試劑盒成分
1、 YSY Buffer
2、2*PCR Master Mix(使用實(shí)驗(yàn)室常用的酶即可,由客戶自備)
儲(chǔ)藏條件:4
oC
實(shí)驗(yàn)步驟
1、細(xì)胞與動(dòng)物組織的準(zhǔn)備:
1.1 培養(yǎng)細(xì)胞準(zhǔn)備:
以培養(yǎng)密度為 1´10
6 個(gè)/ml 為例,在超凈臺(tái)內(nèi)取 1ml(內(nèi)含 300-1000 個(gè)細(xì)胞);對(duì)于某些類(lèi)貼壁細(xì)
胞,可直接刮取側(cè)壁細(xì)胞,植入已編號(hào)的 PCR 管內(nèi)。
取適當(dāng)部位,采集血液 1 ml。
注意:如果樣品在 10 分鐘內(nèi)處理,則無(wú)需抗凝處理;在高通量采樣情況下,如果樣品在塑料PCR管內(nèi)需存放 10 分鐘以上,需采用抗凝處理。
1.3 哺乳動(dòng)物組織準(zhǔn)備:
采集相應(yīng)部位,剪取
1mm3(1 ml)左右組織放入已編號(hào)的 PCR 管內(nèi)。
1.4 斑馬魚(yú)尾鰭、果蠅等其他模式動(dòng)物組織準(zhǔn)備:
選取尾鰭、翅膀等無(wú)損害部位,可通過(guò)剪取、穿孔或針刺等方法制備少量新鮮組織,
體積約 1mm3
即 1 ml。
2、基因組 DNA 模板的制備
- 加樣
- 10ml 的 YSYBuffer 液分別逐一加入裝有組織或細(xì)胞的 PCR 管壁(注意勿將槍頭碰到組織
YSY Biotech 基因的故事 讓斑馬魚(yú)來(lái)為您講述
樣品,防止污染);加樣完畢后,將 PCR 管快速離心,確保溶液和組織或細(xì)胞均位于 PCR 管
底部;
- PCR 管放入 PCR 儀中,啟動(dòng) PCR 程序:65℃×30min、95℃×5min、16℃×1min。基因組
模板若不立即使用,請(qǐng)放入-20℃保存。
3、目標(biāo)基因的 PCR 擴(kuò)增(以下試劑請(qǐng)自備)
3.1 取用新的 PCR 管,按下列順序組裝 PCR 反應(yīng)體系:
20 ml 反應(yīng)體系(產(chǎn)物直接凝膠電泳進(jìn)行基因型鑒定用)
基因組 DNA 模板(步驟 2.2 所得):1 ml
2 × PCR Master Mix:10 ml(自備)
正向引物(5mM): 1ml (自備)
反向引物(5mM): 1ml (自備)
超純水: 7 ml(自備)
- 組裝完畢后,將 PCR 管快速離心,確保所有溶液均位于 PCR 管底部;
- 將 PCR 管放入 PCR 儀中,啟動(dòng)客戶自行設(shè)計(jì)的 PCR 程序完成 PCR 擴(kuò)增。
4、PCR 產(chǎn)物驗(yàn)證
取 2ml 擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行基因型鑒定;若需進(jìn)一步測(cè)序,可將余下的產(chǎn)物直接送測(cè)
序;若需酶切鑒定,則在經(jīng) PCR 產(chǎn)物純化試劑盒純化后,用核酸酶內(nèi)切酶進(jìn)行酶切鑒定。
注:測(cè)序公司一般額外收取 5 元錢(qián)的切膠費(fèi)用,請(qǐng)?jiān)谒蜏y(cè)前和測(cè)序公司確認(rèn)無(wú)需切膠回收。
5、結(jié)果閱讀(基因突變及突變率分析)
如果基因型可由引物特異性識(shí)別,則通過(guò)將觀測(cè) PCR 產(chǎn)物電泳結(jié)果確定基因型;通過(guò)測(cè)序確定基
因型的,其測(cè)序結(jié)果可通過(guò)人工閱讀測(cè)序的色譜圖,識(shí)別突變等位基因的基因型,確定突變率。核
酸內(nèi)切酶酶切結(jié)果可通過(guò)對(duì)凝膠電泳條帶的灰度分析,確定突變率。
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