今年6月,徠卡共聚焦新產(chǎn)品STELLARIS在上海啟動(dòng)了國(guó)內(nèi)首秀,隨后開啟了其在全國(guó)多地的巡展。上市巡展還沒結(jié)束,STELLARIS用戶群中的首篇研究論文就已悄然成稿。該研究由法國(guó)巴斯德研究所的病毒學(xué)家Lisa A. Chakrabarti團(tuán)隊(duì)完成,聚焦在當(dāng)下全球熱點(diǎn)——SARS-CoV-2的致病機(jī)制。接下來(lái),我們就來(lái)聊聊這篇題為“SARS-CoV-2 infection damages airway motile cilia and impairs mucociliary clearance”的文章[1],順便看看作者用到了哪些STELLARIS共聚焦的拍攝“技能”。
研究概覽
SARS-CoV-2(嚴(yán)重急性呼吸綜合征冠狀病毒2, 又稱新型冠狀病毒或COVID-19)病毒的“爆發(fā)”無(wú)疑是2020年的頭號(hào)國(guó)際公共衛(wèi)生緊急事件。研究表明,SARS-CoV-2病毒比2002/03年的非典病毒(SARS-CoV-1)具有更高的有效傳播率,對(duì)人類健康構(gòu)成了重大威脅[2]。SARS-CoV-2感染早期階段上呼吸道上皮細(xì)胞中病毒的活躍復(fù)制是導(dǎo)致其高傳播率的主要原因之一[3]。對(duì)SARS-CoV-2患者的尸檢結(jié)果顯示,病毒主要在上下呼吸道上皮和肺泡中復(fù)制[4] 。
目前,我們對(duì)SARS-CoV-2感染影響上皮細(xì)胞功能的機(jī)制知之甚少。為了揭示SARS-CoV-2從上呼吸道向肺深部擴(kuò)散的致病機(jī)制,作者在人支氣管上皮體外重建模型中研究了SARS-CoV-2與其主要靶細(xì)胞的相互作用方式,分析了SARS-CoV-2感染引起細(xì)胞的超微結(jié)構(gòu)和功能變化。研究結(jié)果表明SARS-CoV-2感染早期會(huì)引發(fā)氣道上皮結(jié)構(gòu)中纖毛層(Ciliary layer)的破壞,致使纖毛運(yùn)動(dòng)能力減弱,導(dǎo)致黏膜纖毛(Mucociliary)局部清除障礙。局部纖毛的損傷可減緩病毒向咽部的運(yùn)輸,增加其進(jìn)入支氣管系統(tǒng)更深區(qū)域的幾率,直到進(jìn)一步感染肺泡并引發(fā)肺細(xì)胞的損傷。
呼吸道上皮
呼吸道上皮主要由3種細(xì)胞(杯狀細(xì)胞、纖毛細(xì)胞和基底細(xì)胞)組成(圖1),在機(jī)體抵御感染時(shí)發(fā)揮著關(guān)鍵的作用。其中,杯狀細(xì)胞(Goblet cells)可以分泌一種保護(hù)性黏液(mucus),能夠捕獲吸入的微粒(包括微生物)。而纖毛細(xì)胞(Ciliated cells)的數(shù)量最多,占上皮細(xì)胞的一半以上,因每個(gè)細(xì)胞頂端約有200根纖毛而得名。纖毛細(xì)胞頂端的纖毛以一種協(xié)調(diào)的方式有節(jié)奏地?cái)[動(dòng),導(dǎo)致其表面的黏液層持續(xù)地向喉咽方向移動(dòng),最終被吞咽[5]。這種黏液纖毛清除的機(jī)制能有效阻止吸入的微粒在肺部的積聚。基底細(xì)胞(basal cells)位于呼吸道上皮基底膜附近,在上皮損傷的刺激下可以增殖并分化為其他類型的上皮細(xì)胞。
圖1 呼吸道上皮模式圖
研究過(guò)程
研究圍繞SARS-CoV-2對(duì)呼吸道上皮的感染過(guò)程展開。作者選用人的呼吸道上皮體外重建模型(MucilAir™模型,EPITHELIX公司)進(jìn)行研究(圖2A)。支氣管上皮細(xì)胞在空氣/液體界面(ALI)分化了4周后,作者通過(guò)掃描電鏡確定了模型中支氣管上皮細(xì)胞分化為假?gòu)?fù)層上皮,包括杯狀細(xì)胞、纖毛細(xì)胞和基底細(xì)胞三種主要的細(xì)胞類型(圖2B)。隨后,作者用SARS-CoV-2病毒懸液(106pfu/mL)感染重建的上皮組織4小時(shí)并監(jiān)控病毒RNA、TCID50(半數(shù)組織培養(yǎng)感染劑量)、細(xì)胞緊密連接、TEER(跨上皮電阻)等指標(biāo),最終確認(rèn)從病毒感染到組織損傷后部分恢復(fù)病毒清除能力的時(shí)間窗口為7天(詳細(xì)結(jié)果見論文原稿)。
圖2 呼吸道上皮體外重建MucilAir™模型
A,模型示意圖;B,分化4周后透射電鏡檢測(cè)圖。
隨后,該STELLARIS出場(chǎng)了,作者檢測(cè)病毒感染的主要細(xì)胞為β-tubulin陽(yáng)性的纖毛細(xì)胞(圖3A)。利用共聚焦顯微鏡對(duì)假?gòu)?fù)層上皮的縱向掃描結(jié)果顯示SARS-CoV-2對(duì)纖毛上皮細(xì)胞有優(yōu)先的趨向性(圖3B)。隨后的電鏡結(jié)果也顯示SARS-CoV-2病毒對(duì)纖毛層有很強(qiáng)的破環(huán)作用(圖3E、F)。
圖3 SARS-CoV-2感染導(dǎo)致運(yùn)動(dòng)纖毛喪失
A,SARS-CoV-2感染后2天纖毛層共聚焦檢測(cè)結(jié)果(β-tubulin標(biāo)記纖毛細(xì)胞,spike標(biāo)記病毒顆粒);B,SARS-CoV-2感染后4天假?gòu)?fù)層上皮共聚焦XZY掃描結(jié)果(Cytokeratin-5標(biāo)記基底細(xì)胞);E & F,掃描電鏡圖像。
為了進(jìn)一步確認(rèn)SARS-CoV-2病毒破壞纖毛的機(jī)制,作者通過(guò)共聚焦進(jìn)行了感染前后纖毛微管遠(yuǎn)端/近端峰值比率的測(cè)定(圖4A、B)。結(jié)果顯示,SARS-CoV-2病毒感染兩天后纖毛通常呈現(xiàn)出縮短和畸形,其微管信號(hào)的遠(yuǎn)端/近端峰值比顯著低于未感染的細(xì)胞。透射電鏡的結(jié)果顯示,SARS-CoV-2感染通過(guò)誘導(dǎo)軸突(Axoneme)的丟失和基底小體(Basal body)錯(cuò)位破壞原有的纖毛結(jié)構(gòu)(圖4E-H)。
圖4 SARS-CoV-2感染導(dǎo)致纖毛結(jié)構(gòu)破壞
A,纖毛層共聚焦XZY模式圖像和熒光定量分析結(jié)果(β-tubulin標(biāo)記纖毛細(xì)胞,spike標(biāo)記病毒顆粒);B,纖毛β-tubulin遠(yuǎn)端/近端峰值比統(tǒng)計(jì)圖;E-H,透射電鏡圖像(其中bb: basal body; ax: axoneme; rt: rootlet; vp: viral particles; lp: large particle)。
接下來(lái),作者用時(shí)間序列拍攝檢測(cè)SARS-CoV-2感染對(duì)上皮體外重建模型微粒清除能力的影響(圖5A、B)。結(jié)果顯示,SARS-CoV-2感染不僅影響纖毛擺動(dòng)的方向(圖5C、D)和速度(圖5E),還影響纖毛擺動(dòng)的協(xié)調(diào)性(圖5F,徑直度)。換句話說(shuō),SARS-CoV-2感染導(dǎo)致的纖毛損傷能顯著降低呼吸道上皮的黏膜纖毛清除能力。
圖5 SARS-CoV-2感染導(dǎo)致纖毛喪失黏膜纖毛清除能力
微球在纖毛層運(yùn)動(dòng)軌跡圖(A & B)、方向和幅度分析圖(C & D)、平均速度統(tǒng)計(jì)圖(E)以及徑直度統(tǒng)計(jì)圖(F)。
最后,作者在體外(上皮重建模型)和體內(nèi)(金黃色敘利亞倉(cāng)鼠模型)研究中對(duì)SARS-CoV-2感染后的呼吸道應(yīng)激修復(fù)能力進(jìn)行檢測(cè)。結(jié)果顯示,感染7天后上皮重建模型中基底細(xì)胞的密度增加,部分向纖毛細(xì)胞轉(zhuǎn)變(圖6A-C),培養(yǎng)體系內(nèi)IFN表達(dá)水平上升(結(jié)果見論文原稿)。說(shuō)明SARS-CoV-2感染可觸發(fā)上皮防御和修復(fù)機(jī)制。在金黃色敘利亞倉(cāng)鼠模型中,基底細(xì)胞的形態(tài)轉(zhuǎn)變則跟SARS-CoV-2感染時(shí)病毒的計(jì)量正相關(guān)(圖6E)。至此,作者根據(jù)研究得到的結(jié)論和已有研究成果推定:SARS-CoV-2感染后固有的上皮防御和修復(fù)機(jī)制可能發(fā)生得太晚,來(lái)不及阻止病毒在呼吸樹(Respiratory tree)中的傳播和繼發(fā)性感染的發(fā)生。
圖6 SARS-CoV-2感染后基底細(xì)胞參與上皮組織損傷修復(fù)
A,SARS-CoV-2感染后7天假?gòu)?fù)層上皮共聚焦XZY掃描結(jié)果(β-tubulin標(biāo)記纖毛細(xì)胞,spike標(biāo)記病毒顆粒Cytokeratin-5標(biāo)記基底細(xì)胞);B & C,沿Z軸定量細(xì)胞角蛋白-5密度分布和統(tǒng)計(jì)圖;E,金黃色敘利亞倉(cāng)鼠氣管組織共聚焦圖像(感染后4天)。
STELLARIS“技能”盤點(diǎn)
下面我們來(lái)盤點(diǎn)一下研究過(guò)程中作者用到了STELLARIS的哪些技能:
XZY(正交視圖)模式。坐頭把交椅的就是XZY拍攝模式,即正交視圖(orthogonal view)拍攝模式。作者要呈現(xiàn)支氣管上皮組織中三種細(xì)胞的分布情況,而XZY模式下能采集得到樣本正交視圖(XZ方向的圖像)。所以,文中幾個(gè)關(guān)鍵的圖像數(shù)據(jù)作者給出的都是XZ圖像。另外,在STELLARIS上,我們可以很方便的利用XZY模式實(shí)現(xiàn)樣品焦平面的精確定位。
多色高清圖像采集。同時(shí)將微管蛋白、病毒顆粒、角蛋白和細(xì)胞核在一張圖片上展示,讓讀者直觀看到3種細(xì)胞的位置分布,作者就是應(yīng)用了共聚焦的多色成像能力。而STELLARIS的多色成像能力遠(yuǎn)不止于此。機(jī)器標(biāo)配的HyDS高靈敏檢測(cè)器,檢測(cè)范圍覆蓋410-850 nm發(fā)射光波段,在傳統(tǒng)的4色檢測(cè)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)上,可以輕松擴(kuò)展到6色。而雙重制冷的加持更是讓HyDS檢測(cè)器能輕松應(yīng)對(duì)超分辨率高清成像的需求。配合STELLARIS標(biāo)配的Lightning超分辨模塊,能幫助我們實(shí)現(xiàn)XY方向120nm、Z方向200nm的多色超高分辨率成像。
XYT(時(shí)間序列)模式。在STELLARIS上也能輕松追蹤細(xì)胞、囊泡或顆粒的運(yùn)動(dòng)軌跡。用戶不僅能通過(guò)圖像分析功能得到運(yùn)動(dòng)軌跡圖,還可以通過(guò)DSE(動(dòng)態(tài)信號(hào)強(qiáng)化)技術(shù)得到信噪比和清晰度好的圖像。
Navigator(導(dǎo)航式拼圖)模塊。想在展現(xiàn)樣本全貌圖像的同時(shí)得到清晰的單個(gè)視野圖像?Navigator了解一下。集拼圖拍攝和圖像無(wú)縫拼接于一身,微觀到宏觀一覽無(wú)余。配備FocusMap功能,拍攝范圍再大都不“失焦”。
雖然文中沒有用到,但不能不提STELLARIS的獨(dú)門“技能”——TauSence模塊[6]。在徠卡多個(gè)專利技術(shù)的加持下,STELLARIS成功實(shí)現(xiàn)將熒光壽命維度引入共聚焦成像平臺(tái)。與傳統(tǒng)共聚焦相比,STELLARIS能幫助您多一個(gè)維度獲得樣品圖像、輕松避免串色、進(jìn)一步擴(kuò)展多色實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)(基于熒光壽命)、實(shí)現(xiàn)樣品組分拆分……優(yōu)點(diǎn)實(shí)在太多(詳細(xì)資料敬請(qǐng)回顧徠卡顯微系統(tǒng)公眾號(hào)往期文章)。
結(jié)語(yǔ)
應(yīng)用STELLARIS的研究論文秀才剛剛拉開帷幕,后面STELLARIS會(huì)為大家展示更加豐富的成像“技能”,幫助用戶“Get Closer to the Truth”!徠卡STELLARIS共聚焦顯鏡接下來(lái)還會(huì)繼續(xù)舉辦全國(guó)范圍內(nèi)的上市巡展,歡迎大家前來(lái)體驗(yàn)STELLARIS的“十八般武藝”。
參考文獻(xiàn):
[1] Rémy Robinot, Mathieu Hubert, Guilherme Dias de Melo, Françoise Lazarini, Timothée Bruel, Nikaïa Smith, Sylvain Levallois, Florence Larrous, Julien Fernandes, Stacy Gellenoncourt, et al. (2020). SARS-CoV-2 infection damages airway motile cilia and impairs mucociliary clearance. BioRxiv.
[2] Petersen, E., Koopmans, M., Go, U., Hamer, D.H., Petrosillo, N., Castelli, F., Storgaard, M., Al Khalili, S., and Simonsen, L. (2020). Comparing SARS-CoV-2 with SARS-CoV and influenza pandemics. Lancet Infect Dis.
[3] Zou, L., Ruan, F., Huang, M., Liang, L., Huang, H., Hong, Z., Yu, J., Kang, M., Song, Y., Xia, J., et al. (2020). SARS-CoV-2 Viral Load in Upper Respiratory Specimens of Infected Patients. N Engl J Med 382, 1177-1179.
[4] Hou, Y.J., Okuda, K., Edwards, C.E., Martinez, D.R., Asakura, T., Dinnon, K.H., 3rd, Kato, T., Lee, R.E., Yount, B.L., Mascenik, T.M., et al. (2020). SARS-CoV-2 Reverse Genetics Reveals a Variable Infection Gradient in the Respiratory Tract. Cell.
[5] Spassky, N., and Meunier, A. (2017). The development and functions of multiciliated epithelia. Nat Rev Mol Cell Biol 18, 423-436.
[6] Application Note. (2020). TauSense: a fluorescence lifetime-based tool set for everyday imaging. Nat Method.