因美納推出全新空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)
瀏覽次數(shù):2405 發(fā)布日期:2025-2-21
來源:Illumina因美納
美國加利福尼亞州圣迭戈 —— 2025年2月19日,因美納公司(納斯達(dá)克股票代碼:ILMN)宣布推出一項全新的空間組學(xué)技術(shù)項目,將幫助研究人員以前所未有的規(guī)模繪制復(fù)雜組織圖譜,并深入了解細(xì)胞行為。這項技術(shù)將在因美納測序儀和全新多模態(tài)分析平臺上實現(xiàn),提供具有細(xì)胞分辨率和高靈敏度的無偏全轉(zhuǎn)錄組分析。這些性能將有望推動空間組學(xué)研究的拓展,并開啟此前無法實現(xiàn)的應(yīng)用和實驗。
下周于美國佛羅里達(dá)州舉行的基因組生物學(xué)技術(shù)進(jìn)展大會(AGBT)期間,因美納公司將在研討會上公布該技術(shù)相關(guān)細(xì)節(jié)和早期試用客戶數(shù)據(jù)。
因美納首席技術(shù)官Steve Barnard博士表示:“空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)為深入了解生物細(xì)胞功能開辟了全新路徑。因美納的空間組學(xué)技術(shù)將在我們先進(jìn)的測序平臺上提供完整的工作流程。憑借這一創(chuàng)新,我們將樹立新的標(biāo)桿,有望推動新一輪科學(xué)發(fā)現(xiàn)的浪潮,進(jìn)一步解鎖更深層次的生物學(xué)認(rèn)知——從細(xì)胞間相互作用對疾病的影響到解決這些問題所需的機制。”
空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)使研究人員能夠在細(xì)胞層面探索生物學(xué)的相互作用。例如,通過繪制細(xì)胞的詳細(xì)排列圖的“細(xì)胞圖譜”,研究人員可以在影響疾病的復(fù)雜組織結(jié)構(gòu)方面獲得全新洞察。這也為腫瘤微環(huán)境、疾病通路、神經(jīng)生物學(xué)、免疫腫瘤學(xué)等領(lǐng)域的發(fā)現(xiàn)提供了新的可能。
因美納空間組學(xué)技術(shù)擬于2026年進(jìn)行商業(yè)發(fā)布,它將能夠讓研究人員在單次實驗中觀測數(shù)百萬個細(xì)胞的空間鄰近關(guān)系,其捕獲區(qū)域面積將是現(xiàn)有技術(shù)的九倍,分辨率則高出四倍。通過讓研究人員在單次空間實驗中分析更多細(xì)胞,該技術(shù)不僅能識別稀有細(xì)胞群,還能提高統(tǒng)計效能,從而增強研究結(jié)果的可靠性。作為一項端到端解決方案,它還將以更具經(jīng)濟(jì)性的價格為單細(xì)胞和空間組學(xué)研究人員創(chuàng)造更大價值。該空間組學(xué)解決方案在規(guī)模和精確度方面均超越行業(yè)標(biāo)準(zhǔn),并與因美納的NextSeq和NovaSeq系列測序儀兼容,從而大幅降低了大規(guī)模項目的運行成本。
全新多模態(tài)分析平臺提供有力洞察和可視化功能
這項空間組學(xué)技術(shù)將與全新軟件平臺Illumina Connected Multiomics(ICM)配合使用。ICM是一個多模態(tài)分析平臺,旨在幫助研究人員輕松可視化空間實驗的結(jié)果。ICM幫助研究人員導(dǎo)航、探索和分析多組學(xué)數(shù)據(jù)集,以驅(qū)動更加深刻的生物學(xué)數(shù)據(jù)洞察。其直觀的設(shè)計和與測序工作流程的無縫集成,將使任何科學(xué)家都能在一個平臺上實現(xiàn)有力的統(tǒng)計洞察和交互式可視化,以解碼多種復(fù)雜模態(tài),如基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)、表觀遺傳學(xué)和單細(xì)胞數(shù)據(jù)等。
因美納全球軟件與信息學(xué)負(fù)責(zé)人Rami Mehio表示:“Illumina Connected Multiomics將實現(xiàn)從樣本到分析的無縫工作流程,提供加速生命科學(xué)突破所需的強大可視化和統(tǒng)計分析工具。”
博德研究所與因美納宣布合作啟動空間組學(xué)旗艦項目
2月19日,博德研究所(Broad Institute)與因美納共同宣布,雙方將運用因美納的先進(jìn)空間組學(xué)技術(shù),合作開展一項突破性的空間組學(xué)旗艦項目。該項目將在博德研究所的空間組學(xué)技術(shù)平臺(STP)進(jìn)行,測序工作則將在博德研究所的Broad Clinical Labs完成。
因美納先進(jìn)的空間組學(xué)技術(shù)提供了 50 mm*15 mm的廣闊成像區(qū)域,提高了靈活性、靈敏度、分辨率和無偏全轉(zhuǎn)錄組發(fā)現(xiàn)能力;谠摷夹g(shù),空間組學(xué)旗艦項目致力于展示大規(guī)?臻g數(shù)據(jù)集的變革性潛力。這項合作將從博德研究所主要研究人員提供的數(shù)百個樣本中生成大規(guī)模的協(xié)調(diào)數(shù)據(jù),旨在推動空間組學(xué)技術(shù)市場的更多發(fā)現(xiàn)。此外,該項目還將通過博德研究所的STP渠道,向外部研究團(tuán)隊提供因美納空間組學(xué)技術(shù)的早期試用機會,以促進(jìn)更廣泛的參與并加速創(chuàng)新。
因美納空間技術(shù)已在驅(qū)動真實世界突破
在AGBT會議期間的因美納研討會上,來自美國博德研究所、圣裘德兒童研究醫(yī)院(St. Jude Children’s Research Hospital)和轉(zhuǎn)化基因組研究所(TGen)的研究人員將分享由全新空間組學(xué)技術(shù)帶來的基于真實世界的研究進(jìn)展與數(shù)據(jù)。
肺纖維化研究:轉(zhuǎn)化基因組研究所生物創(chuàng)新與基因組科學(xué)部及空間多組學(xué)中心副主任Nicholas Banovich博士將分享他的研究成果,并強調(diào)高分辨率空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)在揭示肺纖維化新型疾病機制方面的強大潛力。
“因美納全新空間組學(xué)技術(shù)的規(guī)模和靈敏度使我們能夠在大型組織切片中研究整個轉(zhuǎn)錄組。我們利用這項技術(shù)進(jìn)行的早期分析已經(jīng)識別并定位了與肺纖維化中上皮細(xì)胞活躍重塑有關(guān)的分子失調(diào)。這將有助于識別可用于阻止或減緩疾病進(jìn)展的治療靶點。”Banovich表示。
Banovich的海報《運用因美納空間組學(xué)技術(shù)表征肺纖維化中的肺泡失調(diào)》將在AGBT會議上展示。
3D組織重建:博德研究所Michal Lipinski博士領(lǐng)導(dǎo)的空間組學(xué)研究成功構(gòu)建了小鼠大腦的3D重建,突破性實現(xiàn)了從一張切片上進(jìn)行10次實驗所能獲得的數(shù)據(jù)廣度,這在之前從未實現(xiàn)過。研究團(tuán)隊的摘要總結(jié)道, “實驗表明,因美納的全新空間組學(xué)技術(shù)可以為大規(guī)模實驗提供一個高效的平臺,并進(jìn)一步提升空間分辨率。”
“大規(guī)模、無偏全轉(zhuǎn)錄組捕獲是這一發(fā)現(xiàn)平臺的理想組成部分,該平臺能夠在單次實驗中找到新的標(biāo)記基因,并同時在多個組織切片上進(jìn)行驗證。” Lipinski表示。
Lipinski的報告《大范圍連續(xù)空間轉(zhuǎn)錄組分析可實現(xiàn)高分辨率和有限批次效應(yīng)的高效組織特征描述》將于美國東部時間2月25日星期二晚上7:30至7:50在AGBT會議上展示。
前列腺癌研究:圣裘德兒童研究醫(yī)院空間組學(xué)中心主任Jasmine Plummer博士將展示她的研究成果,闡明高分辨率空間測序如何揭示前列腺腫瘤微環(huán)境中的變化。
“空間組學(xué)提供了組織的藍(lán)圖、細(xì)胞外基質(zhì)的鋪設(shè)以及細(xì)胞的結(jié)構(gòu)視圖,” Plummer表示, “這種可視化能夠為癌癥進(jìn)展提供重要的洞察。”
“有了這項新技術(shù),我們僅需在兩種底物上就能對數(shù)百萬個細(xì)胞進(jìn)行分析,并發(fā)現(xiàn)靶向方法中未包含的生物標(biāo)志物,” Plummer補充道,“轉(zhuǎn)錄覆蓋率的提高使我們能夠進(jìn)行罕見細(xì)胞類型的分析,并發(fā)現(xiàn)這些罕見細(xì)胞類型與前列腺癌亞組中的疾病狀態(tài)相關(guān)。”
母體大腦研究:因美納科學(xué)研究高級總監(jiān) Darren Segale 博士將于美國東部時間 2 月 25 日星期二晚上 8:30至8:50 在AGBT發(fā)表題為 《懷孕小鼠大腦高分辨率空間轉(zhuǎn)錄組圖譜揭示與母性行為有關(guān)的區(qū)域性基因表達(dá)調(diào)控》的演講。
總體而言,該解決方案將幫助消除空間組學(xué)研究的障礙,讓研究人員更好地了解組織樣本的潛在生物學(xué)特性,并對實驗結(jié)果更有信心。
因美納支持的研討會將于美國東部時間2月24日中午12:00至下午1:30舉行。整個 AGBT 會議期間,因美納將在 Osprey Lounge 1 展示其端到端工作流程。

因美納公司致力于推動和激發(fā)基因組學(xué)的發(fā)展而不斷改善人類健康。專注創(chuàng)新使我們成為全球基因測序和芯片技術(shù)的領(lǐng)導(dǎo)者,并為全球范圍的科研、臨床和應(yīng)用市場客戶提供專業(yè)服務(wù)。我們的產(chǎn)品廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)、腫瘤學(xué)、生殖保健、農(nóng)業(yè)及其他新興領(lǐng)域。欲了解更多信息,請訪問www.illumina.com.cn或關(guān)注因美納微信公眾號。