SRM(Selected Reaction Monitoring,選擇反應(yīng)監(jiān)測)是一種質(zhì)譜技術(shù),主要用于目標(biāo)蛋白質(zhì)或肽段的定量分析。SRM通常使用三重四極桿質(zhì)譜儀(triple quadrupole mass spectrometer)進(jìn)行操作,并且是一種高度敏感且特異性強(qiáng)的技術(shù)。
以下是SRM靶向蛋白質(zhì)組學(xué)檢測的一些基本原理和步驟:
1、目標(biāo)選擇:在實(shí)驗(yàn)開始前,首先需要選擇希望測量的目標(biāo)蛋白質(zhì)或肽段。
2、肽段選擇:為了檢測蛋白質(zhì),通常會選擇代表性的肽段(通常被稱為“肽圖”或“簽名肽”)來進(jìn)行定量。
3、轉(zhuǎn)化為預(yù)定的離子:樣品在質(zhì)譜儀中被電離,并且在第一個四極桿中選擇預(yù)設(shè)的前體離子(precursor ion)。
4、碎裂:選定的前體離子在碰撞細(xì)胞中與惰性氣體碰撞,產(chǎn)生碎片離子。
5、檢測特定碎片離子:在第二個四極桿中,特定的碎片離子被選擇并檢測。這一步提供了SRM的高度特異性。
6、定量:通過測量特定肽段的特定離子的強(qiáng)度,可以定量目標(biāo)蛋白質(zhì)在樣品中的豐度。
圖1. 平行反應(yīng)監(jiān)測(PRM)
由于SRM的高度特異性和靈敏度,它已經(jīng)成為臨床研究和生物標(biāo)志物驗(yàn)證中的一個重要工具。與傳統(tǒng)的非靶向質(zhì)譜蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)相比,SRM提供了更高的定量準(zhǔn)確性,尤其是在低豐度蛋白質(zhì)的情況下。