DNA 編碼化合物庫的構(gòu)建、合成與篩選技術(shù)介紹

瀏覽次數(shù)：1247　發(fā)布日期：2023-10-26　來源：本站　僅供參考，謝絕轉(zhuǎn)載，否則責任自負

　　DNA 編碼化合物庫（DNA Encoded compound Library，DEL）技術(shù)作為新穎、強大的苗頭化合物發(fā)現(xiàn)引擎，可快速從幾千萬至數(shù)十億分子中，遴選出結(jié)構(gòu)新穎、具有潛在成藥性的化合物，大大縮短藥物研究周期，降低研發(fā)成本。在 DEL 庫中，每一個分子砌塊（Building Block）都由一段已知唯一的 DNA 序列進行標記，通過 DNA 兼容反應(yīng)和組合化學模式，歷經(jīng)數(shù)個循環(huán)即可獲得上億 DEL 分子。數(shù)十億化合物可以混合在一管中篩選，最終通過高通量測序技術(shù)，解碼 DEL 分子的專屬 DNA 標簽，快速獲得針對靶點的苗頭化合物信息。

　　圖1. DEL 庫的構(gòu)建和篩選

　　DNA 編碼化合物庫構(gòu)建、合成

　　分子砌塊是 DEL 庫設(shè)計、合成的基礎(chǔ)。基于 50000 余種高質(zhì)量、結(jié)構(gòu)多樣的分子砌塊， MCE 優(yōu)中擇優(yōu)，剔除 DNA 嵌入劑、含 N-鹵代、重金屬等的“不良”化學結(jié)構(gòu)，保留骨架獨特、結(jié)構(gòu)新穎、官能團多樣、化學空間覆蓋范圍廣的化合物。結(jié)合 MCE 自主開發(fā)的數(shù)百種 DNA 兼容性化學反應(yīng)，最終構(gòu)建出化學空間多樣、結(jié)構(gòu)新穎、包含數(shù)十億化合物的 DEL 庫。

　　圖2. DEL 庫的構(gòu)建

　　DEL 庫規(guī)格

　　3 個量級：

　　DEL A Kit：20 個 DEL 庫，3 億個 DEL 分子，1 管集合

　　DEL B Kit：50 個 DEL 庫，10 億個 DEL 分子，1 管集合

　　DEL T Kit：68 個 DEL 庫，20 億個 DEL 分子，1 管集合

　　Mini DEL 庫：

　　DEL C Kit 共價庫：5 個 DEL 庫，0.03 億個 DEL 分子，1 管集合

　　DEL D Kit 環(huán)肽庫：5 個 DEL 庫，0.08 億個 DEL 分子，1 管集合

　　DEL E Kit 常規(guī)庫：5 個 DEL 庫，1.9 億個 DEL 分子，1 管集合

　　DEL F Kit 常規(guī)庫：5 個 DEL 庫，1.09 億個 DEL 分子，1 管集合

　　DEL G Kit 常規(guī)庫：5 個 DEL 庫，1.13 億個 DEL 分子，1 管集合

　　DEL H Kit 常規(guī)庫：10 個 DEL 庫，5.5 億個 DEL 分子，1 管集合

　　2 種規(guī)格：

　　5 nmol、20 nmol

　　DEL 庫優(yōu)點

　　?68 個 DEL 庫，數(shù)十億 DEL 分子

　　化學結(jié)構(gòu)新穎，化學空間覆蓋范圍廣，具備類藥分子特性

　　強大的合成能力

　　嚴格的質(zhì)量控制、驗證體系

　　完善的產(chǎn)品、數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)

　　緊跟研究趨勢，不斷更新

　　DNA 編碼化合物庫定制服務(wù)

　　MCE 不僅可以提供一站式的 DEL 篩選服務(wù)，更有熱門的光交聯(lián) DEL 庫、共價 DEL庫、環(huán)肽 DEL 庫等 DEL 庫供選擇，同時可提供 DEL 庫定制服務(wù)，根據(jù)具體化合物結(jié)構(gòu)類型，快速的衍生合成出數(shù)以百計的 DEL 分子。MCE 擁有強大而專業(yè)的 DEL 合成團隊，緊跟科學前沿開發(fā)了數(shù)百種 DNA 兼容的化合物反應(yīng)。

　　DNA 編碼化合物庫篩選

　　相較于傳統(tǒng)的高通量篩選，DEL 篩選可以一次性篩選數(shù)以億計的化合物；大大節(jié)約靶蛋白的使用量；篩選周期大大縮短；篩選成本更加低廉。DEL 庫的篩選策略基本流程是將 DEL 庫與靶標進行孵育后，基于小分子-蛋白質(zhì)的親和結(jié)合作用力，經(jīng)過不同的洗脫方式，除去非結(jié)合小分子，實現(xiàn)具有高親和力的小分子配體的高倍富集，結(jié)合 PCR 擴增與下一代測序的技術(shù)，可根據(jù)小分子的 DNA 標簽實現(xiàn)化合物信息的解碼。