最近,在《自然》旗下的《細(xì)胞死亡與分化》雜志上,發(fā)表了一篇科學(xué)家找到觸發(fā)細(xì)胞程序性死亡的開關(guān)的文章:美國加州大學(xué)戴維斯分校綜合癌癥中心的一個研究小組確定了CD95受體上一個可導(dǎo)致細(xì)胞死亡的關(guān)鍵表位。CD95受體(也被稱為Fas)是一種位于細(xì)胞膜上的死亡受體,當(dāng)被激活時,它們會釋放出導(dǎo)致細(xì)胞自毀的信號。研究人員表示,他們找到了細(xì)胞毒性Fas信號以及CAR-T抗腫瘤功能的最關(guān)鍵表位。這可能會提供一條以腫瘤中的Fas為靶點的治療途徑。
抗原表位(antigenic epitope),也被稱為抗原決定簇,是抗原分子上可以被特異性抗體識別和結(jié)合的化學(xué)官能團。每一個抗原可能含有多個不同的抗原表位,每個表位都可以與一個特異的抗體結(jié)合。抗原表位分析是一種用于確定抗體或T細(xì)胞受體識別的抗原分子上具體哪一部分(表位)的技術(shù)。這在疫苗設(shè)計、疾病診斷、免疫治療以及基礎(chǔ)免疫學(xué)研究中都是一個關(guān)鍵步驟。抗原表位可以是蛋白質(zhì)或多肽的連續(xù)(線性)序列,也可以是由蛋白質(zhì)折疊后空間上鄰近的非連續(xù)氨基酸殘基構(gòu)成的構(gòu)象表位。
圖1
抗原表位分析在癌癥治療中的應(yīng)用:
在癌癥治療中,抗原表位分析的重要性在于能夠幫助識別那些可以成為免疫系統(tǒng)攻擊目標(biāo)的癌細(xì)胞特異性抗原。了解這些特異性表位對于設(shè)計靶向癌細(xì)胞的免疫療法(如CAR-T細(xì)胞療法、癌癥疫苗)是至關(guān)重要的。
1.癌癥疫苗開發(fā):
通過分析表位來設(shè)計能夠激活針對癌細(xì)胞的免疫反應(yīng)的疫苗。
2.免疫檢查點抑制劑:
發(fā)現(xiàn)可以增強免疫系統(tǒng)對癌細(xì)胞攻擊的新表位,可能有助于設(shè)計更有效的免疫檢查點抑制劑。
3.細(xì)胞治療:
設(shè)計具有特異性T細(xì)胞受體的T細(xì)胞,這些T細(xì)胞能識別并靶向癌細(xì)胞的特定抗原表位。
傳統(tǒng)的抗原表位分析方法是將蛋白質(zhì)抗原降解為小片段,然后通過測序確定抗體的結(jié)合位點。其他技術(shù),如ELISA法、噬菌體隨機肽庫、X-射線晶體學(xué)、核磁共振技術(shù)、氫氘質(zhì)譜技術(shù)和生物信息學(xué)等也為表位分析提供了強大的工具。
基于質(zhì)譜的蛋白測序技術(shù)是分析抗原線性表位的強有力方法,該方法還可用于通過探測具有高親水性、表面可及性、靈活性和抗原性的區(qū)域來識別潛在的線性表位區(qū)域。
與線性表位相比,構(gòu)象表位更難以繪制,氫氘交換質(zhì)譜可以通過檢測抗體結(jié)合對抗原蛋白氫氘交換速率的影響,從而鑒定出抗原的構(gòu)象表位。在氫氘交換過程中,與抗體結(jié)合的抗原區(qū)域會因結(jié)合的遮蔽效應(yīng)而顯示出較慢的交換速率,通過對比抗原單獨與D2O反應(yīng)和抗原與抗體結(jié)合后與D2O反應(yīng)的結(jié)果,可以確定哪些肽段的交換速率受到了抗體的影響,從而確定與抗體結(jié)合的抗原構(gòu)象表位。
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