針對土壤和沉積物型樣本DNA提取,實(shí)驗中大家選擇了使用
土壤基因組DNA提取試劑盒(柱膜法)SPINeasy DNA Kit for Soil(貨號 116530050),操作簡便快捷,同時樣本應(yīng)用范圍廣泛。
案例分享1
樣本類型:高原植物根系土壤
面臨挑戰(zhàn):提取高原植物根系土壤,含腐植酸較高。對比了若干款進(jìn)口和國產(chǎn)DNA試劑盒后,存在DNA提取純度低太低問題。
試用結(jié)果數(shù)據(jù):

試用體驗:
1、提取時間大大縮短;
2、操作相對比較簡便;
3、提取效果相對較好,降解減少;
4、260/230有所提高,雜質(zhì)減少。
案例分享2

圖源 中國科學(xué)院城市環(huán)境研究所
樣本類型:蚯蚓腸道內(nèi)容物和所在土壤
面臨挑戰(zhàn):客戶自備的試劑盒,DNA提取濃度比較低(37.2 ng/μl),260/280為1.796,純度僅為0.044,后續(xù)要做擴(kuò)增子測序和高通量芯片熒光PCR,不能滿足后續(xù)實(shí)驗要求。
試用體驗: 結(jié)合MP公司提供的技術(shù)建議,經(jīng)實(shí)驗優(yōu)化后,DNA提取濃度和純度都有所提升,腸道內(nèi)容物濃度為87 ng/μL,土壤樣本濃度為48 μg/uL,260/230為1.4。目前提取出的濃度已滿足下游的實(shí)驗用量。
案例分享3
樣本類型:農(nóng)田土壤
面臨挑戰(zhàn):提取DNA效果不理想。
試用結(jié)果數(shù)據(jù):

試用體驗: 操作便捷,提取的DNA作為模板進(jìn)行qPCR,在對照組的土壤樣品中加入了等量的真菌孢子,最終qPCR結(jié)果中,實(shí)驗組和對照組的CT值基本一致,說明產(chǎn)率上差異不大。
案例分享4
樣本類型:河流湖泊沉積物
面臨挑戰(zhàn):DNA提取效果差
試用結(jié)果數(shù)據(jù):
試用體驗:提取的DNA純度有明顯提高,260/230遠(yuǎn)大于1.0,DNA純度較好,提取操作步驟比較簡便。
【微生物樣本】
土壤基因組DNA提取試劑盒(柱膜法)SPINeasy DNA Kit for Soil不僅可用于土壤樣本DNA提取,試劑盒內(nèi)裂解液、雜質(zhì)去除劑及漂洗液能夠針對菌體特性很好地去除影響DNA純化以及下游實(shí)驗的抑制劑,從而提取到更多的微生物DNA。
案例分享5
樣品類型:水管內(nèi)壁生物膜,提取管道內(nèi)的淤泥和滋生的各種微生物
面臨挑戰(zhàn):DNA提取純度低。
試用結(jié)果數(shù)據(jù):
試用體驗:試用后A260/230達(dá)到了1.73,純度大大提高,對實(shí)驗結(jié)果滿意。
【糞便與腸道菌群】

在過去的十年里,糞便樣本分析實(shí)驗占了很大比例。這些被消化的廢物和微生物基質(zhì)中含有的微生物群落影響著我們多種健康線索。不過嘛,整個實(shí)驗操作過程可談不上很愉快。對于糞便樣本DNA提取,獲得純凈、無抑制作用的DNA,同時保持高的產(chǎn)量,操作時間縮短那是最好不過了。以下是使用MP糞便基因組DNA提取試劑盒(柱膜法)SPINeasy DNA Kit for Feces(貨號#116531050),看看他們有什么心得體會吧~
案例分享6
樣本類型:蜜蜂糞便
面臨挑戰(zhàn):DNA提取純度低,260/230低,260-280之間沒有明顯峰值
試用結(jié)果數(shù)據(jù):
試用體驗:提取結(jié)果較好,滿足宏基因組測序要求。
案例分享7
樣本類型:小鼠糞便和腸道內(nèi)容物
面臨挑戰(zhàn):DNA提取效果不理想
試用結(jié)果數(shù)據(jù):
試用體驗:試劑盒整體上使用起來操作比較簡單,提取效果較好,260/230大于1.0,滿足后期PCR和測序需求。