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蛋白質(zhì)印跡或免疫印跡的常見(jiàn)問(wèn)題及其解決方案

瀏覽次數(shù):761 發(fā)布日期:2024-1-15  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

蛋白質(zhì)印跡或免疫印跡 (Western blot,簡(jiǎn)稱(chēng) WB) 是一種常見(jiàn)的實(shí)驗(yàn)室方法,用于檢測(cè)蛋白質(zhì)并評(píng)估其表達(dá)水平。根據(jù)其分子量和與特定抗體的免疫反應(yīng)性來(lái)鑒定感興趣的蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)印跡由一系列相互關(guān)聯(lián)的步驟組成 (圖 1)[1]。

 

圖 1. 蛋白質(zhì)印跡相互關(guān)聯(lián)的步驟[1]。 

 (1) 將樣品 (通常是蛋白質(zhì)混合物) 加載到凝膠上。Marker 標(biāo)記包含各種已知分子量的預(yù)標(biāo)記蛋白質(zhì),與蛋白質(zhì)樣品一起加載到凝膠上作為尺寸參考。(2) 凝膠電泳用于根據(jù)蛋白質(zhì)的分子量來(lái)分離蛋白質(zhì)。(3) 將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移或“印跡”到膜上。(4) 封閉膜以減少非特異性結(jié)合,然后依次用特異性結(jié)合目標(biāo)蛋白的一抗和二抗進(jìn)行探測(cè)。后者結(jié)合一抗并攜帶允許隨后檢測(cè)的酶或熒光團(tuán)。(5) 分別通過(guò)化學(xué)發(fā)光反應(yīng)或熒光檢測(cè)信號(hào)。(6) 準(zhǔn)備蛋白質(zhì)印跡圖像以供發(fā)表。

由于該實(shí)驗(yàn)時(shí)間長(zhǎng)、細(xì)節(jié)多,從樣品制備到顯影,每個(gè)步驟中都可能存在問(wèn)題,最后得到的條帶往往千奇百怪、不盡人意……在這篇推文中,我們將為您介紹一些常見(jiàn)的 WB 實(shí)驗(yàn)問(wèn)題以及相應(yīng)的解決方案[2]。小 M 助您避免實(shí)驗(yàn)中的各種困擾,快來(lái)看看吧!

 

▐ 1. 微笑條帶:

可能性原因:遷移過(guò)快、電泳緩沖液溫度偏高、蛋白質(zhì)超載或孔內(nèi)運(yùn)行緩沖液不足。

建議:應(yīng)降低遷移速度、預(yù)冷緩沖液、減少蛋白上樣量、緩沖液完全覆蓋孔,確保內(nèi)室緩沖液不會(huì)泄露到外室[4][6]

▐ 2. 皺眉條帶:

可能性原因:裝置不合適,可能是凝膠和玻璃擋板底部有氣泡,或者兩邊聚合不完全。

建議:可通過(guò)調(diào)整裝置來(lái)避免該問(wèn)題。

▐ 3. 條帶拖尾:

可能性原因:樣品溶解不好;存在一定程度地蛋白降解;電泳液反復(fù)多次使用。

建議:樣品充分溶解混勻后上樣;盡量使用新鮮樣本;使用新鮮配制的電泳緩沖液。

▐ 4. 啞鈴狀不均勻條帶:

可能性原因:配置膠有問(wèn)題,膠凝固后不均一;樣品可能含有過(guò)多雜質(zhì)。

建議:重新配置膠,確保膠質(zhì)量無(wú)問(wèn)題來(lái)避免該現(xiàn)象出現(xiàn);在樣品使用前離心。

▐ 5. 條帶粘連:

可能性原因:可能是上樣量太多,或者是制膠問(wèn)題,分離膠和濃縮膠之間有間隙,樣品竄孔。

建議:可通過(guò)減少上樣量和提高配膠質(zhì)量來(lái)避免。

▐ 6. 條帶空泡:

可能性原因:轉(zhuǎn)膜時(shí)膜上有氣泡

建議:確保在組裝“三明治”時(shí),移除凝膠和印跡膜間的所有氣泡。

▐ 7. 背景有不均勻的黑色斑點(diǎn):

可能性原因:封閉液未完全溶解,使不容顆粒附著在膜上從而導(dǎo)致發(fā)光時(shí)候膜上形成黑點(diǎn);或抗體在膜上分布不均;

建議:封閉液一定要充分溶解,封閉結(jié)束之后要用 TBST 清洗三遍再加一抗;抗體孵育時(shí)保持搖動(dòng)。

▐ 8. 條帶空斑:

可能性原因:目的蛋白條帶中間空白,周?chē)尘罢!T摤F(xiàn)象可能是一抗二抗?jié)舛冗^(guò)高,促使底物過(guò)快消耗,從而導(dǎo)致在進(jìn)行化學(xué)發(fā)光時(shí),底物耗盡形成空斑。

建議:可減少蛋白上樣量;降低一抗和二抗?jié)舛龋换蛘呦♂岋@影液。

通過(guò)本篇推文介紹,相信普通的難題已經(jīng)難不倒你們了! 如果以上內(nèi)容沒(méi)有解決您的問(wèn)題,歡迎大家在下方留言,小 M 歡迎大家積極交流實(shí)驗(yàn)中遇到的各種疑難問(wèn)題~



Beta Actin Antibody HRP Conjugated

常用的內(nèi)參抗體之一,可檢測(cè) Beta Actin 總蛋白的內(nèi)源水平。

alpha Tubulin Rabbit mAb

可檢測(cè) alpha-tubulin 總蛋白的內(nèi)源水平,并不會(huì)與重組 β-tubulin 蛋白發(fā)生交叉反應(yīng)。 

c-Myc Rabbit mAb

該抗體可檢測(cè) c-Myc 總蛋白的內(nèi)源水平。 

HRP-conjugated AffiniPure Goat Anti-Mouse IgG H&L

鼠二抗,山羊來(lái)源的抗小鼠 IgG 抗體,用于小鼠背景下 WB、ELISA、IHC 實(shí)驗(yàn)。 

HRP-conjugated AffiniPure Goat Anti-Rabbit IgG H&L

兔二抗,山羊來(lái)源的抗兔 IgG 抗體,用于兔子背景下 WB、IHC-P、ELISA 實(shí)驗(yàn)。 

Ultra High Sensitivity ECL Kit 

飛克級(jí)別抗原檢測(cè),一抗稀釋比可達(dá)釋1:1000 至1:50000 倍。 

Protease Inhibitor Cocktail, mini-Tablet  (EDTA-Free)

在樣品制備、保存中可增加蛋白穩(wěn)定性。 


MCE的所有產(chǎn)品僅用作科學(xué)研究或藥證申報(bào),我們不為任何個(gè)人用途提供產(chǎn)品和服務(wù)。

參考文獻(xiàn):
[1] Kroon C, et.al. Blind spots on western blots: Assessment of common problems in western blot figures and methods reporting with recommendations to improve them. PLoS Biol. 2022 Sep 12;20(9):e3001783. 

[2] Cui Y. Optimization of blocking conditions for fluorescent Western blot. Anal Biochem. 2020 Mar 15;593:113598. 
[3] Begum H, et al. Western blotting: a powerful staple in scientific and biomedical research. Biotechniques. 2022 Jun;73(1):58-69. 
[4] Mary Johnson. Materials and Methods ,Western Blot - Protocol, Troubleshooting, and Survey Results on Instruments and Reagents. 
[5] Gilda JE, et al. Western Blotting Inaccuracies with Unverified Antibodies: Need for a Western Blotting Minimal Reporting Standard (WBMRS). PLoS One. 2015 Aug 19;10(8):e0135392. 
[6] Sule R, et al. Western blotting (immunoblotting): history, theory, uses, protocol and problems. Biotechniques. 2023 Sep;75(3):99-114.
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