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組織庫冷凍樣本管理流程推薦

瀏覽次數(shù):17681 發(fā)布日期:2010-12-20  來源:上海萬格科學器材有限公司

組織庫冷凍樣本管理流程推薦
上海萬格周學迅

一. 取材和編號/標簽部分
    在本環(huán)節(jié)進行組織和血液的取材,并制作條形碼標簽,將樣本進行分裝。
1. 取材單:手術(shù)醫(yī)生根據(jù)臨床病例情況在術(shù)前一日通知樣本庫次日取樣本,同時在醫(yī)囑中注明需要抽取血樣數(shù)量、種類。樣本庫根據(jù)次日樣本情況預先準備樣本提取單,并預先定義好流水編號。樣本提取單上的信息可包含并不僅限于以下內(nèi)容中的一部分:
A. 個體流水編號
B. 個體基本信息:如住院號,病理號,手術(shù)科室,手術(shù)醫(yī)生,病人姓名,性別等
C. 樣本特征信息:如臟器名稱,樣本類型(腫瘤,癌旁,正常,淋巴結(jié),息肉,囊壁),樣本性質(zhì)(原發(fā)/復發(fā)/轉(zhuǎn)移)等
D. 樣本采集信息:如樣本份量,體積,分管數(shù),術(shù)前/術(shù)后等
E. 診斷信息:如臨床診斷,病理診斷,分化程度,UICC 分期,ICD10/ICDO-3 代碼等
F. 治療信息:如放療,化療,手術(shù)等
G. 生物安全信息:有/無傳染性
H. 時間信息:采集時間,樣本離體時間,低溫時間,等
I. 工作人員信息:取材員,記錄員等
J. 以及備注信息。
2. 組織樣本:從手術(shù)室收集組織樣本,填寫取材表。在組織庫凍存管理軟件上登記部分欄目,如通過輸入住院號碼,軟件從HIS 中自動調(diào)入該病例的個體信息(基本信息、臨床信息等)。
如果輸入部分信息,由系統(tǒng)自動生成連續(xù)于上次的個體編號,如選擇臟器名,樣本類型,樣本保存方式,以及分管數(shù),軟件按照規(guī)則生成樣本編號,如1012345D19TF1~ 1012345D19TF4,在對應的樣本信息欄中輸入各分管的樣本采集信息等特性,點擊保存將所有信息存入數(shù)據(jù)庫,同時自動在手術(shù)室的耐液氮的條形碼標簽上生成樣本條形碼信息。將離體的組織樣本存入耐液氮凍存管,貼好標簽后,在30 分鐘內(nèi)浸入液氮。當天樣本采集完成后,使用小型液氮轉(zhuǎn)移罐或者冰盒將樣本轉(zhuǎn)移到實驗室。
【組織樣本的編號命名1012345D19TF1,代表該1012345 號病收集的D19 臟器的癌旁樣本(T
腫瘤,P 癌旁,N 正常,L 淋巴結(jié),Y 息肉,C 囊壁)用F 方式(Frozen Tissues/OCT/
RNAlater/DNA/Paraffin embedding 等)保存的第一份。】

3. 血液樣本:各科室分別將血液樣本送樣本庫,附血液取材表,填寫取材表信息,取材表上分管數(shù)留空。按不同原發(fā)病灶臟器名稱,對樣本和取材單歸類,每類按序排放。
a. 打印標簽:通過輸入住院號將個體信息導入組織庫凍存管理軟件,之后將取材單上的流水編號和臟器名稱輸入軟件,同時輸入不同成份對應的預設管數(shù),按照規(guī)則自動生成樣本編號,如1012345D19BP1~1012345D19BP5,自動在實驗室的條碼打印機上生成耐-80 度標簽。
b. 將標簽貼到EP 管上,按序在離心管架上排好。
c. 將血液樣本進行離心分血處理,對每種成份按預設的分管數(shù)分裝成若干份,存入預先排好的離心管,存入時核對一下編號。
【以上方法為先貼標簽再分血的程序,也可以考慮先分管再貼標簽,流程如下:將血樣樣本進行離心分血處理,按需對不同成份存入EP 管,按樣本類型排序放好,在EP 管蓋上手工寫上取材表上的個體流水號,同時在取材單上登記不同成份樣本的確切分管數(shù)。完成后,根據(jù)取材單上的信息,通過軟件輸入相關(guān)信息,按照規(guī)則自動生成耐-80 度的條形碼標簽。按順序?qū)⒄x心管貼好標簽,再送-80 度凍存!
【血液樣本的編號命名1012345D19BP1,代表該1012345 號病收集的D19 臟器癌癥的B 血液
樣本的P 血漿(Plasma/ Serum / White Blood Cells/ Erythrocyte/ Thrombolytic / DNA/ RNA/whole Blood/等)的第一份!
注:如今后存儲細胞混懸液、分泌物、排泄物等類型樣本時,編號規(guī)則參考附表2。

二. 樣本入庫部分
    在本環(huán)節(jié)將條碼凍存管按照預先分配的位置信息存入條碼凍存盒。通過對凍存管條形碼的掃描,實現(xiàn)軟件上的同步存入。
4. 在-80 度臥式冰箱里進行樣本分類整理,按不同臟器將條碼凍存管存入條碼凍存盒,存入時通過對條碼的掃描,確定凍存管和凍存盒之間的位置關(guān)系,實現(xiàn)軟件上的同步信息定位。將凍存盒存入-80 度臥式冰箱的對應位置時,也通過對凍存盒條形碼的掃描在軟件上實現(xiàn)同步存入。
建議按照原發(fā)臟器名稱進行樣本歸類存儲,每個凍存盒內(nèi)裝同一種臟器同一種類型的樣本,不同類型的樣本存入不同顏色的凍存盒(如分成血清,血漿,白細胞,冷凍組織,RNALATER,細胞組學)。
為更便于使用,并且減少使用時的凍融次數(shù),建議同一臟器同一類型樣本的不同份數(shù),存入不同的凍存盒。
建議預先規(guī)劃凍存盒的存放位置,在凍存盒放入臥式整理冰箱之前,已經(jīng)預先貼好了標簽,其中包含臟器名稱,樣本類型和位置編號。等凍存盒存滿后,可另貼一個標簽注明內(nèi)部的凍存管的流水編號起止。
5. 在臥式整理冰箱里任一病種的凍存盒存滿后,轉(zhuǎn)移到預先規(guī)劃好位置的供長期存儲的立式-80度超低溫冰箱(如不同層架規(guī)劃給不同的臟器),將凍存盒進行轉(zhuǎn)移的時候,通過對凍存盒條形碼的掃描,實現(xiàn)軟件上的同步的位置搬移。

三. 信息關(guān)聯(lián)部分
6. 樣本的個體信息關(guān)聯(lián)導入:
    樣本的個體信息,可以在以上第2 第3 點制作標簽的環(huán)節(jié)通過HIS 關(guān)聯(lián)直接導入。如果無法實現(xiàn)HIS 接口的導入,可以通過定期用EXCEL 格式轉(zhuǎn)導入。
    通過住院號或者病理號,從醫(yī)院信息系統(tǒng)(HIS)里將樣本個體來源對應的信息(基本信息,病史,病程,診斷信息,病理信息,檢驗信息,治療信息,電子病例信息等)以 “.xls” (EXCEL文件格式)導出,然后將相關(guān)信息導入到凍存管理軟件,通過住院號將凍存管上的編號和樣本個體來源的信息進行關(guān)聯(lián)。
7. 將樣本的后期管理信息錄入系統(tǒng)?赏ㄟ^直接登記或者接口導入的方法,在凍存管理軟件上錄入樣本的關(guān)聯(lián)信息,如治療結(jié)果,家系資料,流行病學資料,隨訪資料等。
8. 組織/血液樣本的匹配:在凍存管理系統(tǒng)中設置關(guān)聯(lián)欄目,如就診卡號,住院號或身份證號等,如果某例樣本既有血液又有組織,則系統(tǒng)自動匹配樣本,建立信息關(guān)聯(lián)并提示匹配樣本數(shù)量。

四. 出庫管理和日常操作部分
9. 樣本的使用和管理中的幾個細節(jié)
1) 通過凍存管理軟件,進行各種預定條件的查詢,統(tǒng)計,分析和出入庫管理。
2) 在冰箱中的樣本盒內(nèi)空位較多時,計算機主界面上用不同顏色顯示對應凍存盒的存儲空置情況,可對對應凍存盒進行并位管理,整理出空的位置可供新的樣本存入。
3) 出庫時,通過條形碼掃描實現(xiàn)快速信息處理。
4) 設立賬號層級權(quán)限,對樣本設置重要性權(quán)限級別,對樣本的某些信息字段也設置權(quán)限級別。權(quán)限除了操作功能限定,還和樣本重要性級別掛鉤。例如:現(xiàn)場取材賬戶只能制作標簽和錄入取材基本信息;樣本管理人員可以查詢樣本的信息并進行入庫操作,也可執(zhí)行出庫,;樣本庫主管賬號可統(tǒng)計分析樣本庫信息,并審批出庫;授權(quán)的訪問賬號可以查詢得知庫內(nèi)現(xiàn)有的符合某些對應基本信息的樣本數(shù)量,或者看到樣本基本信息,卻無法看到姓名等隱私字段。
10. 樣本庫標識建議
在冰箱外門上貼上磁性凍存架模擬標識,并在對應的空格位置上填寫凍存盒的信息。例如凍存盒內(nèi)樣本名稱,凍存盒編號,凍存盒內(nèi)樣本編號起止等。
這樣,在打開冰箱門之前,對內(nèi)部的樣本基本情況也能一目了然。
注:【根據(jù)某些樣本最終的實驗要求,可能需要設計不同的存儲流程,比如有些需要做蛋白實驗的樣
本,直接存入液氮罐或者-150 度冰箱保存,不經(jīng)過整理冰箱這個環(huán)節(jié);又比如對需要做細胞和組織培養(yǎng)的樣本,為保證樣本的質(zhì)量,需要先存入-40 度冰箱后再轉(zhuǎn)入-80 再存入-150 度超低溫冰箱,或者采用程序冷凍儀進行冷凍】
五. 樣本保存圖示說明
A. 組織編號規(guī)則和標簽

B. 外周血編號規(guī)則和標簽

標簽類型:BRADY THT-163-499-3-IP 長方形為25.4mm*9.525mm, 圓直徑9.525mm
C.標簽說明:以上方案設計中,條碼打印機和標簽使用美國的BRADY 產(chǎn)品,標簽建議使用THT-163-499,該標簽可以適用-196 度。標簽長方部分可打印條形碼和編號,單位logo,以及若干條樣本的信息項(如臟器名稱,ICDO-3 編號,樣本類型,采集日期等),可貼于凍存管和離心管的側(cè)壁,標簽的圓點部分可以打印流水號、臟器名稱和采集日期,可貼于凍存管和離心管的頂蓋部分,以便于核對。編號規(guī)則,參見附表2 或訪問www.avantech.cn/code.pdf
D. 凍存管/離心管貼了條碼標簽后的情況如下:

E. 在凍存盒上貼上標簽,并注明凍存盒的位置編號。

F. 按照樣本類型,進行凍存盒分色存放

G. 同一臟器同一類型樣本不同份分入不同凍存盒存放,同一臟器不同類型分成不同顏色凍存盒,同一臟器所有盒子存入同一凍存架,在樣本處理室內(nèi)的臥式超低溫冰箱里整理,某一盒存滿后,再轉(zhuǎn)移入樣本儲存室的大型立式超低溫冰箱。

H. 立式超低溫冰箱按照不同臟器,預先規(guī)劃位置。
所有放到臥式冰箱里整理的凍存盒上,已經(jīng)預先貼好了標簽,標簽上包含這個凍存盒最終將存入超低溫冰箱的位置信息。

附件一:組織庫冷凍保存容器的基本情況
一. 組織庫冷凍保存管的常見形態(tài)與保存溫度。
組織:凍存管保存(以內(nèi)旋凍存管為多),常保存于-80 度/-150 度冰箱或液氮,也有很多單位將部分組織以RNAlater 浸潤后保存于-30 度或-80 度條件,此外也有OCT 包埋,蠟塊等組織保存形態(tài)。在條件允許的情況下,盡量保留T/P/N 三種形態(tài)的樣本。
推薦用內(nèi)旋凍存管,一組TPN 保留于-150 度冰箱,兩組TPN 保留于-80 度冰箱,一組TPN 保留于RNAlater
血液:凍存管或離心管保存,常保存于-80 度條件下。
血液應進行分離,并以血液組分的形式單獨保存,常見保存的有血漿,血清,白細胞,也有保存紅細胞,血沉棕黃層的,也有分離出淋巴細胞保存的。推薦用0.5ml 離心管保存5 份血清,5 份血漿,1~2 份淋巴細胞從樣本管的容積上看,越來越有細分化的趨勢,這一趨勢也是為了最大化地方便樣本使用和改善樣本質(zhì)量(減少凍融次數(shù)),目前常規(guī)都存儲在0.5-2ml 的樣本管內(nèi)。

二.組織庫凍存盒的常見形態(tài)
    凍存盒是存放樣本管的最基礎容器,選擇好凍存盒,可以給存儲樣本帶來方便,也可以合理利用冰箱存儲空間,所以顯得重要。
    由于目前主流超低溫冰箱/液氮罐的內(nèi)空間設計,都是以2 英寸凍存盒為基準設計的,所以選擇的凍存盒尺寸應盡量采用標準尺寸:132*132*52。
     在滿足該尺寸的條件下,有兩種規(guī)格的凍存盒,一種為9*9,一種為10*10。9*9 規(guī)格最為常見,適用于各品牌各種規(guī)格的1.5-2ml 樣本管。而10*10 僅適用于某些品牌的內(nèi)旋2ml 凍存管,以及部分特制的1.5ml 外旋凍存管。在選擇凍存盒的時候需要注意該點。0.5ml 離心管對應的凍存盒,10*10 規(guī)格的情況下,長寬尺寸和標準2ml 凍存盒相同,高度可以減小到2/3 以增加內(nèi)凍存盒容量。從凍存盒材料上看,市場上主要有紙質(zhì),PP,PC 幾種材料。PC 塑料凍存盒能兼容冰箱和液氮罐,可惜成本太高,PP 塑料凍存盒在液氮條件下會脆裂,紙質(zhì)凍存盒能適用液氮,不過在應用于液氮液相時需要預先打孔。
    常規(guī)紙質(zhì)凍存盒不防水,上海萬格科學器材有限公司專利的翻蓋型凍存盒既解決了防水問題,又解決了編號定位問題,翻蓋設計還解決了低溫條件下開蓋困難的問題,是目前制作最好的紙質(zhì)凍存盒。目前國內(nèi)大型組織生物樣本庫都使用了該類型凍存盒。

三.冰箱內(nèi)存放凍存架凍存盒的常見形態(tài)
1. 立式超低溫冰箱內(nèi)放置凍存架的方法
2.立式凍存架內(nèi)放置凍存盒的方法:

3. 臥式低溫冰箱存放凍存盒的情況

4. 凍存架的選擇:
    常規(guī)的不銹鋼凍存架,按材料分,有SUS-304 或SUS-201 的0.4-1.0mm 厚度不銹鋼材料制作,類型分,有抽屜型凍存架和框式凍存架。因為不銹鋼材料和工藝的不同,所以價格差距比較大。
Avantech 品牌CryoMaxTM 系列凍存架,全部采用SUS-304 有3 種系列,覆蓋各種需求。
    IR 常規(guī)系列凍存架采用和進口凍存架同等的模具,使用0.75mm 厚度SUS-304 不銹鋼使用沖模將背板一次沖壓翻邊成型,是目前國內(nèi)制作最好的凍存架。
    IR-CN 系列凍存架采用0.4mm 厚度SUS-304 不銹鋼,對切口做翻邊處理,是實惠型的輕質(zhì)凍存架,比市場上常見的SUS-201 制作的凍存架更耐腐蝕。
    IR-D 系列凍存架是采用0.4mm-1.0mm 多種材料混合制作的抽屜型凍存架。

四. 超低溫冰箱的考慮因素
1. 冰箱類型。
    超低溫冰箱有立式和臥式之分,溫度有-80 度和-150 度。目前市面上-150 度冰箱都是臥式。臥式冰箱優(yōu)點是開門冷氣散發(fā)較小,缺點是占地面積大,立式冰箱正好相反。所以大規(guī)模建庫的情況下,推薦使用立式冰箱做大規(guī)模存儲,而臥式冰箱做經(jīng)常開關(guān)門的整理冰箱用。
2. 面積規(guī)劃。
    由于建組織庫,冰箱會越來越多,所以選擇冰箱的時候需要規(guī)劃單樣本的占地面積事宜。有三個因素會與此有關(guān)
A. 冰箱保溫發(fā)泡材料:采用VIP 發(fā)泡技術(shù)的冰箱對建庫來說顯得更有優(yōu)勢,該技術(shù)將140mm 厚的外壁降低到70mm 厚,使得冰箱占地面積大大縮小。
B. 冰箱容量越大,單標本占地面積越小。
C. 內(nèi)部空間設計越緊湊,單標本占地面積越小。
    根據(jù)以上3 個因素,目前全球單標本占地面積最小的是S 品牌的MDF-U73V。其在0.9 平方不到的空間內(nèi)可放置528 個標準凍存盒。比同類型的其余品牌單樣本占地面積小約30%
3. 用電和成本因素。
    由于 500 升的冰箱和700 升的冰箱,耗電幾乎是一致的,所以對于單標本的耗電量來說,大容量的冰箱比較劃算。從成本上算,大容量冰箱的單樣本平攤設備成本會比小容量冰箱要低,同時,10 年的耗電量也低。
4. 安全保護裝置。
    冰箱的安全保護涉及四個內(nèi)容:1 是斷電時的保護 2 是斷電后重新恢復電力時的保護3 是運行期間的穩(wěn)壓保護4 是使用機制
1) 斷電條件下的保護一般有兩種方式:A. UPS B. LCO2/LN2 輔助冷卻裝置UPS 當前成本較高,并沒有大規(guī)模使用。若干年后可能會有一種UPS 方式是夜間給UPS充電,白天UPS 給設備供電,利用電價峰谷差進行,根據(jù)目前的UPS 和用電成本,該方式從經(jīng)濟效應上來說是不合算的。
    CO2/LN2 輔助冷卻裝置又叫后備制冷系統(tǒng)(BACKUP SYSTEM),采用一種在冰箱內(nèi)溫度上升時,機械感溫裝置觸動電磁閥的開啟,向冰箱內(nèi)注入液態(tài)CO2/液態(tài)N2 的輔助冷卻方式。輔助冷卻系統(tǒng)在設備故障或者斷電情況下可維持10 小時左右,具體時長根據(jù)設置溫度和鋼瓶容量會有所不同, CO2 輔助冷卻適用于-80 冰箱,一般情況下可使箱內(nèi)維持在-65~-70 度左右,而LN2 適用于-150 度超低溫冰箱,能使箱內(nèi)維持在-130 度以下。CO2輔助冷卻裝置使用帶虹吸管的液態(tài)CO2 鋼瓶,LN2 輔助冷卻裝置使用自增壓的液氮罐,該液氮罐會有LN2 的自然損耗。
2) 斷電后重新恢復電力的時候,由于冰箱壓縮機的啟動電流較大,所以一批冰箱同時重啟的時候,會對電力負荷造成二次沖擊,所以需要對每臺冰箱設置不同的延時啟動。目前市場上有冰箱是自帶延時啟動設置功能的。
3) 在電壓不穩(wěn)定的地區(qū),需要使用穩(wěn)壓保護裝置
4) 使用機制方面,涉及掛鎖,電子密碼鎖,冰箱溫度監(jiān)控報警系統(tǒng),樣品室門禁監(jiān)控系統(tǒng),樣品信息安全機制等。
5.冰箱的推薦
常見凍存盒保存樣品管情況對照表

 型號 類型   內(nèi)部分格  尺寸mm  適用冷凍管
 IRBOX-2081  上下蓋型  9*9  132×132×52

 所有品牌1.5-2.0ml 內(nèi)外旋凍存管,

1.5ml 各品牌EP管

 IRBOX-2281  翻蓋型  9*9  132×132×52  
 IRBOX-2100  翻蓋型  10*10  134×134×52  所有品牌1.8-2.0ml 內(nèi)旋凍存管,
AVANTEH 牌1.6ml 外旋凍存管OCT-160S,
Nalgene 牌1.0ml 外旋凍存管
 IRBOX-1100  翻蓋型  10*10  132×132×35  0.5-0.6ml 各品牌EP 管

推薦最適用于建庫的冰箱:三洋MDF-U73V
三洋 MDF-U73V 堆放凍存架的情況
(推薦建庫使用該冰箱,VIP 發(fā)泡和緊湊式設計使得該型號的單樣本占地面積全球最小):
第一層配 6 個IR-220、第二層配 6 個IR-224
第三層配 6 個IR-220、第四層配 6 個IR-224
凍存架內(nèi)放置凍存盒的情況
IR-220 可放置20 個標準2 英寸凍存盒
IR-224 可放置24 個標準2 英寸凍存盒

五. 立式/臥式冰箱和液氮罐的定位編號規(guī)則建議

一個標本的位置信息會用AA-BB-CC-DD 表達,
其中 AA 為冰箱編號
BB 為冰箱內(nèi)凍存架排列的行和列編號
CC 為凍存架內(nèi)凍存盒排列的行和列編號
DD 為凍存盒內(nèi)的位置編號
2.臥式冰箱
臥式冰箱的標本位置信息也采用類似于立式冰箱的方式,區(qū)別是臥式冰箱里
的凍存架的高度是用方框內(nèi)的格子表達的。請參考如下:

3. 液氮灌

一個標本的位置信息會用AA-BB-CC-DD 表達,
AA 是液氮灌在整個冰箱/液氮灌的主界面排列中的編號。
BB 是凍存架的編號,可以選擇A…..Z 的編號,也可以選擇01……99 的編號
CC 是凍存架里凍存盒的編號,編號規(guī)格是是從下到上數(shù),從01 到99,因為液氮罐一般都是從下往上放的。
DD 是標本在凍存盒中的編號。凍存盒是通用的,同于冰箱里的凍存盒。

附件A:國內(nèi)外樣本庫的現(xiàn)狀
    國內(nèi)的生物樣本庫,從保存容器上看,目前主要采用的保存方式是超低溫冰箱的保存,部分采用了液氮罐保存,也有很小部分試點了機械臂自動樣本庫(-80)。近年來國際的大型樣本庫,采用機械臂自動保存的逐漸增多。
    -80 度冰箱或者液氮的保存,主要取決于保存時間和最終的實驗方向。一般的認為,-80 度對應的是5-10 年的保存,液氮條件對應的是長期保存。從樣本的研究方向看,DNA 的保存和加了RNA 保護劑的RNA 保存,在-80 度條件下都是可靠的,而如果研究蛋白,則盡量考慮用液氮保存。機械臂樣本庫的保存,目前的設備內(nèi)溫度也是-80 度,由于成本對比極大,所以目前主要應用于高危樣品和非常珍貴的樣品。
    從樣本管形式上看,目前主要的樣本管為1.5-2ml 的凍存管,也有不少為0.5-1.5ml 的離心管,機械臂庫采用的特制的0.5-1.0ml 凍存管。做樣本的長期保存,凍存管比較可靠。
    凍存管根據(jù)外形區(qū)分有兩種,一種是內(nèi)旋的,另外一種是外旋管。同樣容積下內(nèi)旋管的外徑比外旋管的外徑小,所以2ml 內(nèi)旋管可以實現(xiàn)標準2 英寸凍存盒(132*132*52mm)內(nèi)的10*10 存放,而1.8ml 外旋管只能實現(xiàn)9*9 的存放。外旋管的防污染性能較之內(nèi)旋管為好,所以對于高危樣品,一般采用外旋管,如病毒庫。內(nèi)旋管在螺紋緊密度和硅膠墊圈方面會比外旋管較好,所以對于需要浸潤入液氮的凍存管,很多都采用內(nèi)旋管,如組織生物樣本庫的組織樣本。凍存管管壁比離心管厚,制作工藝相對復雜,所以凍存管的成本會比離心管高,由于某些進口離心管的質(zhì)量可靠, -80度條件下可用,所以國內(nèi)用戶在保存血液樣本的時候,很多都采用0.5-1.5ml 的離心管在-80 度條件下保存。選擇離心管的容量主要取決于樣本分管后的容量,1.5ml 離心管可配用標準的9*9 規(guī)格2 英寸凍存盒,而0.5ml 離心管的凍存盒可實現(xiàn)10*10,高度能縮小到2/3。
    國際上的大型樣本庫,還是以凍存管的保存為主。隨著分析儀器的精度升級,對每次分析所需樣本量減小,目前國際上幾大品牌的耗材供應商開始推廣微型凍存管,該凍存管容量為0.5-1.0ml,管徑減小到可適用于96 孔板的孔徑尺寸,配以96 孔的凍存盒,可適用于今后機械化的樣本庫操作,由于產(chǎn)品較新,目前的應用面還不是很廣。從編號識別方面看,目前主要還是以手工書寫標記為主,一些較大型的樣本庫采用了條形碼方案。標簽方案是諸多樣本庫希望實現(xiàn)的方式,實施條形碼管理必然和計算機系統(tǒng)結(jié)合在一起,單純的條形碼標簽的意義并不是很大。
    在小型樣本庫中涉及軟件因素和成本因素,目前國內(nèi)真正應用條形碼的樣本庫還不是很多。大型陣列樣本庫,由于手工標識的諸多問題,所以必須采用條形碼的管理,國際上大型樣本庫基本都采用了條形碼管理方案。條形碼管理首先涉及編號規(guī)則問題,目前沒有非常統(tǒng)一的規(guī)則,不過基本上以滿足唯一性和共享性為原則。條形碼管理還涉及專業(yè)的標簽問題,應該選擇可靠的低溫專用標簽。條形碼管理另外涉及的是一套適用于條形碼的計算機管理系統(tǒng),可以生成標簽以及對應的各處條形碼快捷處理接口。條形碼的碼制,由于二維碼的數(shù)據(jù)容量大,糾錯性較好,所以國際上相關(guān)機構(gòu)推薦的都是二維條形碼。機械臂的樣本庫采用了在凍存管底部預制二維碼的方式。
    從數(shù)據(jù)管理上看,大部分還停留在簡單數(shù)據(jù)庫(EXCEL,ACCESS)時代,部分樣本庫采用了獨立開發(fā)的大容量數(shù)據(jù)庫并和大型數(shù)據(jù)庫做了接口。樣本信息管理是樣本庫中非常重要的部分,由于整體的起步都比較遲,做樣本庫的公司不多,基本都是個性化的特別開發(fā)為主,所以在之前若干年并沒有形成特別通用的樣本庫軟件。國際上幾個大樣本庫基本都采用了自主開發(fā)的樣本庫系統(tǒng),或者是幾個專業(yè)數(shù)據(jù)庫的結(jié)合。如UK Biobank 中樣本庫分成了樣本庫平臺和實驗室數(shù)據(jù)管理平臺的結(jié)合。在大型陣列研究中,也有諸如IBM 這樣的信息咨詢公司的介入。
    從信息共享來看,目前大部分樣本庫采用的是各單位自己的獨立信息登記和設置,沒做共享機制,有部分是基于項目范圍內(nèi)的多區(qū)域可共享?傮w來說,建立公共平臺,制定共享機制,是樣本庫發(fā)展的主流。樣本的交流和共享是提高效率,滿足大樣本量的需求,將樣本利用最大化的重要組成部分。樣本庫的建設正在經(jīng)歷一個從各自為政到資源整合的過程中。國際上,有些大型的整合方案如歐洲的Pan-EU Biobanks 計劃(BBMRI),美國的CAHUB 計劃,也應用而生一些國際組織在積極開展樣本庫的共享整合工作,如ISBER。中國在這方面也做了很多工作,如中國人類遺傳資源庫平臺,中國生物技術(shù)協(xié)會組織生物樣本庫委員會等,目前還有諸多細節(jié)的工作有待于開展。

附件B. 部分實物圖

標識應用案例

附件C.
生物樣本庫編號規(guī)則建議

標本庫編號命名規(guī)則:
總原則:唯一性,共享性
輔原則:在滿足總原則基礎上,盡量精簡。編號長度盡量保持統(tǒng)一。
一.組織生物樣本采集和常規(guī)采集的編號規(guī)則組織編號規(guī)則。

組織編號規(guī)則

標簽類型:BRADY THT-163-499-3-IP 長方形為25.4mm*9.525mm, 圓直徑9.525mm
【組織樣本的編號命名1012345D08TF1,代表該1012345 號病收集的D08 臟器的腫瘤樣本(T腫瘤,P 癌旁,N 正常,M 轉(zhuǎn)移,L 淋巴結(jié),Y 息肉,C 囊壁)用F 方式(Frozen Tissues/OCT/RNAlater/DNA /Paraffin Embedding 等)保存的第一份!

外周血編號規(guī)則

標簽類型:BRADY THT-163-499-3-IP 長方形為25.4mm*9.525mm, 圓直徑9.525mm
【血液樣本的編號命名1012345D19BP1,代表該1012345 號病收集的D19 臟器癌癥的B 血液樣本的P 血漿(Plasma/ Serum / White Blood Cells/ Erythrocyte/ Thrombolytic / DNA/ RNA/whole Blood/等)的第一份。】

其余細胞/體液編號規(guī)則

【如臍血為常規(guī)保留樣本,為區(qū)別用常規(guī)外周血,可對臍血專門設立一個樣本類型,細類可參考外周血的分類】

三.遺傳數(shù)據(jù)庫按家系采集時,建議編號規(guī)則如下

關(guān)系類中,P1 為原始本人第1 代,家系中其余關(guān)系,請自己定義相關(guān)的編號規(guī)則前 7 位樣本編號一致的為同一個體,同一個體的若干不同編號樣本,其個體的基本信息是一致的。

來源:上海萬格生物科技有限公司
聯(lián)系電話:(021)800-820-8831
E-mail:info@avantech.cn

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