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空間單細(xì)胞蛋白組學(xué)技術(shù)原理及應(yīng)用

瀏覽次數(shù):1216 發(fā)布日期:2023-6-9  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
Akoya空間單細(xì)胞蛋白組學(xué)是在組織原位追蹤細(xì)胞亞群分布和檢測功能蛋白表達(dá)的全新技術(shù)。該技術(shù)可同步對多達(dá)100多種蛋白靶標(biāo)進(jìn)行檢測和成像,不僅能夠保留完整的組織結(jié)構(gòu),而且可以精確區(qū)分單個細(xì)胞以及細(xì)胞的間隙。在此基礎(chǔ)上,可獲得特定組織結(jié)構(gòu)中細(xì)胞亞群數(shù)量、細(xì)胞鄰域中的細(xì)胞關(guān)系圖譜、細(xì)胞間的通訊網(wǎng)絡(luò)、以及免疫檢查點(diǎn)等關(guān)鍵功能蛋白在單個細(xì)胞上的表達(dá)定位等高級空間信息。

|   技術(shù)原理
采用美國Akoya Biosciences公司的專利DNA偶聯(lián)抗體檢測技術(shù)結(jié)合自動化高分辨熒光顯微鏡,可還原蛋白質(zhì)和特定細(xì)胞在組織中的真實(shí)分布。所有DNA偶聯(lián)抗體先一次性與組織切片結(jié)合,再啟動抗體和熒光探針的“雜交 — 成像 — 剝離”三步循環(huán),每次循環(huán)后通過熒光顯微鏡收集3種抗體的熒光信號,30次循環(huán)即可實(shí)現(xiàn)近百種蛋白質(zhì)的空間原位檢測。
 
|   技術(shù)優(yōu)勢和特點(diǎn)
● 分辨率高,精確到0.25微米,直達(dá)單細(xì)胞水平;
● 一次雜交所有抗體,減少反復(fù)洗脫帶來的誤差和批次效應(yīng);
● 樣本兼容性高,新鮮冷凍FF和FFPE石蠟樣品均適用;
● 使用靈活,既有商品化抗體panel,也可定制化檢測;
● 全片掃描,最大面積可達(dá)18mm X 35mm.
 
|   實(shí)現(xiàn)細(xì)胞表型和功能蛋白的同時檢測
常用抗體目錄
以上為空間單細(xì)胞蛋白質(zhì)組研究的常用指標(biāo),客戶可根據(jù)研究需要任意組合,定制化檢測。
 
|   數(shù)據(jù)呈現(xiàn)
根據(jù)研究目的,可深度挖掘組織空間信息、單細(xì)胞信息、蛋白定量信息和細(xì)胞互作信息。

 
|   研究示例
1. 非肌肉浸潤性膀胱癌(NMIBC)FFPE全組織超多重單細(xì)胞原位成像

商品化抗體(37)和定制化抗體(18)聯(lián)合開展NMIBC組織空間單細(xì)胞原位成像檢測?偣茶b定了14種細(xì)胞亞型,其中Ki67+細(xì)胞和CD31+細(xì)胞占比最多,說明了NMIBC組織中細(xì)胞增殖和血管生成非;钴S?臻g互作分析發(fā)現(xiàn)了CD163+巨噬細(xì)胞定位在三級淋巴結(jié)構(gòu)和腫瘤基質(zhì)區(qū)域。

2. 頭頸鱗狀細(xì)胞癌(HNSCC)組織超多重單細(xì)胞原位成像分析

超多重空間單細(xì)胞原位成像對835823個單細(xì)胞聚類成14種細(xì)胞亞型。依據(jù)細(xì)胞類型的不同和空間關(guān)系,可以將腫瘤區(qū)域分為4個異質(zhì)性區(qū)域,每個腫瘤異質(zhì)性區(qū)域包含不同的免疫、增殖、血管細(xì)胞亞型。例如CD68+巨噬細(xì)胞和CD8+ T細(xì)胞在腫瘤異質(zhì)性區(qū)域3中的占比顯著減少,同時該區(qū)域幾乎不表達(dá)促凋亡蛋白BAK。這些現(xiàn)象說明區(qū)域3的腫瘤細(xì)胞處于活躍狀態(tài),不易受到T細(xì)胞的殺傷,此區(qū)域很可能對免疫治療耐受,該類型區(qū)域的存在或許是腫瘤耐藥和復(fù)發(fā)的關(guān)鍵。
 
|   參考文獻(xiàn)
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關(guān)于華盈
上海華盈生物醫(yī)藥科技有限公司(以下簡稱“華盈生物”)成立于2012年,位于上海閔行區(qū)綠洲環(huán)路396弄,是一家集產(chǎn)品研發(fā) — 技術(shù)服務(wù)為一體的醫(yī)學(xué)生物技術(shù)領(lǐng)域的特色高科技企業(yè)。華盈生物作為專業(yè)的蛋白組學(xué)技術(shù)服務(wù)公司,充分利用核心團(tuán)隊(duì)的科學(xué)背景與資源優(yōu)勢,成功打造了“蛋白芯片”和“蛋白質(zhì)譜”雙平臺技術(shù)服務(wù)體系,形成1+1>2的獨(dú)特業(yè)務(wù)優(yōu)勢。經(jīng)過多年的穩(wěn)步發(fā)展,華盈生物在業(yè)界逐漸樹立了“科學(xué)家服務(wù)科學(xué)家”的良好口碑和形象,業(yè)務(wù)覆蓋“蛋白芯片”、“蛋白質(zhì)譜”、“外泌體研究”、空間單細(xì)胞組學(xué)”、“藥靶篩選”等領(lǐng)域,是國內(nèi)標(biāo)桿性的蛋白質(zhì)篩選與檢測系統(tǒng)性服務(wù)平臺。
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