TMT(Tandem Mass Tag)是一種廣泛應(yīng)用于定量蛋白質(zhì)組學(xué)的技術(shù)。TMT是一種化學(xué)標(biāo)記方法,用于定量蛋白質(zhì)組學(xué)。不同樣本的肽段會(huì)被不同的等同位素標(biāo)簽標(biāo)記。這些標(biāo)簽在質(zhì)譜中具有相同的質(zhì)量,但當(dāng)它們?cè)谫|(zhì)譜儀中被分解時(shí),會(huì)釋放不同的報(bào)告離子。通過(guò)比較這些報(bào)告離子的強(qiáng)度,可以確定肽段在不同樣本中的相對(duì)豐度。
圖1. 基于TMT的蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)工作流程
1、優(yōu)勢(shì):
多路復(fù)用:可以同時(shí)分析多個(gè)樣本,從而加速實(shí)驗(yàn)流程并減少實(shí)驗(yàn)變異性。
精確度:由于使用了特定的標(biāo)簽,可以提高肽段的識(shí)別準(zhǔn)確性。
寬廣的動(dòng)態(tài)范圍:適用于檢測(cè)豐度差異大的蛋白質(zhì)。
2、局限性:
成本:與無(wú)標(biāo)簽方法相比,化學(xué)標(biāo)記可能增加實(shí)驗(yàn)的成本。
比率壓縮:可能由于不完全的離子隔離或干擾物種的共同隔離引起。
樣本處理:需要更多的樣本處理步驟,可能導(dǎo)致樣本損失或引入實(shí)驗(yàn)偏差。
3、應(yīng)用:
TMT技術(shù)廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)組學(xué)研究,特別是在需要定量比較不同條件或處理下的樣本時(shí),如疾病研究、藥物作用機(jī)制研究等。