CUT&Tag Assay Kit
由普瑞麥迪-研發(fā)團(tuán)隊(duì)推出的CUT&Tag assay kit,完美的解決了ChIP-Seq給您帶來的這些苦惱,成為ChIP-Seq的完美替身!
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CUT&Tag簡(jiǎn)介
CUT&Tag是針對(duì)ChIP-Seq的局限性而創(chuàng)建的研究基因組中組蛋白修飾以及染色質(zhì)結(jié)合蛋白和DNA相互作用的高效新技術(shù)。盡管與ChIP-Seq原理相似,CUT&Tag可以在新鮮細(xì)胞原生的狀態(tài)下,利用Tn5轉(zhuǎn)座酶復(fù)合體轉(zhuǎn)座的特性在獲取片段化DNA的同時(shí)完成了末端添加建庫(kù)測(cè)序所需的擴(kuò)增引物及條形碼序列。它具備了操作簡(jiǎn)單快速 (1-2天可完成建庫(kù)),無需交聯(lián)固定和超聲片段化,起始細(xì)胞數(shù)少(通常至少降低十倍以上),測(cè)序量和成本大大減少(通常降低五到十倍以上),信噪比好,重復(fù)性高等優(yōu)勢(shì)。在表觀遺傳和基因調(diào)控等方面有及其重要的意義!
實(shí)驗(yàn)流程
首先ConA beads(Concanavalin A-coated magnetic beads)與細(xì)胞膜或核膜相結(jié)合,隨后通過穿孔劑對(duì)細(xì)胞進(jìn)行穿孔處理,改變其通透性,依次加入和靶蛋白相對(duì)應(yīng)的一抗、二抗和pA-Tn5 Transposase進(jìn)行孵育,再通過Mg2+激活Tn5酶,Tn5酶在激活的狀態(tài)下會(huì)定向切割靶蛋白對(duì)應(yīng)的DNA片段,同時(shí)在切割的DNA兩端加上文庫(kù)擴(kuò)增的序列接頭,以便于直接對(duì)回收的DNA片段進(jìn)行PCR建庫(kù)。隨后文庫(kù)質(zhì)量檢測(cè)合格后,便可直接上機(jī)測(cè)序。
我們的優(yōu)勢(shì)
√細(xì)胞起始量較低(單細(xì)胞-5*105),從百萬級(jí)降低到單細(xì)胞水平
√結(jié)果重復(fù)性較高,且信噪比較高
√把繁瑣的ChIP流程縮短至1-2天的時(shí)間
√操作流程簡(jiǎn)單,無需甲醛交聯(lián)、細(xì)胞破碎和超聲片段化DNA
√簡(jiǎn)化了文庫(kù)構(gòu)建流程,在轉(zhuǎn)座子上添加了‘接頭’,只需要簡(jiǎn)單的PCR即可獲得高質(zhì)量NGS文庫(kù)
√與ChIP相比,測(cè)序深度減少10倍左右
H3K4me1抗體的CUT&Tag數(shù)據(jù)顯示,與IgG對(duì)照組相比,H3K4me1 CUT&Tag檢測(cè)到了H3K4me1的信號(hào)峰,且信噪比較高。