciences公司的科學(xué)家對(duì)三種文庫(kù)樣本(細(xì)菌、魚(yú)類、哺乳動(dòng)物),分別使用Blue Pippin以及沒(méi)有使用的對(duì)照組進(jìn)行了對(duì)比驗(yàn)證。結(jié)果表明,N50讀長(zhǎng)分別提升了90%、110%以及86%。Blue Pippin對(duì)于平均讀長(zhǎng)的提升有明顯效果。
About Pacific Biosciences
Pacific Biosciences of California, Inc. (Nasdaq:PACB) offers the PacBio® RS II DNA Sequencing System to help scientists solve genetically complex problems. Based on its novel Single Molecule, Real-Time (SMRT®) technology, the company’s products enable: targeted sequencing to more comprehensively characterize genetic variations; de novogenome assembly to more fully identify, annotate and decipher genomic structures; and DNA base modification identification to help characterize epigenetic regulation and DNA damage. By providing access to information that was previously inaccessible, Pacific Biosciences enables scientists to increase their understanding of biological systems. More information is available at www.pacb.com.
環(huán)亞生物科技有限公司(APG BIO Ltd)是美國(guó)Sage Science公司在中國(guó)大陸的總代理商。
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