上海生咨生物科技有限公司將于2016年7月24日-27日舉辦蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析研習(xí)會(huì)。本次研習(xí)會(huì)將幫助參加學(xué)習(xí)的人員深入了解當(dāng)前蛋白質(zhì)組學(xué)的主流實(shí)驗(yàn)技術(shù)、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和數(shù)據(jù)分析方法,實(shí)際操作常用的蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分析方法,包括數(shù)據(jù)提取、差異蛋白篩選、層次聚類分類、主成分分析、GO功能分類和富集分析、通路分析和蛋白質(zhì)相互作用分析等。
本次活動(dòng)是我們組織的第5期蛋白質(zhì)組學(xué)專題的研習(xí)會(huì),因R語言在蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)處理中應(yīng)用非常多,與往期不同的是我們安排了一天時(shí)間重點(diǎn)講R的入門和R在蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分析中的一些應(yīng)用,并提供R的分析示例腳本。
主辦單位:上海生咨生物科技有限公司
協(xié)辦單位:上海市藥物轉(zhuǎn)化工程技術(shù)研究中心
上海維基生物科技有限公司
講課時(shí)間:2016年7月25日-27日
簽到時(shí)間:7月24日14:30-17:30, 7月25日8:30-9:30
地點(diǎn):上海中電大酒店,上海市浦東新區(qū)南泉北路1029號(hào)中電大廈(近張揚(yáng)路)
7月24日(周日)14:30-17:30, 7月25日(周一)8:30-9:30 簽到。 | |
7月25日(周一) (9:30-17:30) |
1.1 基于質(zhì)譜蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在生命科學(xué)研究中的應(yīng)用 1.2 蛋白質(zhì)組學(xué)樣品處理注意事項(xiàng) 1.3 Maxquant軟件對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行搜庫 1.4 Perseus軟件對(duì)差異蛋白質(zhì)進(jìn)行篩選 1.5 蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析 1.6 蛋白質(zhì)組常用數(shù)據(jù)庫和網(wǎng)站 (Gene Ontology,KEGG,UniProt,NCBI等) |
7月26日(周二) (9:00-17:30) |
2.1 R語言入門和繪圖 維恩圖繪制,火山圖繪制,相關(guān)性分析和散點(diǎn)圖繪制,層次聚類和熱圖繪制,主成分分析,其他常用圖繪制等 2.2 用DAVID進(jìn)行分析和后續(xù)繪圖 2.3 HemI熱圖繪制 2.4 MeV軟件聚類分析和熱圖 |
7月27日(周三) (9:00-17:30) |
3.1 BLAST+系列工具安裝和蛋白質(zhì)序列重注釋(COG分析,GO注釋) 3.2 InterProscan介紹和分析演示 3.3采用STRING進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)分析 3.4用cytoscape進(jìn)行蛋白蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建和計(jì)算 3.4 用pajek軟件尋找蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)中兩蛋白的最段路徑 |
注:1.課程具體安排以報(bào)名當(dāng)天的課程表為準(zhǔn);
2.因需上機(jī)練習(xí),請(qǐng)自帶筆記本電腦,默認(rèn)是windows7系統(tǒng),若安裝的是linux或蘋果iOS請(qǐng)自行下載上機(jī)軟件。我們所講解的軟件均是可以免費(fèi)獲取的,但可能有操作系統(tǒng)的限制;
3.提前匯款或者預(yù)交訂金通過報(bào)名順序安排前排坐位。
收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)
學(xué)術(shù)4300元/人, 企業(yè) 5800元/人(含資料費(fèi)和中餐)
其他優(yōu)惠:
1.學(xué)生可憑有效學(xué)生證優(yōu)惠200元(注:只限脫產(chǎn),在職研究生不在此列)
2.同一單位2人以上一同報(bào)名,每人優(yōu)惠200元。
3.2016年7月5日之前匯款優(yōu)惠100元,以匯款回執(zhí)時(shí)間為準(zhǔn)。
4.上海市藥物轉(zhuǎn)化工程技術(shù)研究中心科研合作伙伴, 上海生咨生物科技有限公司客戶、之前參會(huì)的學(xué)員推薦者優(yōu)惠100元。
以上優(yōu)惠可以同時(shí)享受。
付款方式:
1.匯款至 上海生咨生物科技有限公司
開戶銀行:中國農(nóng)業(yè)銀行上海奉賢環(huán)城東路支行
匯款賬號(hào):03805500040008016
請(qǐng)?jiān)趨R款前與我們電話聯(lián)系,匯款后將回單電子郵件發(fā)給我們,以便我們確認(rèn),匯款請(qǐng)注明“研習(xí)會(huì)+姓名”。
2. 報(bào)到當(dāng)天現(xiàn)金支付或者刷卡。
聯(lián)系人
張軍閣(13301931853; 021-31131531;jgzhang@biorefer.com; QQ:1377122204)
其他
會(huì)議蓋章邀請(qǐng)函和發(fā)票于會(huì)議結(jié)束前發(fā)放;
交通住宿費(fèi)用自理,因上海迪斯尼開業(yè)原因,酒店房間可能會(huì)緊張,住宿至少需提前一周預(yù)定;
住宿協(xié)議酒店為上海中電大酒店 ,豪華標(biāo)準(zhǔn)間/大床房 320元/天(含雙早),合住每人160元/天(若無法找到合住人需補(bǔ)差價(jià)),可代為預(yù)訂。周邊也有其他商務(wù)酒店,可在網(wǎng)上自行預(yù)訂。
2016年7月15日前取消報(bào)名,全額退還預(yù)付款或者訂金。若2016年7月15日后取消報(bào)名將扣除收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)的15%后退回預(yù)付款,或者您也可全額用于下次參會(huì)使用。
講師信息
丁偉 工程師 多年蛋白質(zhì)組學(xué)及蛋白質(zhì)化學(xué)研究工作,具有豐富的的蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及培訓(xùn)經(jīng)驗(yàn) ,擅長于與蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)的實(shí)驗(yàn)技術(shù)與相關(guān)數(shù)據(jù)分析方面。多篇論文發(fā)表于《Journal of Proteome Research》、《Proteomics》和《Plos one》等雜志。
吳謙 博士,副研究員,上海生物信息技術(shù)研究中心質(zhì)譜平臺(tái)負(fù)責(zé)人,從事質(zhì)譜研究十多年,近年研究方向主要為蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)及質(zhì)譜定量分析新方法開發(fā)。
俞鴻 上海生咨生物科技有限公司經(jīng)理,資深生物信息學(xué)工程師 具有近15年生物信息學(xué)分析經(jīng)驗(yàn)。參與了水稻基因組、家蠶基因組、人肝蛋白質(zhì)組計(jì)劃以及其他的國家973、863計(jì)劃及國家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目。主要從事蛋白質(zhì)組、基因組方向的數(shù)據(jù)分析。
往期研習(xí)班照片回顧,網(wǎng)址: http://www.biorefer.com/biorefer/html/meeting/
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地點(diǎn)及交通路線:
地點(diǎn):上海中電大酒店,上海市浦東新區(qū)南泉北路1029號(hào)中電大廈(近張揚(yáng)路)
Ÿ 上海虹橋機(jī)場(二號(hào)航站樓)距離酒店19.8公里;乘出租車約43分鐘,約110元可到酒店。坐地鐵2線號(hào)到東昌路站下3號(hào)出口南泉北路口步行10分鐘。
Ÿ 上海浦東國際機(jī)場距離酒店40.6公里;乘出租車約56分鐘,約130元可到酒店。坐地鐵2號(hào)線到東昌路站下3號(hào)出口南泉北路口步行10分鐘。
Ÿ 上;疖囌揪嚯x酒店9.5公里;乘出租車約26分鐘,約70元可到酒店。坐地鐵1號(hào)線到人民廣場站轉(zhuǎn)地鐵2號(hào)到東昌路站下3號(hào)出口南泉北路口步行10分鐘。
Ÿ 上;疖嚹险揪嚯x酒店15.5公里;乘出租車約44分鐘,約100元可到酒店。坐地鐵1號(hào)線到人民廣場站轉(zhuǎn)地鐵2號(hào)線到東昌路站下3號(hào)出口南泉北路口步行10分鐘。
Ÿ 上海市地鐵9號(hào)線到商城路站下2號(hào)出口步行5分鐘。