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組織庫(kù)冷凍樣本管理流程推薦

瀏覽次數(shù):17688 發(fā)布日期:2010-12-20  來(lái)源:上海萬(wàn)格科學(xué)器材有限公司

組織庫(kù)冷凍樣本管理流程推薦
上海萬(wàn)格周學(xué)迅

一. 取材和編號(hào)/標(biāo)簽部分
    在本環(huán)節(jié)進(jìn)行組織和血液的取材,并制作條形碼標(biāo)簽,將樣本進(jìn)行分裝。
1. 取材單:手術(shù)醫(yī)生根據(jù)臨床病例情況在術(shù)前一日通知樣本庫(kù)次日取樣本,同時(shí)在醫(yī)囑中注明需要抽取血樣數(shù)量、種類。樣本庫(kù)根據(jù)次日樣本情況預(yù)先準(zhǔn)備樣本提取單,并預(yù)先定義好流水編號(hào)。樣本提取單上的信息可包含并不僅限于以下內(nèi)容中的一部分:
A. 個(gè)體流水編號(hào)
B. 個(gè)體基本信息:如住院號(hào),病理號(hào),手術(shù)科室,手術(shù)醫(yī)生,病人姓名,性別等
C. 樣本特征信息:如臟器名稱,樣本類型(腫瘤,癌旁,正常,淋巴結(jié),息肉,囊壁),樣本性質(zhì)(原發(fā)/復(fù)發(fā)/轉(zhuǎn)移)等
D. 樣本采集信息:如樣本份量,體積,分管數(shù),術(shù)前/術(shù)后等
E. 診斷信息:如臨床診斷,病理診斷,分化程度,UICC 分期,ICD10/ICDO-3 代碼等
F. 治療信息:如放療,化療,手術(shù)等
G. 生物安全信息:有/無(wú)傳染性
H. 時(shí)間信息:采集時(shí)間,樣本離體時(shí)間,低溫時(shí)間,等
I. 工作人員信息:取材員,記錄員等
J. 以及備注信息。
2. 組織樣本:從手術(shù)室收集組織樣本,填寫取材表。在組織庫(kù)凍存管理軟件上登記部分欄目,如通過(guò)輸入住院號(hào)碼,軟件從HIS 中自動(dòng)調(diào)入該病例的個(gè)體信息(基本信息、臨床信息等)。
如果輸入部分信息,由系統(tǒng)自動(dòng)生成連續(xù)于上次的個(gè)體編號(hào),如選擇臟器名,樣本類型,樣本保存方式,以及分管數(shù),軟件按照規(guī)則生成樣本編號(hào),如1012345D19TF1~ 1012345D19TF4,在對(duì)應(yīng)的樣本信息欄中輸入各分管的樣本采集信息等特性,點(diǎn)擊保存將所有信息存入數(shù)據(jù)庫(kù),同時(shí)自動(dòng)在手術(shù)室的耐液氮的條形碼標(biāo)簽上生成樣本條形碼信息。將離體的組織樣本存入耐液氮凍存管,貼好標(biāo)簽后,在30 分鐘內(nèi)浸入液氮。當(dāng)天樣本采集完成后,使用小型液氮轉(zhuǎn)移罐或者冰盒將樣本轉(zhuǎn)移到實(shí)驗(yàn)室。
【組織樣本的編號(hào)命名1012345D19TF1,代表該1012345 號(hào)病收集的D19 臟器的癌旁樣本(T
腫瘤,P 癌旁,N 正常,L 淋巴結(jié),Y 息肉,C 囊壁)用F 方式(Frozen Tissues/OCT/
RNAlater/DNA/Paraffin embedding 等)保存的第一份!

3. 血液樣本:各科室分別將血液樣本送樣本庫(kù),附血液取材表,填寫取材表信息,取材表上分管數(shù)留空。按不同原發(fā)病灶臟器名稱,對(duì)樣本和取材單歸類,每類按序排放。
a. 打印標(biāo)簽:通過(guò)輸入住院號(hào)將個(gè)體信息導(dǎo)入組織庫(kù)凍存管理軟件,之后將取材單上的流水編號(hào)和臟器名稱輸入軟件,同時(shí)輸入不同成份對(duì)應(yīng)的預(yù)設(shè)管數(shù),按照規(guī)則自動(dòng)生成樣本編號(hào),如1012345D19BP1~1012345D19BP5,自動(dòng)在實(shí)驗(yàn)室的條碼打印機(jī)上生成耐-80 度標(biāo)簽。
b. 將標(biāo)簽貼到EP 管上,按序在離心管架上排好。
c. 將血液樣本進(jìn)行離心分血處理,對(duì)每種成份按預(yù)設(shè)的分管數(shù)分裝成若干份,存入預(yù)先排好的離心管,存入時(shí)核對(duì)一下編號(hào)。
【以上方法為先貼標(biāo)簽再分血的程序,也可以考慮先分管再貼標(biāo)簽,流程如下:將血樣樣本進(jìn)行離心分血處理,按需對(duì)不同成份存入EP 管,按樣本類型排序放好,在EP 管蓋上手工寫上取材表上的個(gè)體流水號(hào),同時(shí)在取材單上登記不同成份樣本的確切分管數(shù)。完成后,根據(jù)取材單上的信息,通過(guò)軟件輸入相關(guān)信息,按照規(guī)則自動(dòng)生成耐-80 度的條形碼標(biāo)簽。按順序?qū)⒄x心管貼好標(biāo)簽,再送-80 度凍存。】
【血液樣本的編號(hào)命名1012345D19BP1,代表該1012345 號(hào)病收集的D19 臟器癌癥的B 血液
樣本的P 血漿(Plasma/ Serum / White Blood Cells/ Erythrocyte/ Thrombolytic / DNA/ RNA/whole Blood/等)的第一份!
注:如今后存儲(chǔ)細(xì)胞混懸液、分泌物、排泄物等類型樣本時(shí),編號(hào)規(guī)則參考附表2。

二. 樣本入庫(kù)部分
    在本環(huán)節(jié)將條碼凍存管按照預(yù)先分配的位置信息存入條碼凍存盒。通過(guò)對(duì)凍存管條形碼的掃描,實(shí)現(xiàn)軟件上的同步存入。
4. 在-80 度臥式冰箱里進(jìn)行樣本分類整理,按不同臟器將條碼凍存管存入條碼凍存盒,存入時(shí)通過(guò)對(duì)條碼的掃描,確定凍存管和凍存盒之間的位置關(guān)系,實(shí)現(xiàn)軟件上的同步信息定位。將凍存盒存入-80 度臥式冰箱的對(duì)應(yīng)位置時(shí),也通過(guò)對(duì)凍存盒條形碼的掃描在軟件上實(shí)現(xiàn)同步存入。
建議按照原發(fā)臟器名稱進(jìn)行樣本歸類存儲(chǔ),每個(gè)凍存盒內(nèi)裝同一種臟器同一種類型的樣本,不同類型的樣本存入不同顏色的凍存盒(如分成血清,血漿,白細(xì)胞,冷凍組織,RNALATER,細(xì)胞組學(xué))。
為更便于使用,并且減少使用時(shí)的凍融次數(shù),建議同一臟器同一類型樣本的不同份數(shù),存入不同的凍存盒。
建議預(yù)先規(guī)劃凍存盒的存放位置,在凍存盒放入臥式整理冰箱之前,已經(jīng)預(yù)先貼好了標(biāo)簽,其中包含臟器名稱,樣本類型和位置編號(hào)。等凍存盒存滿后,可另貼一個(gè)標(biāo)簽注明內(nèi)部的凍存管的流水編號(hào)起止。
5. 在臥式整理冰箱里任一病種的凍存盒存滿后,轉(zhuǎn)移到預(yù)先規(guī)劃好位置的供長(zhǎng)期存儲(chǔ)的立式-80度超低溫冰箱(如不同層架規(guī)劃給不同的臟器),將凍存盒進(jìn)行轉(zhuǎn)移的時(shí)候,通過(guò)對(duì)凍存盒條形碼的掃描,實(shí)現(xiàn)軟件上的同步的位置搬移。

三. 信息關(guān)聯(lián)部分
6. 樣本的個(gè)體信息關(guān)聯(lián)導(dǎo)入:
    樣本的個(gè)體信息,可以在以上第2 第3 點(diǎn)制作標(biāo)簽的環(huán)節(jié)通過(guò)HIS 關(guān)聯(lián)直接導(dǎo)入。如果無(wú)法實(shí)現(xiàn)HIS 接口的導(dǎo)入,可以通過(guò)定期用EXCEL 格式轉(zhuǎn)導(dǎo)入。
    通過(guò)住院號(hào)或者病理號(hào),從醫(yī)院信息系統(tǒng)(HIS)里將樣本個(gè)體來(lái)源對(duì)應(yīng)的信息(基本信息,病史,病程,診斷信息,病理信息,檢驗(yàn)信息,治療信息,電子病例信息等)以 “.xls” (EXCEL文件格式)導(dǎo)出,然后將相關(guān)信息導(dǎo)入到凍存管理軟件,通過(guò)住院號(hào)將凍存管上的編號(hào)和樣本個(gè)體來(lái)源的信息進(jìn)行關(guān)聯(lián)。
7. 將樣本的后期管理信息錄入系統(tǒng)?赏ㄟ^(guò)直接登記或者接口導(dǎo)入的方法,在凍存管理軟件上錄入樣本的關(guān)聯(lián)信息,如治療結(jié)果,家系資料,流行病學(xué)資料,隨訪資料等。
8. 組織/血液樣本的匹配:在凍存管理系統(tǒng)中設(shè)置關(guān)聯(lián)欄目,如就診卡號(hào),住院號(hào)或身份證號(hào)等,如果某例樣本既有血液又有組織,則系統(tǒng)自動(dòng)匹配樣本,建立信息關(guān)聯(lián)并提示匹配樣本數(shù)量。

四. 出庫(kù)管理和日常操作部分
9. 樣本的使用和管理中的幾個(gè)細(xì)節(jié)
1) 通過(guò)凍存管理軟件,進(jìn)行各種預(yù)定條件的查詢,統(tǒng)計(jì),分析和出入庫(kù)管理。
2) 在冰箱中的樣本盒內(nèi)空位較多時(shí),計(jì)算機(jī)主界面上用不同顏色顯示對(duì)應(yīng)凍存盒的存儲(chǔ)空置情況,可對(duì)對(duì)應(yīng)凍存盒進(jìn)行并位管理,整理出空的位置可供新的樣本存入。
3) 出庫(kù)時(shí),通過(guò)條形碼掃描實(shí)現(xiàn)快速信息處理。
4) 設(shè)立賬號(hào)層級(jí)權(quán)限,對(duì)樣本設(shè)置重要性權(quán)限級(jí)別,對(duì)樣本的某些信息字段也設(shè)置權(quán)限級(jí)別。權(quán)限除了操作功能限定,還和樣本重要性級(jí)別掛鉤。例如:現(xiàn)場(chǎng)取材賬戶只能制作標(biāo)簽和錄入取材基本信息;樣本管理人員可以查詢樣本的信息并進(jìn)行入庫(kù)操作,也可執(zhí)行出庫(kù),;樣本庫(kù)主管賬號(hào)可統(tǒng)計(jì)分析樣本庫(kù)信息,并審批出庫(kù);授權(quán)的訪問(wèn)賬號(hào)可以查詢得知庫(kù)內(nèi)現(xiàn)有的符合某些對(duì)應(yīng)基本信息的樣本數(shù)量,或者看到樣本基本信息,卻無(wú)法看到姓名等隱私字段。
10. 樣本庫(kù)標(biāo)識(shí)建議
在冰箱外門上貼上磁性凍存架模擬標(biāo)識(shí),并在對(duì)應(yīng)的空格位置上填寫凍存盒的信息。例如凍存盒內(nèi)樣本名稱,凍存盒編號(hào),凍存盒內(nèi)樣本編號(hào)起止等。
這樣,在打開(kāi)冰箱門之前,對(duì)內(nèi)部的樣本基本情況也能一目了然。
注:【根據(jù)某些樣本最終的實(shí)驗(yàn)要求,可能需要設(shè)計(jì)不同的存儲(chǔ)流程,比如有些需要做蛋白實(shí)驗(yàn)的樣
本,直接存入液氮罐或者-150 度冰箱保存,不經(jīng)過(guò)整理冰箱這個(gè)環(huán)節(jié);又比如對(duì)需要做細(xì)胞和組織培養(yǎng)的樣本,為保證樣本的質(zhì)量,需要先存入-40 度冰箱后再轉(zhuǎn)入-80 再存入-150 度超低溫冰箱,或者采用程序冷凍儀進(jìn)行冷凍】
五. 樣本保存圖示說(shuō)明
A. 組織編號(hào)規(guī)則和標(biāo)簽

B. 外周血編號(hào)規(guī)則和標(biāo)簽

標(biāo)簽類型:BRADY THT-163-499-3-IP 長(zhǎng)方形為25.4mm*9.525mm, 圓直徑9.525mm
C.標(biāo)簽說(shuō)明:以上方案設(shè)計(jì)中,條碼打印機(jī)和標(biāo)簽使用美國(guó)的BRADY 產(chǎn)品,標(biāo)簽建議使用THT-163-499,該標(biāo)簽可以適用-196 度。標(biāo)簽長(zhǎng)方部分可打印條形碼和編號(hào),單位logo,以及若干條樣本的信息項(xiàng)(如臟器名稱,ICDO-3 編號(hào),樣本類型,采集日期等),可貼于凍存管和離心管的側(cè)壁,標(biāo)簽的圓點(diǎn)部分可以打印流水號(hào)、臟器名稱和采集日期,可貼于凍存管和離心管的頂蓋部分,以便于核對(duì)。編號(hào)規(guī)則,參見(jiàn)附表2 或訪問(wèn)www.avantech.cn/code.pdf
D. 凍存管/離心管貼了條碼標(biāo)簽后的情況如下:

E. 在凍存盒上貼上標(biāo)簽,并注明凍存盒的位置編號(hào)。

F. 按照樣本類型,進(jìn)行凍存盒分色存放

G. 同一臟器同一類型樣本不同份分入不同凍存盒存放,同一臟器不同類型分成不同顏色凍存盒,同一臟器所有盒子存入同一凍存架,在樣本處理室內(nèi)的臥式超低溫冰箱里整理,某一盒存滿后,再轉(zhuǎn)移入樣本儲(chǔ)存室的大型立式超低溫冰箱。

H. 立式超低溫冰箱按照不同臟器,預(yù)先規(guī)劃位置。
所有放到臥式冰箱里整理的凍存盒上,已經(jīng)預(yù)先貼好了標(biāo)簽,標(biāo)簽上包含這個(gè)凍存盒最終將存入超低溫冰箱的位置信息。

附件一:組織庫(kù)冷凍保存容器的基本情況
一. 組織庫(kù)冷凍保存管的常見(jiàn)形態(tài)與保存溫度。
組織:凍存管保存(以內(nèi)旋凍存管為多),常保存于-80 度/-150 度冰箱或液氮,也有很多單位將部分組織以RNAlater 浸潤(rùn)后保存于-30 度或-80 度條件,此外也有OCT 包埋,蠟塊等組織保存形態(tài)。在條件允許的情況下,盡量保留T/P/N 三種形態(tài)的樣本。
推薦用內(nèi)旋凍存管,一組TPN 保留于-150 度冰箱,兩組TPN 保留于-80 度冰箱,一組TPN 保留于RNAlater
血液:凍存管或離心管保存,常保存于-80 度條件下。
血液應(yīng)進(jìn)行分離,并以血液組分的形式單獨(dú)保存,常見(jiàn)保存的有血漿,血清,白細(xì)胞,也有保存紅細(xì)胞,血沉棕黃層的,也有分離出淋巴細(xì)胞保存的。推薦用0.5ml 離心管保存5 份血清,5 份血漿,1~2 份淋巴細(xì)胞從樣本管的容積上看,越來(lái)越有細(xì)分化的趨勢(shì),這一趨勢(shì)也是為了最大化地方便樣本使用和改善樣本質(zhì)量(減少凍融次數(shù)),目前常規(guī)都存儲(chǔ)在0.5-2ml 的樣本管內(nèi)。

二.組織庫(kù)凍存盒的常見(jiàn)形態(tài)
    凍存盒是存放樣本管的最基礎(chǔ)容器,選擇好凍存盒,可以給存儲(chǔ)樣本帶來(lái)方便,也可以合理利用冰箱存儲(chǔ)空間,所以顯得重要。
    由于目前主流超低溫冰箱/液氮罐的內(nèi)空間設(shè)計(jì),都是以2 英寸凍存盒為基準(zhǔn)設(shè)計(jì)的,所以選擇的凍存盒尺寸應(yīng)盡量采用標(biāo)準(zhǔn)尺寸:132*132*52。
     在滿足該尺寸的條件下,有兩種規(guī)格的凍存盒,一種為9*9,一種為10*10。9*9 規(guī)格最為常見(jiàn),適用于各品牌各種規(guī)格的1.5-2ml 樣本管。而10*10 僅適用于某些品牌的內(nèi)旋2ml 凍存管,以及部分特制的1.5ml 外旋凍存管。在選擇凍存盒的時(shí)候需要注意該點(diǎn)。0.5ml 離心管對(duì)應(yīng)的凍存盒,10*10 規(guī)格的情況下,長(zhǎng)寬尺寸和標(biāo)準(zhǔn)2ml 凍存盒相同,高度可以減小到2/3 以增加內(nèi)凍存盒容量。從凍存盒材料上看,市場(chǎng)上主要有紙質(zhì),PP,PC 幾種材料。PC 塑料凍存盒能兼容冰箱和液氮罐,可惜成本太高,PP 塑料凍存盒在液氮條件下會(huì)脆裂,紙質(zhì)凍存盒能適用液氮,不過(guò)在應(yīng)用于液氮液相時(shí)需要預(yù)先打孔。
    常規(guī)紙質(zhì)凍存盒不防水,上海萬(wàn)格科學(xué)器材有限公司專利的翻蓋型凍存盒既解決了防水問(wèn)題,又解決了編號(hào)定位問(wèn)題,翻蓋設(shè)計(jì)還解決了低溫條件下開(kāi)蓋困難的問(wèn)題,是目前制作最好的紙質(zhì)凍存盒。目前國(guó)內(nèi)大型組織生物樣本庫(kù)都使用了該類型凍存盒。

三.冰箱內(nèi)存放凍存架凍存盒的常見(jiàn)形態(tài)
1. 立式超低溫冰箱內(nèi)放置凍存架的方法
2.立式凍存架內(nèi)放置凍存盒的方法:

3. 臥式低溫冰箱存放凍存盒的情況

4. 凍存架的選擇:
    常規(guī)的不銹鋼凍存架,按材料分,有SUS-304 或SUS-201 的0.4-1.0mm 厚度不銹鋼材料制作,類型分,有抽屜型凍存架和框式凍存架。因?yàn)椴讳P鋼材料和工藝的不同,所以價(jià)格差距比較大。
Avantech 品牌CryoMaxTM 系列凍存架,全部采用SUS-304 有3 種系列,覆蓋各種需求。
    IR 常規(guī)系列凍存架采用和進(jìn)口凍存架同等的模具,使用0.75mm 厚度SUS-304 不銹鋼使用沖模將背板一次沖壓翻邊成型,是目前國(guó)內(nèi)制作最好的凍存架。
    IR-CN 系列凍存架采用0.4mm 厚度SUS-304 不銹鋼,對(duì)切口做翻邊處理,是實(shí)惠型的輕質(zhì)凍存架,比市場(chǎng)上常見(jiàn)的SUS-201 制作的凍存架更耐腐蝕。
    IR-D 系列凍存架是采用0.4mm-1.0mm 多種材料混合制作的抽屜型凍存架。

四. 超低溫冰箱的考慮因素
1. 冰箱類型。
    超低溫冰箱有立式和臥式之分,溫度有-80 度和-150 度。目前市面上-150 度冰箱都是臥式。臥式冰箱優(yōu)點(diǎn)是開(kāi)門冷氣散發(fā)較小,缺點(diǎn)是占地面積大,立式冰箱正好相反。所以大規(guī)模建庫(kù)的情況下,推薦使用立式冰箱做大規(guī)模存儲(chǔ),而臥式冰箱做經(jīng)常開(kāi)關(guān)門的整理冰箱用。
2. 面積規(guī)劃。
    由于建組織庫(kù),冰箱會(huì)越來(lái)越多,所以選擇冰箱的時(shí)候需要規(guī)劃單樣本的占地面積事宜。有三個(gè)因素會(huì)與此有關(guān)
A. 冰箱保溫發(fā)泡材料:采用VIP 發(fā)泡技術(shù)的冰箱對(duì)建庫(kù)來(lái)說(shuō)顯得更有優(yōu)勢(shì),該技術(shù)將140mm 厚的外壁降低到70mm 厚,使得冰箱占地面積大大縮小。
B. 冰箱容量越大,單標(biāo)本占地面積越小。
C. 內(nèi)部空間設(shè)計(jì)越緊湊,單標(biāo)本占地面積越小。
    根據(jù)以上3 個(gè)因素,目前全球單標(biāo)本占地面積最小的是S 品牌的MDF-U73V。其在0.9 平方不到的空間內(nèi)可放置528 個(gè)標(biāo)準(zhǔn)凍存盒。比同類型的其余品牌單樣本占地面積小約30%
3. 用電和成本因素。
    由于 500 升的冰箱和700 升的冰箱,耗電幾乎是一致的,所以對(duì)于單標(biāo)本的耗電量來(lái)說(shuō),大容量的冰箱比較劃算。從成本上算,大容量冰箱的單樣本平攤設(shè)備成本會(huì)比小容量冰箱要低,同時(shí),10 年的耗電量也低。
4. 安全保護(hù)裝置。
    冰箱的安全保護(hù)涉及四個(gè)內(nèi)容:1 是斷電時(shí)的保護(hù) 2 是斷電后重新恢復(fù)電力時(shí)的保護(hù)3 是運(yùn)行期間的穩(wěn)壓保護(hù)4 是使用機(jī)制
1) 斷電條件下的保護(hù)一般有兩種方式:A. UPS B. LCO2/LN2 輔助冷卻裝置UPS 當(dāng)前成本較高,并沒(méi)有大規(guī)模使用。若干年后可能會(huì)有一種UPS 方式是夜間給UPS充電,白天UPS 給設(shè)備供電,利用電價(jià)峰谷差進(jìn)行,根據(jù)目前的UPS 和用電成本,該方式從經(jīng)濟(jì)效應(yīng)上來(lái)說(shuō)是不合算的。
    CO2/LN2 輔助冷卻裝置又叫后備制冷系統(tǒng)(BACKUP SYSTEM),采用一種在冰箱內(nèi)溫度上升時(shí),機(jī)械感溫裝置觸動(dòng)電磁閥的開(kāi)啟,向冰箱內(nèi)注入液態(tài)CO2/液態(tài)N2 的輔助冷卻方式。輔助冷卻系統(tǒng)在設(shè)備故障或者斷電情況下可維持10 小時(shí)左右,具體時(shí)長(zhǎng)根據(jù)設(shè)置溫度和鋼瓶容量會(huì)有所不同, CO2 輔助冷卻適用于-80 冰箱,一般情況下可使箱內(nèi)維持在-65~-70 度左右,而LN2 適用于-150 度超低溫冰箱,能使箱內(nèi)維持在-130 度以下。CO2輔助冷卻裝置使用帶虹吸管的液態(tài)CO2 鋼瓶,LN2 輔助冷卻裝置使用自增壓的液氮罐,該液氮罐會(huì)有LN2 的自然損耗。
2) 斷電后重新恢復(fù)電力的時(shí)候,由于冰箱壓縮機(jī)的啟動(dòng)電流較大,所以一批冰箱同時(shí)重啟的時(shí)候,會(huì)對(duì)電力負(fù)荷造成二次沖擊,所以需要對(duì)每臺(tái)冰箱設(shè)置不同的延時(shí)啟動(dòng)。目前市場(chǎng)上有冰箱是自帶延時(shí)啟動(dòng)設(shè)置功能的。
3) 在電壓不穩(wěn)定的地區(qū),需要使用穩(wěn)壓保護(hù)裝置
4) 使用機(jī)制方面,涉及掛鎖,電子密碼鎖,冰箱溫度監(jiān)控報(bào)警系統(tǒng),樣品室門禁監(jiān)控系統(tǒng),樣品信息安全機(jī)制等。
5.冰箱的推薦
常見(jiàn)凍存盒保存樣品管情況對(duì)照表

 型號(hào) 類型   內(nèi)部分格  尺寸mm  適用冷凍管
 IRBOX-2081  上下蓋型  9*9  132×132×52

 所有品牌1.5-2.0ml 內(nèi)外旋凍存管,

1.5ml 各品牌EP管

 IRBOX-2281  翻蓋型  9*9  132×132×52  
 IRBOX-2100  翻蓋型  10*10  134×134×52  所有品牌1.8-2.0ml 內(nèi)旋凍存管,
AVANTEH 牌1.6ml 外旋凍存管OCT-160S,
Nalgene 牌1.0ml 外旋凍存管
 IRBOX-1100  翻蓋型  10*10  132×132×35  0.5-0.6ml 各品牌EP 管

推薦最適用于建庫(kù)的冰箱:三洋MDF-U73V
三洋 MDF-U73V 堆放凍存架的情況
(推薦建庫(kù)使用該冰箱,VIP 發(fā)泡和緊湊式設(shè)計(jì)使得該型號(hào)的單樣本占地面積全球最。
第一層配 6 個(gè)IR-220、第二層配 6 個(gè)IR-224
第三層配 6 個(gè)IR-220、第四層配 6 個(gè)IR-224
凍存架內(nèi)放置凍存盒的情況
IR-220 可放置20 個(gè)標(biāo)準(zhǔn)2 英寸凍存盒
IR-224 可放置24 個(gè)標(biāo)準(zhǔn)2 英寸凍存盒

五. 立式/臥式冰箱和液氮罐的定位編號(hào)規(guī)則建議

一個(gè)標(biāo)本的位置信息會(huì)用AA-BB-CC-DD 表達(dá),
其中 AA 為冰箱編號(hào)
BB 為冰箱內(nèi)凍存架排列的行和列編號(hào)
CC 為凍存架內(nèi)凍存盒排列的行和列編號(hào)
DD 為凍存盒內(nèi)的位置編號(hào)
2.臥式冰箱
臥式冰箱的標(biāo)本位置信息也采用類似于立式冰箱的方式,區(qū)別是臥式冰箱里
的凍存架的高度是用方框內(nèi)的格子表達(dá)的。請(qǐng)參考如下:

3. 液氮灌

一個(gè)標(biāo)本的位置信息會(huì)用AA-BB-CC-DD 表達(dá),
AA 是液氮灌在整個(gè)冰箱/液氮灌的主界面排列中的編號(hào)。
BB 是凍存架的編號(hào),可以選擇A…..Z 的編號(hào),也可以選擇01……99 的編號(hào)
CC 是凍存架里凍存盒的編號(hào),編號(hào)規(guī)格是是從下到上數(shù),從01 到99,因?yàn)橐旱抟话愣际菑南峦戏诺摹?BR>DD 是標(biāo)本在凍存盒中的編號(hào)。凍存盒是通用的,同于冰箱里的凍存盒。

附件A:國(guó)內(nèi)外樣本庫(kù)的現(xiàn)狀
    國(guó)內(nèi)的生物樣本庫(kù),從保存容器上看,目前主要采用的保存方式是超低溫冰箱的保存,部分采用了液氮罐保存,也有很小部分試點(diǎn)了機(jī)械臂自動(dòng)樣本庫(kù)(-80)。近年來(lái)國(guó)際的大型樣本庫(kù),采用機(jī)械臂自動(dòng)保存的逐漸增多。
    -80 度冰箱或者液氮的保存,主要取決于保存時(shí)間和最終的實(shí)驗(yàn)方向。一般的認(rèn)為,-80 度對(duì)應(yīng)的是5-10 年的保存,液氮條件對(duì)應(yīng)的是長(zhǎng)期保存。從樣本的研究方向看,DNA 的保存和加了RNA 保護(hù)劑的RNA 保存,在-80 度條件下都是可靠的,而如果研究蛋白,則盡量考慮用液氮保存。機(jī)械臂樣本庫(kù)的保存,目前的設(shè)備內(nèi)溫度也是-80 度,由于成本對(duì)比極大,所以目前主要應(yīng)用于高危樣品和非常珍貴的樣品。
    從樣本管形式上看,目前主要的樣本管為1.5-2ml 的凍存管,也有不少為0.5-1.5ml 的離心管,機(jī)械臂庫(kù)采用的特制的0.5-1.0ml 凍存管。做樣本的長(zhǎng)期保存,凍存管比較可靠。
    凍存管根據(jù)外形區(qū)分有兩種,一種是內(nèi)旋的,另外一種是外旋管。同樣容積下內(nèi)旋管的外徑比外旋管的外徑小,所以2ml 內(nèi)旋管可以實(shí)現(xiàn)標(biāo)準(zhǔn)2 英寸凍存盒(132*132*52mm)內(nèi)的10*10 存放,而1.8ml 外旋管只能實(shí)現(xiàn)9*9 的存放。外旋管的防污染性能較之內(nèi)旋管為好,所以對(duì)于高危樣品,一般采用外旋管,如病毒庫(kù)。內(nèi)旋管在螺紋緊密度和硅膠墊圈方面會(huì)比外旋管較好,所以對(duì)于需要浸潤(rùn)入液氮的凍存管,很多都采用內(nèi)旋管,如組織生物樣本庫(kù)的組織樣本。凍存管管壁比離心管厚,制作工藝相對(duì)復(fù)雜,所以凍存管的成本會(huì)比離心管高,由于某些進(jìn)口離心管的質(zhì)量可靠, -80度條件下可用,所以國(guó)內(nèi)用戶在保存血液樣本的時(shí)候,很多都采用0.5-1.5ml 的離心管在-80 度條件下保存。選擇離心管的容量主要取決于樣本分管后的容量,1.5ml 離心管可配用標(biāo)準(zhǔn)的9*9 規(guī)格2 英寸凍存盒,而0.5ml 離心管的凍存盒可實(shí)現(xiàn)10*10,高度能縮小到2/3。
    國(guó)際上的大型樣本庫(kù),還是以凍存管的保存為主。隨著分析儀器的精度升級(jí),對(duì)每次分析所需樣本量減小,目前國(guó)際上幾大品牌的耗材供應(yīng)商開(kāi)始推廣微型凍存管,該凍存管容量為0.5-1.0ml,管徑減小到可適用于96 孔板的孔徑尺寸,配以96 孔的凍存盒,可適用于今后機(jī)械化的樣本庫(kù)操作,由于產(chǎn)品較新,目前的應(yīng)用面還不是很廣。從編號(hào)識(shí)別方面看,目前主要還是以手工書(shū)寫標(biāo)記為主,一些較大型的樣本庫(kù)采用了條形碼方案。標(biāo)簽方案是諸多樣本庫(kù)希望實(shí)現(xiàn)的方式,實(shí)施條形碼管理必然和計(jì)算機(jī)系統(tǒng)結(jié)合在一起,單純的條形碼標(biāo)簽的意義并不是很大。
    在小型樣本庫(kù)中涉及軟件因素和成本因素,目前國(guó)內(nèi)真正應(yīng)用條形碼的樣本庫(kù)還不是很多。大型陣列樣本庫(kù),由于手工標(biāo)識(shí)的諸多問(wèn)題,所以必須采用條形碼的管理,國(guó)際上大型樣本庫(kù)基本都采用了條形碼管理方案。條形碼管理首先涉及編號(hào)規(guī)則問(wèn)題,目前沒(méi)有非常統(tǒng)一的規(guī)則,不過(guò)基本上以滿足唯一性和共享性為原則。條形碼管理還涉及專業(yè)的標(biāo)簽問(wèn)題,應(yīng)該選擇可靠的低溫專用標(biāo)簽。條形碼管理另外涉及的是一套適用于條形碼的計(jì)算機(jī)管理系統(tǒng),可以生成標(biāo)簽以及對(duì)應(yīng)的各處條形碼快捷處理接口。條形碼的碼制,由于二維碼的數(shù)據(jù)容量大,糾錯(cuò)性較好,所以國(guó)際上相關(guān)機(jī)構(gòu)推薦的都是二維條形碼。機(jī)械臂的樣本庫(kù)采用了在凍存管底部預(yù)制二維碼的方式。
    從數(shù)據(jù)管理上看,大部分還停留在簡(jiǎn)單數(shù)據(jù)庫(kù)(EXCEL,ACCESS)時(shí)代,部分樣本庫(kù)采用了獨(dú)立開(kāi)發(fā)的大容量數(shù)據(jù)庫(kù)并和大型數(shù)據(jù)庫(kù)做了接口。樣本信息管理是樣本庫(kù)中非常重要的部分,由于整體的起步都比較遲,做樣本庫(kù)的公司不多,基本都是個(gè)性化的特別開(kāi)發(fā)為主,所以在之前若干年并沒(méi)有形成特別通用的樣本庫(kù)軟件。國(guó)際上幾個(gè)大樣本庫(kù)基本都采用了自主開(kāi)發(fā)的樣本庫(kù)系統(tǒng),或者是幾個(gè)專業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)的結(jié)合。如UK Biobank 中樣本庫(kù)分成了樣本庫(kù)平臺(tái)和實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù)管理平臺(tái)的結(jié)合。在大型陣列研究中,也有諸如IBM 這樣的信息咨詢公司的介入。
    從信息共享來(lái)看,目前大部分樣本庫(kù)采用的是各單位自己的獨(dú)立信息登記和設(shè)置,沒(méi)做共享機(jī)制,有部分是基于項(xiàng)目范圍內(nèi)的多區(qū)域可共享?傮w來(lái)說(shuō),建立公共平臺(tái),制定共享機(jī)制,是樣本庫(kù)發(fā)展的主流。樣本的交流和共享是提高效率,滿足大樣本量的需求,將樣本利用最大化的重要組成部分。樣本庫(kù)的建設(shè)正在經(jīng)歷一個(gè)從各自為政到資源整合的過(guò)程中。國(guó)際上,有些大型的整合方案如歐洲的Pan-EU Biobanks 計(jì)劃(BBMRI),美國(guó)的CAHUB 計(jì)劃,也應(yīng)用而生一些國(guó)際組織在積極開(kāi)展樣本庫(kù)的共享整合工作,如ISBER。中國(guó)在這方面也做了很多工作,如中國(guó)人類遺傳資源庫(kù)平臺(tái),中國(guó)生物技術(shù)協(xié)會(huì)組織生物樣本庫(kù)委員會(huì)等,目前還有諸多細(xì)節(jié)的工作有待于開(kāi)展。

附件B. 部分實(shí)物圖

標(biāo)識(shí)應(yīng)用案例

附件C.
生物樣本庫(kù)編號(hào)規(guī)則建議

標(biāo)本庫(kù)編號(hào)命名規(guī)則:
總原則:唯一性,共享性
輔原則:在滿足總原則基礎(chǔ)上,盡量精簡(jiǎn)。編號(hào)長(zhǎng)度盡量保持統(tǒng)一。
一.組織生物樣本采集和常規(guī)采集的編號(hào)規(guī)則組織編號(hào)規(guī)則。

組織編號(hào)規(guī)則

標(biāo)簽類型:BRADY THT-163-499-3-IP 長(zhǎng)方形為25.4mm*9.525mm, 圓直徑9.525mm
【組織樣本的編號(hào)命名1012345D08TF1,代表該1012345 號(hào)病收集的D08 臟器的腫瘤樣本(T腫瘤,P 癌旁,N 正常,M 轉(zhuǎn)移,L 淋巴結(jié),Y 息肉,C 囊壁)用F 方式(Frozen Tissues/OCT/RNAlater/DNA /Paraffin Embedding 等)保存的第一份!

外周血編號(hào)規(guī)則

標(biāo)簽類型:BRADY THT-163-499-3-IP 長(zhǎng)方形為25.4mm*9.525mm, 圓直徑9.525mm
【血液樣本的編號(hào)命名1012345D19BP1,代表該1012345 號(hào)病收集的D19 臟器癌癥的B 血液樣本的P 血漿(Plasma/ Serum / White Blood Cells/ Erythrocyte/ Thrombolytic / DNA/ RNA/whole Blood/等)的第一份!

其余細(xì)胞/體液編號(hào)規(guī)則

【如臍血為常規(guī)保留樣本,為區(qū)別用常規(guī)外周血,可對(duì)臍血專門設(shè)立一個(gè)樣本類型,細(xì)類可參考外周血的分類】

三.遺傳數(shù)據(jù)庫(kù)按家系采集時(shí),建議編號(hào)規(guī)則如下

關(guān)系類中,P1 為原始本人第1 代,家系中其余關(guān)系,請(qǐng)自己定義相關(guān)的編號(hào)規(guī)則前 7 位樣本編號(hào)一致的為同一個(gè)體,同一個(gè)體的若干不同編號(hào)樣本,其個(gè)體的基本信息是一致的。

來(lái)源:上海萬(wàn)格生物科技有限公司
聯(lián)系電話:(021)800-820-8831
E-mail:info@avantech.cn

標(biāo)簽: 樣本管理
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