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多組學(xué)揭示USP22調(diào)控肝癌脂代謝紊亂新機(jī)制

瀏覽次數(shù):1778 發(fā)布日期:2022-5-9  來(lái)源:中科新生命

細(xì)胞代謝失調(diào)是癌癥的重要特征之一。脂肪酸和脂質(zhì)作為關(guān)鍵的信號(hào)因子、能量來(lái)源和細(xì)胞膜組成成分,在細(xì)胞增殖中具有關(guān)鍵作用。然而,迄今為止,在肝癌的治療中靶向脂質(zhì)合成的臨床進(jìn)展有限。

2022年4月21日,中國(guó)科學(xué)院大連化學(xué)物理研究所樸海龍團(tuán)隊(duì)、許國(guó)旺團(tuán)隊(duì)和大連醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院譚廣團(tuán)隊(duì)合作在Nature Communications (IF 14.919)雜志上發(fā)表了題為“USP22 regulates lipidome accumulation by stabilizing PPARγ in hepatocellular carcinoma”的研究成果,通過(guò)對(duì)肝癌及癌旁組織進(jìn)行非靶向代謝組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)泛素特異性蛋白酶22(USP22)與脂質(zhì)合成異常上調(diào)密切相關(guān),并進(jìn)一步通過(guò)同位素示蹤、免疫共沉淀、腫瘤異種移植等證實(shí)USP22通過(guò)去泛素化并穩(wěn)定脂肪酸合成關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子PPARγ的表達(dá),進(jìn)而上調(diào)脂肪酸從頭合成并促進(jìn)腫瘤發(fā)生。
 


研究材料

肝癌和癌旁組織;人肝癌細(xì)胞;異種移植腫瘤模型


技術(shù)路線

· 步驟1:HCC脂質(zhì)代謝異常與USP22顯著相關(guān);

· 步驟2:USP22促進(jìn)HCC細(xì)胞脂質(zhì)積累;

· 步驟3:USP22通過(guò)與PPARγ相互作用調(diào)控ACC和ACLY轉(zhuǎn)錄;

· 步驟4:USP22通過(guò)PPARγ上調(diào)ACC和ACLY參與HCC腫瘤發(fā)生;

· 步驟5:USP22-PPARγ/ACC/ACLY與肝癌預(yù)后不良顯著相關(guān)。

 

研究結(jié)果

1. HCC脂質(zhì)代謝異常與USP22顯著相關(guān)

作者采用非靶向代謝組學(xué)方法對(duì)HCC的癌和癌旁組織進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)與癌旁組織相比,癌組織中共有47個(gè)代謝物發(fā)生了顯著改變,其中上調(diào)代謝物主要是脂質(zhì)和類脂分子(22/26)。KEGG通路分析表明癌組織中的差異代謝物主要參與脂質(zhì)生物合成。進(jìn)一步對(duì)癌和癌旁組織中的泛素特異性蛋白酶(USPs)進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)USP22表達(dá)最高,且與脂質(zhì)和類脂分子上調(diào)顯著相關(guān),表明USP22可能參與HCC癌組織中的脂質(zhì)生物學(xué)合成。
 

圖1 高表達(dá)USP22的HCC脂質(zhì)代謝異常

 

2. USP22 促進(jìn)HCC細(xì)胞脂質(zhì)積累

作者分別構(gòu)建了USP22敲低和過(guò)表達(dá)細(xì)胞系,通過(guò)代謝組學(xué)分析共獲得53個(gè)差異代謝物,其中34個(gè)代謝物表達(dá)趨勢(shì)相反,主要參與脂肪酸合成途徑。采用代謝流分析脂肪酸的合成過(guò)程,發(fā)現(xiàn)USP22敲低細(xì)胞中棕櫚酸和硬脂酸標(biāo)記顯著降低,而過(guò)表達(dá)細(xì)胞中標(biāo)記顯著增加。并且USP22過(guò)表達(dá)細(xì)胞中甘油三酯顯著增加。表明USP22在肝細(xì)胞脂質(zhì)含量積累中發(fā)揮關(guān)鍵作用,并可能促進(jìn)肝細(xì)胞中脂肪酸的從頭合成。進(jìn)一步通過(guò)轉(zhuǎn)錄組學(xué)、qPCR和WB分析發(fā)現(xiàn)USP22可以通過(guò)脂肪酸合成關(guān)鍵酶ACC和ACLY的轉(zhuǎn)錄上調(diào)促進(jìn)脂肪酸從頭合成從而積累脂肪酸。

 

圖2 USP22通過(guò)ACC和ACLY的轉(zhuǎn)錄上調(diào)促進(jìn)脂質(zhì)積累

 

3. USP22通過(guò)與PPARγ相互作用調(diào)控ACC和ACLY轉(zhuǎn)錄

作者通過(guò)IP-MS發(fā)現(xiàn)USP22的潛在底物PPARγ——脂質(zhì)代謝轉(zhuǎn)錄因子。此外,在MHCC-97L、HUH7、HepG2、SNU449和Bel-7402細(xì)胞中同樣發(fā)現(xiàn)了USP22的靶蛋白PPARγ。體外pull down實(shí)驗(yàn)再次驗(yàn)證了USP22與PPARγ的直接相互作用。免疫熒光染色結(jié)果顯示USP22和PPARγ主要定位于肝癌細(xì)胞的細(xì)胞核。
 

圖3 USP22與脂質(zhì)代謝關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子PPARγ相互作用


接著,作者進(jìn)一步通過(guò)去泛素化實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),USP22敲低細(xì)胞中PPARγ多泛素化水平顯著升高,而USP22過(guò)表達(dá)細(xì)胞中PPARγ去泛素化作用增強(qiáng)。體外實(shí)驗(yàn)也證明USP22可以顯著促進(jìn)PPARγ去泛素化。并且賴氨酸-169可能是USP22調(diào)控PPARγ去泛素化的重要位點(diǎn)。
 

圖4 USP22的去泛素化作用

 

4. USP22通過(guò)PPARγ上調(diào)ACC和ACLY參與HCC腫瘤發(fā)生

敲低PPARγ或ACC后,葡萄糖示蹤劑對(duì)脂肪酸的標(biāo)記顯著降低;而回補(bǔ)PPARγ顯著增加了USP22敲低細(xì)胞中脂肪酸標(biāo)記。此外,油紅染色也證實(shí)了TG的積累趨勢(shì)。表明USP22通過(guò)穩(wěn)定PPARγ上調(diào)脂肪酸的生物合成。

進(jìn)一步進(jìn)行異種移植瘤分析,發(fā)現(xiàn)過(guò)表達(dá)USP2的小鼠腫瘤更大;而同時(shí)過(guò)表達(dá)USP22并敲除PPARγ、ACC或ACLY的小鼠腫瘤生長(zhǎng)速度較慢。過(guò)表達(dá)USP22的腫瘤中PPARγ、ACC和ACLY表達(dá)上調(diào);過(guò)表達(dá)PPARγ可以恢復(fù)USP22敲低細(xì)胞中ACC和ACLY的表達(dá)。表明過(guò)表達(dá)USP22可以通過(guò)PPARγ介導(dǎo)的ACACA和ACLY的表達(dá)激活體內(nèi)脂肪酸信號(hào)的從頭合成。
 

圖5 USP22通過(guò)PPARγ上調(diào)ACC和ACLY參與HCC的腫瘤發(fā)生

 

5. USP22-PPARγ/ACC/ACLY與肝癌預(yù)后不良顯著相關(guān)

IHC分析顯示肝癌TMAs中USP22的表達(dá)與PPARγ、ACC或ACLY的表達(dá)呈正相關(guān)。并且USP22或PPARγ水平較高的患者總生存期較短;USP22和PPARγ水平均高的患者總體生存期更差。進(jìn)一步利用TCGA數(shù)據(jù)集明確了USP22、PPARγ、ACC和ACLY的高表達(dá)與HCC患者不良預(yù)后的顯著相關(guān)性。
 

圖6 USP22-PPARγ/ACC/ACLY軸與肝癌預(yù)后顯著相關(guān)

 

小編小結(jié)

本研究作者利用轉(zhuǎn)錄組、代謝組和IP-MS等方法,發(fā)現(xiàn)USP22是脂肪酸從頭合成的關(guān)鍵調(diào)控因子,通過(guò)直接與PPARγ相互作用介導(dǎo)ACLY/ACC的表達(dá)調(diào)控脂肪酸從頭合成。此外,在臨床HCC樣本中發(fā)現(xiàn)USP22的高表達(dá)與PPARγ、ACLY或ACC的表達(dá)呈正相關(guān),并與不良預(yù)后相關(guān)。本研究為HCC預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估和基于靶向脂質(zhì)合成的治療提供了理論基礎(chǔ)。

 

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