English | 中文版 | 手機(jī)版 企業(yè)登錄 | 個(gè)人登錄 | 郵件訂閱
當(dāng)前位置 > 首頁(yè) > 行業(yè)資訊 > 新聞 > txyz.ai助力EAD:SCIEX發(fā)布AI釋讀7600系統(tǒng)新應(yīng)用案例

txyz.ai助力EAD:SCIEX發(fā)布AI釋讀7600系統(tǒng)新應(yīng)用案例

瀏覽次數(shù)：2456　發(fā)布日期：2023-11-17　 來(lái)源：SCIEX
SCIEX高分辨質(zhì)譜 ZenoTOF® 7600 系統(tǒng)自2021年發(fā)布以來(lái)，各種學(xué)科的科學(xué)家利用其新型的電子活化解離(Electron Activated Dissociation, EAD)技術(shù)結(jié)合Molecule Profiler和Biologics Explorer等數(shù)據(jù)處理軟件，在生物藥、脂質(zhì)分子，代謝組學(xué)、脂質(zhì)生物標(biāo)志物等方面促進(jìn)了科學(xué)研究。尤其在分子結(jié)構(gòu)解析、糖苷類(lèi)代謝位點(diǎn)確證、脂質(zhì)分子中雙鍵的定位，離子型脂質(zhì)降解產(chǎn)物的鑒定等應(yīng)用方向，提供了非�？煽康母叻直尜|(zhì)譜數(shù)據(jù)。我們精選了4篇新進(jìn)EAD應(yīng)用案例，論文原文語(yǔ)言為英文，共計(jì)22頁(yè)。近日，該內(nèi)容經(jīng)匯總正式上線，可免費(fèi)下載。
 
 
想了解EAD的新進(jìn)應(yīng)用，難道必須要讀完22頁(yè)英文論文？這需要花費(fèi)不少的時(shí)間和精力。
遇事不決，可問(wèn)txyz.ai和SCIEX。介紹一個(gè)好用的讀學(xué)術(shù)內(nèi)容的工具(txyz.ai)，可以直接在瀏覽器輸入txyz.ai登陸。我們用AI釋讀這4篇應(yīng)用案例，然后，又請(qǐng)了 SCIEX專(zhuān)家從質(zhì)譜和軟件的角度釋讀案例。只把簡(jiǎn)潔的精華技術(shù)內(nèi)容呈現(xiàn)給您。
 
掃描二維碼，下載新進(jìn)EAD應(yīng)用案例
圖片
 
應(yīng)用案例1. 
抗體藥物偶聯(lián)物(ADC)抗體比(DAR)測(cè)定
SCIEX專(zhuān)家從質(zhì)譜和軟件的角度釋讀
圖片
 
使用ZenoTOF 7600 系統(tǒng)對(duì)恩美曲妥珠單抗 (T-DM1) 的糖基化和去糖基化形式進(jìn)行了表征，然后使用Biologics Explorer軟件進(jìn)行了自動(dòng)數(shù)據(jù)分析 (上圖)，從而實(shí)現(xiàn)了精確的DAR測(cè)量。糖基化 (天然) 和去糖基化形式的曲妥珠單抗 (T-DM1) 的平均DAR值分別為3.6和3.5。糖基化T-DM1的MS譜由不同的質(zhì)荷比組成，主要是G0F、G1F和G2F 與多達(dá)8個(gè)有效質(zhì)荷比DM1偶聯(lián)分子，去除N連接的糖基化則有更簡(jiǎn)單的MS譜，其中檢測(cè)到去糖基化的T-DM1攜帶多達(dá)8個(gè)DM1。
 
利用ZenoTOF 7600 系統(tǒng)的EAD功能，進(jìn)行精確的完整質(zhì)量測(cè)量和由Biologics Explorer軟件提供的自動(dòng)數(shù)據(jù)注釋?zhuān)煽焖龠M(jìn)行蛋白質(zhì)鑒定和DAR測(cè)定。
 
AI釋讀
這篇論文介紹了使用LC-MS分析完整的糖基化和去糖基化ADC樣品的過(guò)程。研究使用Waters ACQUITY BEH C4柱和Exion LC AD系統(tǒng)對(duì)樣品進(jìn)行分離，LC運(yùn)行的流速為0.3毫升/分鐘，柱溫保持在60攝氏度。質(zhì)譜分析使用ZenoTOF 7600 系統(tǒng)進(jìn)行，數(shù)據(jù)處理則使用Biologics Explorer軟件。研究結(jié)果顯示，通過(guò)這種組合可以準(zhǔn)確測(cè)量和自動(dòng)解釋完整ADC的分析數(shù)據(jù)。對(duì)T-DM1的糖基化和去糖基化形式進(jìn)行了DAR值測(cè)定，分別為3.6%和3.5%。研究還指出Biologics Explorer軟件提供了簡(jiǎn)化的工作流程，可用于確定ADC的藥物-抗體比（DAR）。總體而言，該研究展示了使用LC-MS和Biologics Explorer軟件進(jìn)行完整ADC分析的可行性和有效性。
 
 
應(yīng)用案例2. 
離子型脂質(zhì)納米顆粒DODAP及其降解產(chǎn)物的自動(dòng)表征  
SCIEX專(zhuān)家從質(zhì)譜和軟件的角度釋讀
 
本工作展示了離子型脂質(zhì)體1,2-二磺酰-3-三甲基銨丙烷 (DODAP) 在降解和氧化過(guò)程中的綜合表征。EAD產(chǎn)生大量的診斷離子，這些離子在單電荷脂質(zhì)的碰撞誘導(dǎo)解離 (CID) 模式下，呈現(xiàn)得并不好，但對(duì)結(jié)構(gòu)注釋很重要。Molecule Profiler軟件通過(guò)自動(dòng)注釋信息豐富的基于EAD的MS/MS數(shù)據(jù)，提供結(jié)構(gòu)解析。這個(gè)工作流程有助于理解在脂質(zhì)納米顆粒 (LNP) 配方中使用的離子型脂質(zhì)的降解規(guī)律。
 
 
Molecule Profiler軟件顯示DODAP降解物結(jié)構(gòu)表征。圖A顯示了m/z 384.3的EAD MS/MS譜圖，展示了高置信度的鑒定和結(jié)構(gòu)解析。當(dāng)一個(gè)峰被分配給一個(gè)選擇的的結(jié)構(gòu)或分子式時(shí)，該峰值將以淺藍(lán)色顯示。圖B顯示了圖A中給出的質(zhì)譜對(duì)應(yīng)的結(jié)構(gòu)。圖C顯示了與圖B中匹配的結(jié)構(gòu)相對(duì)應(yīng)的已選碎片離子列表。
 
EAD技術(shù)生成豐富的MS/MS數(shù)據(jù)，對(duì)DODAP、氧化形式及其降解物進(jìn)行了可靠的鑒定，具有優(yōu)異的質(zhì)量精度，Molecule Profiler軟件加快了自動(dòng)識(shí)別、確定結(jié)構(gòu)和相對(duì)定量DODAP及其相關(guān)雜質(zhì)的過(guò)程。
 
AI釋讀
這篇論文介紹了使用ZenoTOF 7600 系統(tǒng)和Molecule Profiler軟件對(duì)DODAP及其降解產(chǎn)物和氧化形式進(jìn)行反相LC-MS分析的結(jié)果。色譜分離顯示DODAP的主峰在15.5分鐘處，未經(jīng)處理的DODAP樣品中存在多個(gè)降解產(chǎn)物，其中主要的降解峰在3.15分鐘處。研究結(jié)果表明DODAP易于降解。Molecule Profiler軟件被用于識(shí)別DODAP雜質(zhì)，并自動(dòng)確定每個(gè)雜質(zhì)的相對(duì)豐度。通過(guò)高分辨率的ZenoTOF 7600 系統(tǒng)，實(shí)現(xiàn)了出色的質(zhì)量準(zhǔn)確度。研究還使用EAD MS/MS譜圖和Molecule Profiler軟件對(duì)DODAP及其降解產(chǎn)物和氧化形式的結(jié)構(gòu)進(jìn)行了詳細(xì)表征。該研究提供了一種完整的離子化脂質(zhì)特性分析解決方案，并可以用于藥物療效和安全性評(píng)估以及新合成脂質(zhì)的設(shè)計(jì)。
  
  
應(yīng)該案例3. 
碰撞誘導(dǎo)解離(CID)和電子活化解離(EAD)技術(shù)對(duì)藥物代謝物鑒定
SCIEX專(zhuān)家從質(zhì)譜和軟件的角度釋讀
 
在藥物發(fā)現(xiàn)的早期階段，對(duì)肝微粒體測(cè)定來(lái)研究代謝清除率和代謝位點(diǎn)。ZenoTOF 7600 系統(tǒng)和Molecule Profiler軟件的代謝物鑒定工作流程，快速易用的工作流程生成信息數(shù)據(jù)，加快了早期藥物發(fā)現(xiàn)過(guò)程。
  
 
上圖顯示使用Molecule Profiler軟件自動(dòng)化的結(jié)構(gòu)解析，確認(rèn)兩種結(jié)合型生物轉(zhuǎn)化物，包括去甲基化福莫特羅的代謝物及進(jìn)一步的葡萄糖醛酸代謝物的結(jié)構(gòu)鑒定，EAD的質(zhì)譜數(shù)據(jù)能明確地確定葡萄醛酸代謝的途徑。
  
ZenoTOF 7600 系統(tǒng)上的Molecule Profiler軟件，可以對(duì)I相、II相和多種生物轉(zhuǎn)化物代謝物進(jìn)行自動(dòng)結(jié)構(gòu)分配�？煽康拇x物鑒定使用EAD MS/MS譜圖、CID MS/MS譜較長(zhǎng)或兩者結(jié)合的獨(dú)特離子進(jìn)行分析。
 
AI釋讀
這篇論文介紹了使用ZenoTOF 7600 系統(tǒng)和Molecule Profiler軟件進(jìn)行代謝物鑒定的軟件輔助過(guò)程。該方法結(jié)合了CID和EAD數(shù)據(jù)，增加了代謝物結(jié)構(gòu)鑒定的可信度。研究使用了ZenoTOF 7600 系統(tǒng)和Molecule Profiler軟件生成了信息豐富的數(shù)據(jù)，加速了早期藥物發(fā)現(xiàn)過(guò)程。
 
論文中提到，利用LC-MS工具進(jìn)行微粒體測(cè)定可以估計(jì)代謝清除率和鑒定代謝位點(diǎn)。通過(guò)使用ZenoTOF 7600 系統(tǒng)和Molecule Profiler軟件的先進(jìn)代謝物鑒定工作流程，可以快速、簡(jiǎn)便地生成有用的數(shù)據(jù)，加速早期藥物發(fā)現(xiàn)過(guò)程。
 
Molecule Profiler軟件可以識(shí)別治療分子中的生物轉(zhuǎn)化。最新的更新使得該軟件可以根據(jù)EAD和CID數(shù)據(jù)對(duì)生物轉(zhuǎn)化的結(jié)構(gòu)進(jìn)行優(yōu)先排序，非常適合比較MS/MS光譜并識(shí)別獨(dú)特的片段。使用ZenoTOF 7600 系統(tǒng)和Molecule Profiler軟件進(jìn)行代謝物研究的關(guān)鍵特點(diǎn)包括增強(qiáng)的結(jié)構(gòu)鑒定、可靠的結(jié)構(gòu)鑒定、快速的代謝物鑒定和簡(jiǎn)化的數(shù)據(jù)采集和處理工作流程。
 
論文中還介紹了樣品制備、色譜條件和質(zhì)譜條件等實(shí)驗(yàn)方法。通過(guò)使用Zeno CID DDA和Zeno EAD DDA數(shù)據(jù)，結(jié)合Molecule Profiler軟件，可以鑒定出相位I、相位II和生物轉(zhuǎn)化組合代謝物。軟件可以直接從SCIEX OS軟件的Explorer模塊導(dǎo)入MS/MS光譜，并進(jìn)行結(jié)構(gòu)鑒定。
 
論文的結(jié)論包括自動(dòng)化的結(jié)構(gòu)鑒定、利用Molecule Profiler軟件識(shí)別EAD和CID MS/MS光譜中的獨(dú)特片段、快速高效的軟件輔助代謝物鑒定和相關(guān)分析、以及該工作流程的適應(yīng)性和可擴(kuò)展性。
 
總之，這篇論文介紹了使用ZenoTOF 7600 系統(tǒng)和Molecule Profiler軟件進(jìn)行代謝物鑒定的方法和工作流程，并展示了其在早期藥物發(fā)現(xiàn)中的應(yīng)用潛力。
 
 
應(yīng)用案例4. 
精確質(zhì)譜法鑒定脂質(zhì)生物標(biāo)志物
SCIEX專(zhuān)家從質(zhì)譜和軟件的角度釋讀
本工作描述了測(cè)定小鼠腦基質(zhì)中葡萄糖基和半乳糖基神經(jīng)酰胺的高分辨質(zhì)譜方法。小鼠大腦含有許多內(nèi)源性脂質(zhì)生物標(biāo)志物，這些標(biāo)志物具有相似的結(jié)構(gòu)，干擾非常普遍；分析揭示了新的干擾或在治療組之間增加或減少的干擾。這些數(shù)據(jù)充分展示了潛在的生物標(biāo)記物是如何識(shí)別的，可以獲得更多關(guān)于目標(biāo)樣本的信息，有助于將這些物種作為其他潛在的生物標(biāo)志物進(jìn)行表征。
  
ZenoTOF 7600 系統(tǒng)是一種可以用于脂質(zhì)生物標(biāo)志物定性和定量分析的利器，具有高靈敏度和準(zhǔn)確性。
 
AI釋讀
這篇論文介紹了使用SCIEX OS軟件平臺(tái)中的Formula Finder和ChemSpider工具來(lái)進(jìn)行化合物鑒定的方法。通過(guò)準(zhǔn)確質(zhì)量TOF MS數(shù)據(jù)，F(xiàn)ormula Finder確定可能的分子式，然后ChemSpider在其數(shù)據(jù)庫(kù)中搜索與所提出的分子式匹配的條目。最后，ChemSpider生成一個(gè)命中計(jì)數(shù)，總結(jié)與前體質(zhì)量和同位素譜圖確定的分子式匹配的數(shù)據(jù)庫(kù)條目數(shù)量。根據(jù)命中計(jì)數(shù)，用戶(hù)選擇最合適的分子式，并將其與數(shù)據(jù)庫(kù)中的命中進(jìn)行匹配。然后，通過(guò)比較理論碎片與收集到的MS/MS數(shù)據(jù)，提供碎片的百分比匹配，最終由用戶(hù)做出最終選擇。該方法在小鼠腦樣本中鑒定干擾物和化合物的過(guò)程中展示了良好的效果。此外，論文還介紹了使用ZenoTOF 7600 系統(tǒng)進(jìn)行脂質(zhì)生物標(biāo)志物的敏感定量分析的方法，并展示了其在低樣本體積下實(shí)現(xiàn)高靈敏度的能力。最后，論文總結(jié)了該方法的優(yōu)點(diǎn)，包括簡(jiǎn)單易行的樣品鑒定和定量分析，以及在SCIEX OS軟件提供的單一平臺(tái)上實(shí)現(xiàn)的數(shù)據(jù)采集、處理和管理。
 
 
 
 
txyz.ai 請(qǐng)告訴我，什么是EAD？
圖為向txyz.ai就“EAD定義問(wèn)題”問(wèn)答情形展示
 
如果您對(duì)SCIEX高分辨質(zhì)譜 ZenoTOF® 7600 系統(tǒng)的新進(jìn)EAD應(yīng)用案例感興趣，可以掃描二維碼，獲取英文原文。
  
使用txyz.ai工具輔助閱讀，AI工具不僅可以幫助理解全文，您還可以向AI提問(wèn)，比如
  • “這篇文章使用了什么研究方法”
  • “這篇文章中有什么創(chuàng)新”
  • “文章中的提到EAD是什么”（如上圖）等等。甚至還能用中文回答問(wèn)題。
 
掃描二維碼，下載新進(jìn)EAD應(yīng)用案例
相關(guān)公司：SCIEX
聯(lián)系電話：產(chǎn)品咨詢(xún)：400-821-3897（手機(jī)撥入）/售后咨詢(xún)：800-820-3488 （座機(jī)撥入）
E-mail：bing.xiao@sciex.com

【點(diǎn)擊可查看 SCIEX 相關(guān)產(chǎn)品】

用戶(hù)名: 密碼: 匿名 快速注冊(cè) 忘記密碼
評(píng)論只代表網(wǎng)友觀點(diǎn)，不代表本站觀點(diǎn)。 請(qǐng)輸入驗(yàn)證碼： 8795

關(guān)于我們 | 法律聲明 | 廣告報(bào)價(jià) | English | 網(wǎng)站地圖
Copyright(C) 1998-2025 生物器材網(wǎng) 電話：021-64166852;13621656896 E-mail：info@bio-equip.com