銳賽小課堂1217-156
FCM數(shù)據(jù)的存貯的方式是FCS2.0(flow cytometry standard),采用列表排隊(List Mode)方式。易于加工處理分析,但缺乏直觀性,數(shù)據(jù)的顯示通常有一維直方圖、二維點圖、等高線圖、密度圖等幾種;由數(shù)據(jù)還可以做出標準曲線進行定量分析。
Q1:坐標軸的意義?
1、 單參數(shù)直方圖
每一個細胞單參數(shù)的測量數(shù)據(jù)可以整理成統(tǒng)計分布,以直方圖的方式來顯示。在圖中,橫坐標表示熒光信號或散射光信號相對強度的值,其單位是道數(shù)(channel),可以是線形(line)或者對數(shù)(log)?v坐標一般是相對細胞/粒子數(shù)(count)!
2、二維圖
在二維圖的中,橫坐標/縱坐標都表示熒光信號或散射光信號相對強度的值,可以是線形(line)或者對數(shù)(log)。雙參數(shù)圖可以將樣品細胞群分開,從而方便對感興趣的細胞進行分析。
Q2:“Gate”和 “Regin”?
設(shè)門是流式細胞分析中一種重要的技術(shù),只有通過最佳的設(shè)門方式,才能準確地獲取和分析數(shù)據(jù),從而得到臨床診斷和科研中有價值的信息。
On-line gating(threshold gating)監(jiān)測/獲取數(shù)據(jù)
Off-line gating: 分析實驗數(shù)據(jù) 散射光設(shè)門/熒光設(shè)門 散射光/熒光聯(lián)合設(shè)門
多重邏輯門(組合門)多重邏輯門 G3=R1 and R2 (G3=R1×R2)
其它: G=R1 or R2 G=R1 not R2Q3:流式圖中的顏色與熒光顏色?
流式圖中的顏色為區(qū)分不同細胞群而人為指定, 與熒光顏色無關(guān)!!
Q4:流式圖中的陰/陽(N/P)如何劃分?
如何做M1陰性界限?實際上,這個M1的劃分完全是根據(jù)陰性(同型)對照來的!如下圖:左圖為同型對照,即:您所檢測的物質(zhì)在陰性組中的基礎(chǔ)表達量,可以理解為背景、靜息狀態(tài)下、基礎(chǔ)水平、未受刺激時等。右圖即陽性組,也就是接受刺激后,功能狀態(tài)下、藥物作用后等。
Q5: 這么巧,陰性正好在101劃分??
其實, 我們可以人為地將電壓,放大倍數(shù)調(diào)到相應(yīng)的大小,使陰性的右邊界在某一個值上,(通常劃在101附近)這樣后期做sample時好看!當然也可以調(diào)到102,103次方。
Q6:為什么要進行熒光補償?
流式細胞分析中經(jīng)常要用到2種以上的熒光標記抗體進行染色,而目前所使用的多種熒光染料發(fā)射譜間有一定重疊。
“熒光補償”這個術(shù)語是指修正熒光滲漏的過程,如從探測器除去除匹配熒光以外的任何熒光信號。
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