在線講座報(bào)名：劍橋晶體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)中心CCDC系列課程

系列講座主題：
主題一：利用海量晶體數(shù)據(jù)賦能分子設(shè)計(jì)
主題二：分子對接軟件GOLD特點(diǎn)及使用案例
主題三：結(jié)合Mogul和Gaussian量化計(jì)算進(jìn)行分子優(yōu)化
 

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一、利用海量晶體數(shù)據(jù)賦能分子設(shè)計(jì)

時間：10月19日（周四）下午15:00-16:00

CSD是由CCDC（劍橋晶體數(shù)據(jù)中心）維護(hù)的目前全球最大的小分子晶體數(shù)據(jù)庫，目前CSD已經(jīng)包含超過125萬個小分子的晶體結(jié)構(gòu)。本次研討會我們將探索如何利用這些海量的數(shù)據(jù)并轉(zhuǎn)化為對藥物發(fā)現(xiàn)有用的知識信息以及軟件工具，從而助力藥物設(shè)計(jì)。

本次研討會將重點(diǎn)向您介紹兩個工具，展示如何從CSD的海量數(shù)據(jù)中獲得知識和見解，并應(yīng)用這些知識和見解幫助藥物設(shè)計(jì)：

♦ 構(gòu)象驗(yàn)證：通過將分子構(gòu)象與已知的經(jīng)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行比較，驗(yàn)證您的目標(biāo)化合物構(gòu)象的合理性。Mogul是一個CCDC組件，利用CSD作為知識庫，用于分子構(gòu)象的確證和優(yōu)化。

♦ 理解相互作用：使用完整的相互作用圖（FIMs）來預(yù)測分子內(nèi)和分子間的相互作用。FIMs允許您生成一個3D相互作用圖，它包圍著一個分子，并表示與某些官能團(tuán)發(fā)生相互作用的概率較高的區(qū)域。

二、分子對接軟件GOLD特點(diǎn)及使用案例

時間：10月26日（周四）下午15:00-16:00 

GOLD是由CCDC開發(fā)的一款被廣泛使用分子對接軟件，其依靠CSD海量的小分子晶體數(shù)據(jù)使得GOLD在對接時的小分子構(gòu)象生成、分子間相互作用理解等方面有獨(dú)有的優(yōu)勢。本次研討會我們將探討GOLD的特點(diǎn)和相應(yīng)的成功案例，包括水分子介導(dǎo)的對接、蛋白柔性對接等。

本次研討會我們將探討GOLD的特點(diǎn)和相應(yīng)的成功案例，包括水分子介導(dǎo)的對接、蛋白柔性對接等。

三、結(jié)合Mogul和Gaussian量化計(jì)算進(jìn)行分子優(yōu)化

時間：11月2日（周四）下午15:00-16:00 

Mogul是CCDC用于小分子構(gòu)象分析和確證的強(qiáng)大工具，應(yīng)用Mogul可以快速探索您感興趣的分子構(gòu)象或局部構(gòu)象在真實(shí)晶體世界中的分布情況。Mogul是基于已有真實(shí)晶體數(shù)據(jù)的知識總結(jié)和提煉，特點(diǎn)是快速而準(zhǔn)確。

Gaussian是權(quán)威的量子化學(xué)計(jì)算軟件包，可以基于量子力學(xué)原理精確計(jì)算分子的各項(xiàng)性質(zhì)包括優(yōu)勢構(gòu)象的探索、構(gòu)象能的計(jì)算、扭轉(zhuǎn)能的計(jì)算、二面角的搜索等等。Gaussian計(jì)算相對比較耗時但是準(zhǔn)確。

本次講座我們結(jié)合Mogul和Gaussian進(jìn)行分子構(gòu)象的分析和精確的扭轉(zhuǎn)能計(jì)算以輔助進(jìn)行分子優(yōu)化。