百蓁參加杭州第六屆PEAKS蛋白質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班
瀏覽次數(shù):1747 發(fā)布日期:2023-6-16
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6月9日,由Bioinformatics Solutions Inc.與中國質(zhì)譜學(xué)術(shù)大會組委會聯(lián)合舉辦的“第六屆PEAKS蛋白質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班”在杭州太虛湖假日酒店成功舉辦,來自55家的企業(yè)和學(xué)術(shù)單位的150多位學(xué)員參加了本屆培訓(xùn)班。
非常感謝大會組委會的大力支持與關(guān)心,中國質(zhì)譜四十載芳華,充滿活力全新起航,再次祝賀2020 – 2023年中國質(zhì)譜學(xué)術(shù)大會取得圓滿成功!
本次培訓(xùn)首先由Bioinformatics Solutions Inc. CEO單寶珍博士致開幕詞,介紹并感謝特邀嘉賓的到來,同時對各位參加人員的支持表示感謝,最后也對培訓(xùn)的日程及內(nèi)容作了簡介介紹。
Section 1
在這一天課程安排緊湊且干貨滿滿的培訓(xùn)過程中,PEAKS團隊以及特邀嘉賓們?yōu)榇蠹規(guī)砹司实姆窒。首先由BSI產(chǎn)品經(jīng)理李文婷為大家?guī)鞵EAKS軟件概覽和基于深度學(xué)習(xí)的肽段鑒定方法的報告分享。深度學(xué)習(xí)可以自動從數(shù)據(jù)中學(xué)習(xí)特征和模式,而無需人工歸納總結(jié)。因此,深度學(xué)習(xí)特別適合于擁有 大型復(fù)雜數(shù)據(jù)集的科學(xué)領(lǐng)域。特別是基于質(zhì)譜(MS)的蛋白質(zhì)組學(xué)中越來越重要。過去10年,深度學(xué)習(xí)是一個發(fā)展非常迅速的領(lǐng)域,促進了數(shù)據(jù)分析的多方面,包括數(shù)據(jù)采集的設(shè)計,feature的選擇,二級譜的鑒定等方面的快速提升。
Section 2
BSI算法工程師邊海博為大家?guī)鞸tream-lined DIA 數(shù)據(jù)分析全流程的分享,從算法的角度為大家展示了DIA數(shù)據(jù)處理的底層邏輯。
Section 3
張耀陽研究員臨時未能來到培訓(xùn)班現(xiàn)場,張老師在線為大家?guī)怼痘诘鞍踪|(zhì)組學(xué)的藥物靶標發(fā)現(xiàn)及作用機制研究》的報告,分享了他們組近期的一些小分子藥物靶標研究新進展。雖未到場,大家對張老師的報告期待已久,熱度不減呢!
Section 4
葉慧教授課題組的皖寧博士報告為特征離子挖掘蛋白組乳;揎棧瑥囊压_的數(shù)據(jù)中評價了乳;瘍煞N特征離子的特異性和顯著性,分別做了不同水平的驗證分析。PEAKS團隊為葉老師提出的統(tǒng)計需求特意定制化了一個版本,而現(xiàn)在confident PTM新功能也加入到了PEAKS軟件中。
Section 5
下午的培訓(xùn)開始前,學(xué)員們的熱情依然高漲,很早便進入會場等待。下午第一場是由PEAKS帶給大家的《翻譯后修飾以及糖基化》,具體展開了對于PTM翻譯后修飾全新的算法優(yōu)化,從翻譯后種類,修飾位點和特征離子三個水平如何評價一個修飾是否可信,此外對于糖基化修飾的全景表征也提出了在新的GlycanFinder 中具體的方案和應(yīng)用。
Section 6
單寶珍博士接著對蛋白質(zhì)組相對定量的算法基本原理和優(yōu)化做了詳細的介紹,特別是在整體蛋白組實驗、數(shù)據(jù)采集、結(jié)果分析和靶向肽段4個水平的質(zhì)控,PEAKS也提供了完整的解決方案,現(xiàn)在已經(jīng)整合在了PEAKS分析工作流中,以QC節(jié)點部分展示各個指標的統(tǒng)計信息。
此外,單博還介紹了PEAKS如何運用從頭測序技術(shù)實現(xiàn)免疫肽組數(shù)據(jù)分析,并通過2020年初我們使用質(zhì)譜從頭測序方法篩選新冠中和抗體的實際多抗發(fā)現(xiàn)案例,來說明PEAKS蛋白水平的從頭測序整體解決方案。
Section 7
來自北京生命科學(xué)研究所的董夢秋研究員和曹勇博士,為大家分享了他們組在交聯(lián)質(zhì)譜分析中的詳細工作,特別是在實驗部分,交聯(lián)劑的選擇,數(shù)據(jù)分析的挑戰(zhàn)等方面為大家做了詳細的展開。
培訓(xùn)過程中,每位學(xué)員都專注聚精會神地聆聽,精彩部分還不忘拿出手機、手提電腦或是筆記本等各種工具進行記錄,同時,學(xué)員們也積極提問,培訓(xùn)老師們也都認真給予解答,現(xiàn)場關(guān)于專業(yè)知識的交流互動融洽且精彩。
培訓(xùn)結(jié)束后學(xué)員們?nèi)詿崆椴粶p,抓住機會與培訓(xùn)老師私下探討相關(guān)問題,最后,本次培訓(xùn)班在大家真誠的感謝和告別聲中落下帷幕。
PEAKS團隊十分感謝大家的積極參與,通過本次培訓(xùn)班平臺提供的寶貴線下交流機會,讓我們能夠快速地收集用戶在PEAKS使用中的問題和需求,讓我們共同推進PEAKS軟件的開發(fā)和進步。如果您遺憾錯過這次培訓(xùn)班,或想進一步回顧嘉賓們的精彩分享,請持續(xù)關(guān)注我們,后續(xù)將奉上培訓(xùn)期間BSI團隊的培訓(xùn)視頻回放,千萬不要錯過哦~
2020-2023年中國質(zhì)譜學(xué)術(shù)大會
《2020-2023年中國質(zhì)譜學(xué)術(shù)大會》于2023年6月9-13日在杭州太虛湖假日酒店成功舉辦,本次大會是中國質(zhì)譜界的又一次盛會,旨在促進學(xué)界團結(jié)進步、和諧發(fā)展、共贏未來,提高學(xué)術(shù)交流水平,推動質(zhì)譜技術(shù)在各大科技領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用。本次大會將邀請國內(nèi)外質(zhì)譜領(lǐng)域的著名學(xué)者出席,BSI中國分公司百蓁生物的首席科學(xué)官/副總裁彭超博士應(yīng)邀于12日做題為《整合型前沿質(zhì)譜技術(shù)在生命科學(xué)與藥物研發(fā)中的應(yīng)用》,彭博士以lip-MS,HDX-MS和新抗原發(fā)現(xiàn)三個熱點為綱要,詳細介紹了整合型質(zhì)譜技術(shù)在小分子藥物和靶蛋白結(jié)合位點分析,藥物靶點發(fā)現(xiàn),蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)表征、抗體抗原表位分析以及腫瘤新抗原和免疫治療等的應(yīng)用,并結(jié)合了下游數(shù)據(jù)分析,為大家展開了完整的研究思路。
最后感謝《2020-2023年中國質(zhì)譜學(xué)術(shù)大會》提供一個展示我國在質(zhì)譜及相關(guān)領(lǐng)域的最新研究進展和成果,增進廣大質(zhì)譜科學(xué)工作者及質(zhì)譜相關(guān)從業(yè)人員間的交流和合作平臺,預(yù)祝大會圓滿成功!
如果您想深入了解更多關(guān)于培訓(xùn)班內(nèi)容,歡迎點擊下方鏈接查看培訓(xùn)視頻直播回放!
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