“DNA甲基化與表觀遺傳數(shù)據(jù)分析”培訓報名通知
瀏覽次數(shù):5417 發(fā)布日期:2017-4-28
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關于舉辦“DNA甲基化與表觀遺傳數(shù)據(jù)分析”培訓的通知
各有關單位:
表觀遺傳學是研究基因在核苷酸序列不發(fā)生改變的情況下,基因表達可遺傳變化的一門遺傳學分支學科。目前,已知的表觀遺傳現(xiàn)象有DNA甲基化基因組印記母體效基因沉默RNA編輯等。DNA(主要是CpG的)甲基化是其遺傳機制和表型效應最為明確的表觀遺傳性機制。表觀遺傳學的研究已成為基因組測序后的人類基因組重大研究方向之一。這一飛速發(fā)展的科學領域從分子水平揭示了復雜的生物學現(xiàn)象,為解開人類和其他生物的生命奧秘、造福人類健康帶來了新希望。為了提高從業(yè)人員的技術水平,應廣大行業(yè)工作者的要求,中國生物工程學會和中國科學院微生物研究所網(wǎng)絡信息中心聯(lián)合舉辦“生物信息最新技術--DNA甲基化與表觀遺傳數(shù)據(jù)分析,由北京中科潤開生物科技有限公司具體承辦。培訓班采用理論和演示相結合的教學形式,同時學員與授課專家進行現(xiàn)場交流與咨詢,探討學員在平時工作、研究中的瓶頸問題。與同行交流以拓寬自己的研究思路,共同探討和挖掘表觀遺傳學資源的科學研究價值和應用前景。
一、培訓特色:
主題明確,針對性強,理論和實踐結合,主講與學員研討的方式進行
講師擁有豐富的微生物數(shù)據(jù)分析和項目執(zhí)行經(jīng)驗
課下主講老師為您所遇到的問題提供個性化解答
配合研究中所需的要點,圍繞實際研究中常用的軟件展開;
學員通過與專家直接交流,能夠分享到頂尖學術機構的研究經(jīng)驗和實驗設計思路。
二、培訓對象:
大中專院校生物信息、生物計算、生命科學、醫(yī)學、化學、農(nóng)學、計算機科學對生物信息有一定了解的
在校教師,研究生、博士生及科研單位從事該領域的研究人員
三、時間地點:2017年5月19日——5月23日 中科院微生物研究所
(時間安排:第1天報到,授課4天)
四、培訓內(nèi)容
一、表觀遺傳學研究現(xiàn)狀及未來發(fā)展
二、表觀遺傳學相關的數(shù)據(jù)庫介紹與使用
三、高通量測序技術概述
四、常用生物數(shù)據(jù)文件類型介紹與格式轉(zhuǎn)換
五、代測序數(shù)據(jù)質(zhì)控、比對分析與可視化
六、常用在線工具和數(shù)據(jù)庫使用操作 |
一、DNA甲基化原理、應用及研究方法、微生物基因組
1甲基化特異性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP)
2亞硫酸氫鹽測序法(Bisulfite sequencing PCR,BSP)
3 高分辨率熔解曲線法(High Resolution Melting,HRM)
4.比較各項甲基化研究方法存在的優(yōu)缺點等
二、DNA甲基化數(shù)據(jù)分析策略
1 WGBS分析:利用fastqc和perl腳本對原始數(shù)據(jù)進行質(zhì)控
2 之后用bismark進行mapping和beta值計算
3 R的methylKit包篩選差異甲基化位點并用pheatmap包和ggplot2包進行可視化
4 PeakAnnotator對 這些位點進行功能域和基因注釋,最后用DAVID進行GO和 KEGG通路注釋
DNA甲基化調(diào)控案例講解
DNA甲基化測序數(shù)據(jù)分析上機實戰(zhàn)
三、DNA甲基化芯片數(shù)據(jù)分析上機實戰(zhàn)
1芯片DNA甲基化分析
2利用R的IMA包進行差異甲基化位點鑒定并用pheatmap包和ggplot2包進行可視化,用DAVID進行GO和KEGG通路注釋 |
一、染色質(zhì)可及性測序技術
二、組蛋白修飾原理與分子功能
三、組蛋白修飾功能
四、核小體定位圖譜分析實戰(zhàn)練習
五、組蛋白修飾數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)練習一
六、組蛋白修飾數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)練習二 |
一、還原真實染色,質(zhì)構象--HiC技術
二、TCGA與ICGC,數(shù)據(jù)庫介紹與使用
三、干細胞的表觀遺傳學研究
四、轉(zhuǎn)錄因子ChIP-seq數(shù)據(jù)分析
五、生存曲線分析 |
五、主講專家:
主講專家來自中科院等科研機構的高級專家,擁有豐富的科研及工程技術經(jīng)驗,長期從事生物信息領域項目研究,具有資深的技術底蘊和專業(yè)背景。
六、頒發(fā)證書:
學員經(jīng)培訓考試合格后可以獲得:
由中國生物工程學會頒發(fā)的《生物信息工程師》培訓證書。
注:請學員帶兩寸彩照2張(背面注明姓名)、身份證復印件一張。
七、報名辦法及費用:
每人¥4500元(含報名費、培訓費、資料費等相關費用),食宿可統(tǒng)一安排,費用自理。請各有關部門統(tǒng)一組織本地區(qū)行政、企事業(yè)單位報名參加培訓,各單位也可直接報名參加,報名回執(zhí)表請郵件發(fā)送至會務處。
八、聯(lián)系方式:
監(jiān)督電話:010-64807385-8012 (中國科學院微生物所網(wǎng)絡信息中心)