代謝組學(xué)兩種常見圖形制作分享

1.韋恩圖制作
 

分析網(wǎng)站鏈接：http://jvenn.toulouse.inra.fr/app/example.html

首先，進(jìn)行網(wǎng)站，導(dǎo)入下圖箭頭所指相關(guān)案例數(shù)據(jù)。

上圖箭頭所指均可自由編輯哦，這里顯示輸入了6組不同數(shù)據(jù)集（網(wǎng)站目前上限數(shù)據(jù)集為6組哦~）。友情提醒，如果是代謝組學(xué)數(shù)據(jù)，那一般只需導(dǎo)入代謝物質(zhì)名稱或編號就可以啦。
韋恩分析結(jié)果展示如上圖（左），如需調(diào)出右圖中的單組對應(yīng)信息內(nèi)容，則鼠標(biāo)左鍵點(diǎn)擊選中相應(yīng)數(shù)字即可，你說方不方便~
當(dāng)然，如果只要三組數(shù)據(jù)集的韋恩圖展示，那么，我們只需輸入三個對應(yīng)的list數(shù)據(jù)集就可以啦~，這不香嘛~
接下來，還可對圖形進(jìn)一步調(diào)整展示。比如：圖形展現(xiàn)形式、圖形字體類型、大小等，根據(jù)需求靈活調(diào)整就可以了。

最后，調(diào)試好分析出來的圖形和表格結(jié)果進(jìn)行本地下載保存，可千萬別忘了哦~

Tips：如果需要展示的數(shù)據(jù)集超過6組的話，咋辦？給大家推薦一個數(shù)據(jù)集合可視化神包—UpSetR，感興趣的小伙伴們可自行搜索查詢~

2.箱線圖制作

分析代碼包：ggplot2 & ggpubr

以iris數(shù)據(jù)集為例，首先在Rstudio里載入ggplot2和ggpubr兩個包（相關(guān)包安裝教程可參考：http://www.bioconductor.org/install/），同時查看下iris數(shù)據(jù)集的表頭信息，這里選取"Sepal.Length"作為關(guān)注變量來繪制不同組間箱線圖含量表達(dá)展示。