多重PCR概述
多重PCR(multiplex PCR),又稱(chēng)多重引物PCR或復(fù)合PCR,它是在同一PCR反應(yīng)體系里加上二對(duì)以上引物,同時(shí)擴(kuò)增出多個(gè)核酸片段的PCR反應(yīng),其基本原理與常規(guī)PCR相同,區(qū)別在于多重PCR反應(yīng)體系加入一對(duì)以上引物,各對(duì)引物分別結(jié)合在模板相對(duì)應(yīng)部位,最終擴(kuò)增出一條以上目的DNA片段。
多重PCR的特點(diǎn)
•高效性:在同一PCR反應(yīng)管內(nèi)同時(shí)檢出多種基因,或?qū)τ卸鄠(gè)型別的目的基因進(jìn)行分型,特別是微量樣本的多基因檢測(cè)。
•系統(tǒng)性:多重PCR適宜于成組病原體的檢測(cè),如肝炎病毒,腸道致病性細(xì)菌,性病,無(wú)芽胞厭氧菌,戰(zhàn)傷感染細(xì)菌及細(xì)菌戰(zhàn)劑的同時(shí)偵檢。
•經(jīng)濟(jì)簡(jiǎn)便性:多種病原體在同一反應(yīng)管內(nèi)同時(shí)檢出,將大大的節(jié)省時(shí)間,節(jié)省試劑,節(jié)約經(jīng)費(fèi)開(kāi)支。
多重PCR應(yīng)用
•基因診斷、腫瘤診斷、病原微生物的檢測(cè)。
•基因分型、連鎖分析。
•植物分子育種、基因表達(dá)檢測(cè)、病蟲(chóng)害檢測(cè)。
•病原菌污染檢測(cè)。
•區(qū)域捕獲測(cè)序。
多重PCR之難
多重PCR并不是單純的將多對(duì)特異性引物混合成一個(gè)體系。多重PCR之所以難,在于多個(gè)靶點(diǎn)之間擴(kuò)增條件不兼容,每個(gè)靶點(diǎn)都需要旁邊其他的引物配合。
就像是三人兩足游戲一樣,每個(gè)靶點(diǎn)成功擴(kuò)增都是需要綁在一起的兩個(gè)人(一對(duì)引物)默契配合。而多重PCR就需要所有的選手同時(shí)起跑又同時(shí)到達(dá),并且所有的選手都達(dá)到最優(yōu)發(fā)揮。
多重PCR優(yōu)化
為了達(dá)到更好的擴(kuò)增效果,一般可以通過(guò)以下幾個(gè)方面進(jìn)行優(yōu)化。
◆引物的優(yōu)化:
◆反應(yīng)體系:
◆反應(yīng)條件:
◆常見(jiàn)問(wèn)題解決辦法:
多重PCR要求在同一反應(yīng)體系內(nèi)對(duì)多個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行特異性擴(kuò)增。因而引物間的配對(duì)與競(jìng)爭(zhēng)性擴(kuò)增均會(huì)影響擴(kuò)增效果。如果能選擇合適的反應(yīng)體系、反應(yīng)條件以及更合適的PCR儀,則有望提高多重PCR的擴(kuò)增效果。所以在進(jìn)行多重PCR的時(shí)候,不應(yīng)墨守成規(guī),要根據(jù)自身實(shí)驗(yàn)情況對(duì)實(shí)驗(yàn)條件進(jìn)行不斷優(yōu)化,達(dá)到最佳擴(kuò)增效果。