賽業(yè)生物618福利來襲,含全基因組敲除細胞構(gòu)建計劃
瀏覽次數(shù):826 發(fā)布日期:2023-5-30
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今天是第七個全國科技工作者日(5月30日),神舟十六號也于上午發(fā)射升空,開啟探索太空新征程。聽說此前神十六發(fā)布會間隙,作為乘組成員之一的桂海潮還不忘cue自己的學(xué)生交論文,對此,有網(wǎng)友戲稱“天地連線開組會安排上了!”
如果導(dǎo)師出差還要堅持開組會,屏幕前的你會不會也為這樣的師生情所感動(這里要不要加個狗頭emoji)然后開始瘋狂趕實驗進度,手里的細胞挑得飛起,以免導(dǎo)師出其不意問上一句“基因該敲的都敲完了吧?”
文末互動福利:留言「我與KO細胞的那些事」相關(guān)內(nèi)容,即有機會獲得獎品哦
說起基因敲除,很多小伙伴大概總是為課題的這個問題那個問題發(fā)愁。眼看年中將近,我們貼心為大家準備了一系列專場活動,本期放出的618分會場第一波福利中,除互動禮品外,還有熱門活動「全基因組敲除細胞構(gòu)建計劃」,交付單克隆純合子,低至6980元,掃碼即可快速查詢!
KO細胞的常見問題解答
Q1: 基因敲除的sgRNA如何設(shè)計?
Q2: 如何避免脫靶效應(yīng)?
Q3:CRISPR-Cas9系統(tǒng)的活性檢測方法有哪些?
通常我們都是采用各個設(shè)計網(wǎng)站預(yù)測,得到我們的gRNA,那如何能夠快速、準確的驗證CRISPR-Cas9系統(tǒng)是否能發(fā)揮作用呢?
- 熒光活性檢測法。在Cas9和gRNA的作用下,靶點位置的雙鏈DNA會被切割形成DSB,細胞通過同源重組形成有活性的熒光蛋白,可通過流式細胞儀來檢測熒光強度是否增強,以此來判斷Cas9及gRNA的活性及敲除效率。
- 錯配酶法。對修飾后的靶序列進行PCR擴增過程中,會形成含有錯配的DNA雙鏈,將經(jīng)過錯配酶切割后的產(chǎn)物進行凝膠電泳,檢測CRISPR-Cas9系統(tǒng)的切割活性。
- 套峰檢測法。對修飾后的靶序列進行PCR并測序,通過分析Spacer區(qū)域套峰情況來分析CRISPR-Cas9系統(tǒng)的活性。
Q4:實現(xiàn)基因功能缺失,我要做敲低(RNAi)還是敲除?
- 當(dāng)敲除可能會導(dǎo)致細胞增殖非常緩慢或停止生長,或在細胞轉(zhuǎn)染后的cell pool階段檢測效率呈顯著下降趨勢,即可判定可能出現(xiàn)敲除致死的情況,建議用RNAi。
- 由于存在部分強功能蛋白,即使表達下調(diào)了,仍然有較強的功能,如果RNAi始終做不出表型,但從有關(guān)信息推測這個基因很大可能性會出表型,建議做KO;另外,研究的目的基因處于非轉(zhuǎn)錄區(qū)域,或者目的基因有很強的轉(zhuǎn)錄效率,也是無法用RNAi進行有效干擾的,則建議做KO,且KO細胞更適合進行回補實驗。
- 最后,敲低跟敲除不是二選一的關(guān)系。當(dāng)我們用RNAi做了基因敲低,觀察到細胞表型的變化后,仍然可以進一步做敲除,讓實驗結(jié)論更加有說服性。
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