轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)合蛋白質(zhì)組分析發(fā)現(xiàn)蠑螈再生奧秘
轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)合蛋白質(zhì)組分析探索蠑螈再生奧秘
來自德國及美國等處的研究人員針對基因組特別大，難以進行全基因組測序的動物，提出了以轉(zhuǎn)錄組測序與蛋白質(zhì)組分析聯(lián)合以解析功能基因的策略，并以蠑螈進行實驗，開辟了組織及器官再生研究的新思路。該研究成果已發(fā)表近期的《Genome Biology》雜志上。蠑螈是一種在侏羅紀(jì)中期演化的有尾兩棲動物，目前存活的約有400種。紅色斑點蠑螈雖然小，但其組織工程學(xué)技藝卻令人驚嘆。蠑螈在失去了組織，包括心肌、中樞神經(jīng)系統(tǒng)元件甚至眼睛的晶狀體后仍能再生。一般來講，動物的再生組織的能力是所有多細(xì)胞動物所共有的古老程序，因此，醫(yī)生們一直希望蠑螈的這種能力依賴于基礎(chǔ)遺傳學(xué)程序，而該程序潛伏在包括哺乳動物在內(nèi)的所有動物中，這樣他們就可以在再生醫(yī)學(xué)中利用蠑螈的再生機制。
然而蠑螈的基因組十分龐大，比人類基因組大十倍，要從頭獲得蠑螈的全基因組序列不容易。因此研究者們將目光轉(zhuǎn)向基因表達(dá)所產(chǎn)生的RNA，他們利用454新一代測序技術(shù)對蠑螈的轉(zhuǎn)錄組進行了研究。經(jīng)過從頭組裝N. viridescens的轉(zhuǎn)錄組，獲得了超過120,000個RNA轉(zhuǎn)錄本，約有15,000個轉(zhuǎn)錄本編碼蛋白質(zhì)，其中有826個轉(zhuǎn)錄本是蠑螈所特有的。這些轉(zhuǎn)錄本中包含了不同器官所有再生階段的轉(zhuǎn)錄本，這些轉(zhuǎn)錄本中的一部分與其它生物相似。通過對蠑螈胚胎和幼體的心臟、四肢、眼睛、尾、肝臟、脾臟等組織中再生過程表達(dá)的蛋白的分離以及質(zhì)譜分析方法，對這些蛋白進行分類及與轉(zhuǎn)錄本的比對。
通過454新一代測序結(jié)果與質(zhì)譜技術(shù)的結(jié)合，發(fā)現(xiàn)了500多個其它生物中從未被發(fā)現(xiàn)的肽段，接下來會進一步探索這些蛋白是否與再生能力相關(guān)。這項研究不僅為目前科學(xué)家們提供了兩棲類動物的基因數(shù)據(jù)，更為基因組測序困難的動物研究，提出了一種新思路。
參考文獻：
1. Genome Biol. 2013 Feb 20;14(2):R16. A de novo assembly of the newt transcriptome combined with proteomic validation identifies new protein families expressed during tissue regeneration. Looso M, Preussner J, Sousounis K, Bruckskotten M, Michel CS, Lignelli E, Reinhardt R, Hoeffner S, Krueger M, Tsonis PA, Borchardt T, Braun T.
相關(guān)公司：羅氏診斷產(chǎn)品（上海）有限公司
聯(lián)系電話：800-820-8864 400-820-8864
E-mail：china.lifescience@roche.com
聯(lián)系電話：800-820-8864 400-820-8864
E-mail：china.lifescience@roche.com
- 熱烈祝賀易科泰榮膺2025全球數(shù)字農(nóng)業(yè)品牌企業(yè)
- 湖南赫西參加"儀器維保聯(lián)盟"啟動儀式,共繪美好藍(lán)圖
- 飛納電鏡用戶培訓(xùn)會廈門站圓滿落幕
- ARveo8顯微鏡助力首例頸深LVA術(shù)成功逆轉(zhuǎn)AD認(rèn)知衰退
- 熱烈慶祝西美杰正式成為 Virusys 品牌代理商！
- 普瑞麥迪成為瑞士3Brain中國區(qū)戰(zhàn)略合作伙伴
- 2024年"MCE中國生命科學(xué)研究促進獎"評獎結(jié)果公布
- 全球視野,本土深耕-丹納赫中國生命科學(xué)平臺戰(zhàn)略升級
- 安捷倫向哥倫比亞大學(xué)Pawel Muranski博士授予ARC獎
- INTEGRA WELLJET試劑分液器現(xiàn)已支持SiLA-2集成
- 安捷倫xCELLigence實時細(xì)胞分析助力Autolus獲批
- 易科泰植物葉綠素?zé)晒獬上裣到y(tǒng)交付西安理工大學(xué)
- 霍爾斯廚余資源化利用項目順利完成，助力土壤改良
- 金鵬祝賀上海農(nóng)林職業(yè)技術(shù)學(xué)院獲24年產(chǎn)教融合一等獎
- EVIDENT生命科學(xué)服務(wù)號正式更名為EVIDENT顯微成像
- 怡美通德邀您參加第三屆國際單細(xì)胞及空間組學(xué)大會
- 10x Genomics技術(shù)方案更新(2月)，新手冊等您獲取
- 2025中國細(xì)胞與基因治療大會第五屆年會招展通知
- 10x和CZI及Ultima Genomics合作啟動十億細(xì)胞項目
- 第二屆中國國際生殖醫(yī)學(xué)健康大會通知
- 森西賽智聯(lián)合Vizgen發(fā)布MERFISH保存樣本空轉(zhuǎn)方案
- 第五屆多組學(xué)科研與臨床應(yīng)用大會（北京站）通知
- 2025年10x Genomics校園行邀請—北京中醫(yī)藥大學(xué)站
- 華大智造發(fā)布桌面式測序儀T1+,24小時可完成Tb級測序
- 因美納推出多組學(xué)創(chuàng)新方案，解鎖更深入的生物學(xué)見解
- 因美納推出全新空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)
- 真邁生物再次獲批“十四五”國家重點研發(fā)計劃
- 因美納被列入不可靠實體清單，國產(chǎn)替代，誰是最優(yōu)解
- IGC 2025第九屆免疫基因及細(xì)胞治療大會通知
- 因美納升級NovaSeq X產(chǎn)品系列，賦能多組學(xué)應(yīng)用
Copyright(C) 1998-2025 生物器材網(wǎng) 電話：021-64166852;13621656896 E-mail：info@bio-equip.com