生物數(shù)據(jù)分析技能2.0實訓會通知

 

生物醫(yī)學已進入大數(shù)據(jù)時代，借助生物醫(yī)學多組學、多層次的海量數(shù)據(jù)，可以從前所未有的廣度和深度來研究生物體運行機制。由于生物醫(yī)學數(shù)據(jù)多呈分散復雜特征，以海量數(shù)據(jù)挖掘與分析為主體內(nèi)容的生物信息學技能就成為科研必要手段，如疾病的病因?qū)W、臨床診斷標志物、治療或作用靶點識別，關(guān)鍵大分子的發(fā)現(xiàn)與功能預(yù)測，以及遺傳調(diào)控機制等方面。本課程曾先后用名《基因序列分析技術(shù)》和《功能基因組信息分析技術(shù)》，后將上述兩門課程整合更名為《生物數(shù)據(jù)分析技能》，此前共計舉辦了21期。自本期會議起，會議升級為《生物數(shù)據(jù)分析技能2.0》，對課程內(nèi)容與培訓日程進行了大幅度調(diào)整，遞進式專注講解高通量數(shù)據(jù)解析：表達數(shù)據(jù)挖掘→共表達（聚類、富集、相互作用）分析→構(gòu)建調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，以順應(yīng)學科發(fā)展和滿足學員實際需要。授課繼續(xù)沿用主講教師獨創(chuàng)的TPS（Teaching-Practicing-Showing）教學模式，著力于以真實問題為引線，將理論授課與上機實踐有機地融為一體，逐步介紹涉及的各項技能，指導學員將其融會貫通并應(yīng)用到課題研究中。TPS教學模式多年來在本科、研究生教學及20余期各類培訓會議中取得了極佳的教學效果，受到廣大學員的一致好評和推崇。

 

時間地點：

2020年1月10日-12日(周五-周日)(周五報到，周六-周日授課兩天一夜)
合肥伯爵世家酒店(合肥市瑤海區(qū)北二環(huán)雙七路156號)

主辦單位：

北京華斯泰生物醫(yī)學科技有限公司

培訓日程：(所有課程均含上機實踐)

日期	時間	授課題目	授課內(nèi)容
1月10日	16:00-21:00	培訓簽到-領(lǐng)取資料
1月11日	08:00-08:30	軟件安裝，調(diào)試運行
	08:30-10:30	表達譜差異數(shù)據(jù)挖掘	差異表達基因集（DEGs）分析策略。 GEO數(shù)據(jù)庫檢索及數(shù)據(jù)集在線分析。 利用GEO2R在線工具篩選獲得差異表達基因集，并獲得TCGA數(shù)據(jù)庫交集結(jié)果。
	10:30-12:00	表達譜數(shù)據(jù)聚類分析	利用ArrayTools軟件（設(shè)置各項參數(shù)）處理GEO數(shù)據(jù)庫下載的表達譜數(shù)據(jù)。 表達譜數(shù)據(jù)聚類分析。 聚類圖形優(yōu)化工具。
	14:00-17:30	基因集功能富集分析	利用DAVID、Metascape在線工具進行基因集功能富集分析（GO MF、GO BP、GO CC；KEGG Pathway）。 繪制或下載基因集功能富集圖。 基因集韋恩圖分析。 基因集ID多元轉(zhuǎn)換。
	19:00-22:00	基因集相互作用分析	利用String在線工具（設(shè)置各項參數(shù)）獲得基因集相互作用結(jié)果。 mRNA-miRNA、miRNA-lncRNA、miRNA-circRNA、mRNA-circRNA相互作用分析。
1月12日	08:30-12:00	交互作用數(shù)據(jù)可視化	利用Cytoscape軟件進行基因注釋、分子間相互作用、基因集差異表達的可視化分析。 批量修改交互網(wǎng)絡(luò)的節(jié)點、邊、背景屬性。 利用Cytoscape App進行基因集交互網(wǎng)絡(luò)的GO富集分析、文本挖掘、關(guān)鍵/瓶頸基因及核心基因篩選。 高分辨率可視化結(jié)果的保存與輸出。
	13:30-16:00	共表達調(diào)控網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建	構(gòu)建基因集差異共表達Pathway/circRNA-mRNA-miRNA-lncRNA/circRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。 靶點基因分析策略。

具體事宜：

1. 培訓期間提供午餐、11日晚餐。住宿統(tǒng)一安排在合肥伯爵世家酒店（合肥站店），主辦單位可為學員代訂房間，標準間/單人間200元/間（含早餐），費用自理；學員也可自行上網(wǎng)預(yù)訂。住宿費發(fā)票在退房時由酒店開具。對于需要合住的學員，會務(wù)組將按報到先后順序安排，最后出現(xiàn)單人無法安排的情況，需要自補房間差價。
2. 上機實踐需自帶筆記本電腦（非上網(wǎng)本），會場將布置充足的電源插座。請確保電腦配置無線網(wǎng)卡（無線wifi覆蓋會場）。為提高上網(wǎng)效率，推薦自行攜帶4G無線上網(wǎng)卡或具有熱點共享功能的手機。操作系統(tǒng)為Win7/8/10 64位專業(yè)版（非任何商業(yè)版及Mac系統(tǒng)），辦公軟件為Office 2010以上專業(yè)版（非任何商業(yè)版及WPS Office），否則無法保證全部軟件順利安裝和使用。
3. 授課幻燈、軟件（附安裝指南）及上機實踐文檔已上傳至百度網(wǎng)盤，在報到通知中會告知鏈接及密碼。軟件請事先下載并安裝，如安裝有問題，請咨詢客服或開課當天到會場咨詢。
4. 嚴格按照培訓日程授課（共計22標準學時），第二天16:00結(jié)課，方便外地學員返程。

會議費用：

2019年12月20日前報名并繳費3200元/人，12月20日后3400元/人（5人及以上團體報名并實際報到另優(yōu)惠300元/人），授課期間發(fā)放紙質(zhì)邀請函（蓋章）和發(fā)票。
本次會議費委托合肥華斯泰生物醫(yī)學科技有限公司收取并統(tǒng)一提供會務(wù)發(fā)票。
1.網(wǎng)上匯款或銀行轉(zhuǎn)賬
戶　名：合肥華斯泰生物醫(yī)學科技有限公司
開戶行：中國銀行合肥臨泉路支行
帳　號：181246448304
2.支付寶賬號
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3.現(xiàn)場刷卡或現(xiàn)金
您也可以現(xiàn)場刷卡和支付現(xiàn)金�？梢运⒐珓�(wù)卡
注：匯款時請務(wù)必注明“生物數(shù)據(jù)”和學員姓名，匯款后將回單電子郵件發(fā)給我們，以便我們確認。

 

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聯(lián)系人：章老師
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