最近感覺被導師針對了
發(fā)郵件不回……
發(fā)微信不回……
實驗室里碰到……
我說「老師早」,他回「嗯哼」
上一次聯(lián)系導師,是由于自己的課題需要訂購一批基因敲除小鼠,金額老大了。為了不出差錯,實驗設(shè)計了一兩周,提交小鼠訂購清單前發(fā)郵件征詢導師的同意,但一個禮拜過去了,他還沒回復。導師(nanren)的心海底針,我決定與他當面對峙。
老師,我那個課題用的基因敲除小鼠可以下單嗎?
那你說為什么訂的KO小鼠,不是說訂CKO小鼠嗎?
這兩種小鼠有區(qū)別嗎?應該沒啥影響吧。
你有依據(jù)嗎?最基本的文獻都不看,就隨便訂小鼠?按這樣這個課題申請下來的國自然都支撐不了你發(fā)一篇論文。你研究的是胚胎致死性基因,不能用KO小鼠。CKO小鼠模型可以提供時空特異性的基因敲除,可以提供細節(jié)更豐富、證據(jù)更確鑿的研究數(shù)據(jù)。沒想清楚之前別找我要錢!
本以為實驗設(shè)計很充分了,結(jié)果是小鼠選錯了。可是KO還是CKO小鼠?確實從一開始就沒注意這個問題。查了文獻資料,才了解到KO和CKO小鼠,二者在成本、制作周期、建系難度上都有著不小的差別。那到底該如何選擇呢?
全身性基因敲除KO
全身性基因敲除KO(Knockout),是指在小鼠所有組織細胞中,將靶基因的某些重要外顯子或功能結(jié)構(gòu)域、甚至所有外顯子敲除掉,導致靶基因的表達缺失。
優(yōu)勢:
1、小鼠模型構(gòu)建周期短;
2、交配流程簡單。
劣勢:
1、大約有1/3的基因純合敲除后會導致小鼠胚胎期死亡或出生期死亡;
2、引發(fā)其它基因的代償,導致基因敲除后沒有明顯表型改變。
主要應用:
研究目的基因?qū)θ砩砘虿±淼墓δ堋?/span>
條件性基因敲除CKO
條件性基因敲除CKO(Conditional Knockout),將某個基因的修飾限制于小鼠某些特定類型的細胞或發(fā)育的某一特定階段,實現(xiàn)對小鼠基因組的時空特異性修飾。
優(yōu)勢:
1、多功能的基因敲除模型,可與不同工具鼠靈活搭配使用,客觀而系統(tǒng)地研究目的基因;
2、基因在不同組織器官發(fā)生、發(fā)育或疾病發(fā)生、治療過程中的作用與機制;
3、克服了重要基因完全敲除后的胚胎致死或過早死亡。
劣勢:
1、交配流程較為復雜;
2、小鼠模型構(gòu)建周期相對較長。
主要應用:
1、胚胎致死性基因的研究;
2、研究靶基因在特定組織或細胞中的功能;
3、研究靶基因在特定時期或階段發(fā)揮的作用。
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