您是否還在為自己的實(shí)驗(yàn)在開始之初就已經(jīng)發(fā)表而擔(dān)心?
您是否還在為一大堆的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)不知道該從哪里開始而發(fā)愁?
您是否還在為擁有一個(gè)龐大的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)集合而不能獲得有效的研究思路而抓狂?
不用擔(dān)心,IPA來了!IPA的來臨,為您帶來了最前沿,最清晰,最可靠的生物信息解決方案,為辛勤工作的您創(chuàng)建了嶄新的科研視野!
IPA是QIAGEN公司下Ingenuity Pathway Analysis分析平臺(tái), 該平臺(tái)是一個(gè)基于后臺(tái)高度結(jié)構(gòu)化的Ingenuity Knowledge Based的強(qiáng)大數(shù)據(jù)庫。它歷經(jīng)15年的海量投入;擁有500名phD閱讀文獻(xiàn);對700種權(quán)威雜志全文閱讀,3000種雜志摘要閱讀,它存儲(chǔ)了510萬以上的生物實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)信息,130萬種互作信息,3萬種以上分子信息;它構(gòu)建了完整的功能疾病分類數(shù)據(jù)庫,800種信號通路、代謝通路;與公共數(shù)據(jù)庫進(jìn)行全面合作,并保持每周更新一次。它為眾多以發(fā)現(xiàn)、創(chuàng)造為己任的科研工作者們提供了及時(shí)、準(zhǔn)確的生物信息數(shù)據(jù)。
現(xiàn)在,就讓我們以簡單的實(shí)例來觸摸IPA的心跳吧!
當(dāng)我們獲得了一個(gè)藥物的靶點(diǎn)的時(shí)候,我們最希望的是我們可以一目了然的知道這個(gè)藥物靶標(biāo)在受到藥物后都發(fā)生了那些變化,影響了哪些功能,影響這些功能可能是通過哪些分子進(jìn)行相互影響的。那么IPA就可以幫你解決這個(gè)問題。IPA中通過對敲減、過表達(dá)、或者藥物處理等獲得的差異基因一次進(jìn)行了多個(gè)分析,其中包括了經(jīng)典通絡(luò)分析,功能與疾病分析,上游調(diào)控因子分析,調(diào)控效應(yīng)分析,分析網(wǎng)絡(luò)分析。
舉一個(gè)簡單的例子:通過IPA對GEO數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,我們可以知道,目的基因SRF的敲減,對前列腺癌細(xì)胞中的癌癥功能顯著抑制,而細(xì)胞生長和增殖,細(xì)胞運(yùn)動(dòng),細(xì)胞循環(huán)等功能被顯著激活,在被激活的信號通路EIF2 Signaling中的基因參與了細(xì)胞凋亡?,在上游調(diào)控分析中我們發(fā)現(xiàn)了SRF基因通過調(diào)控CXCR4等轉(zhuǎn)錄因子影響了細(xì)胞侵襲等功能,在調(diào)控分析中我們發(fā)現(xiàn)了RAF1等基因可以通過ATM等基因抑制了惡性腫瘤的發(fā)生,在網(wǎng)絡(luò)分析中我們找到了目的基因可能通過FAS基因?qū)?xì)胞凋亡產(chǎn)生抑制作用。更多詳細(xì)信息需要根據(jù)不同的實(shí)驗(yàn)需求,通過IPA的分析內(nèi)容進(jìn)行更為深入的研究。
IPA的作用不僅局限于此,他可以帶著我們在基因表達(dá),microRNA,SNP微陣列的數(shù)據(jù),代謝物組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),和一些可產(chǎn)生基因、化學(xué)品列表的小規(guī)模實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)中,搜索到有關(guān)基因、蛋白質(zhì)、化學(xué)品和藥物的信息,并能夠?yàn)槟鷦?chuàng)建一個(gè)實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)的交互模型。該軟件已被世界頂尖的制藥公司和科研機(jī)構(gòu)廣泛使用,至今引用該軟件發(fā)表的高水平科研文獻(xiàn)已超過3000篇。
辛勤的科研工作者們都奔走在金光燦爛的星光大道上,您還在等待什么呢?!
現(xiàn)在,吉?jiǎng)P基因可以為您提供全面的IPA分析服務(wù),如果您有意向,快來聯(lián)系我們吧!
上海吉?jiǎng)P基因化學(xué)技術(shù)有限公司
地址:上海張江高科技園區(qū)愛迪生路332號 郵編:201203
電話:8621 5132 0189
傳真: 86-21-51370635
售前熱線:800 720 0302
售后熱線:400 621 0302
辦公郵箱: service@genechem.com.cn
URL: http://www.genechem.com.cn