xCELLigence系統(tǒng)實時評測內(nèi)源性G-偶聯(lián)蛋白受體(GPCRs)功能
Jeff Irelan 美國圣地亞哥ACEA Biosciences 公司
Jonathan H. Morgan 美國弗吉尼亞州Manassas ATCC 產(chǎn)品經(jīng)理
前言
G-偶聯(lián)蛋白受體(GPCRs),即 7-跨膜蛋白,是當(dāng)今臨床與科研藥物的單一治療靶點,也是迄今發(fā)現(xiàn)最大的靶點家族。據(jù)推測人基因組中,該家族的功能成員超過300個,涉及多種不同細(xì)胞與組織間的廣泛信號途徑。研究證實,對GPCR功能的調(diào)節(jié),有助于免疫學(xué)、神經(jīng)病學(xué)、心臟病學(xué)與腫瘤學(xué)領(lǐng)域多種疾病的治療。
通過應(yīng)用新的基于細(xì)胞水平的受體功能檢測技術(shù),候選藥物對新調(diào)節(jié)子的確認(rèn)率顯著提高,損耗率(定義為臨床前檢測/臨床試驗失敗率)降低。但基礎(chǔ)研究獲得的GPCR 功能數(shù)據(jù)很難被應(yīng)用于臨床疾病中。造成這種情況的原因是,傳統(tǒng)細(xì)胞學(xué)實驗往往(1)使用異源細(xì)胞,或相關(guān)性較低的細(xì)胞類型,進(jìn)行人造受體的過表達(dá);(2) 使用外源性檢測試劑,如熒光標(biāo)記試劑;(3)使用侵入性處理手段,像染料負(fù)載以及細(xì)胞裂解,(4)生成的數(shù)據(jù)僅為單一時間點的數(shù)據(jù),而不是持續(xù)性細(xì)胞監(jiān)測數(shù)據(jù)。
最近開發(fā)的生物相關(guān)性程度更高的實驗系統(tǒng),可顯著改善 GPCR 藥物開發(fā)與研究應(yīng)用的成功率(1)。羅氏應(yīng)用科學(xué)部的 xCELLigence 系統(tǒng),不需要使用外源性標(biāo)記,即可對疾病相關(guān)細(xì)胞的內(nèi)源性GPCR功能進(jìn)行實時評測。將細(xì)胞接種于含有微電極的培養(yǎng)板上,可對GPCR 激活導(dǎo)致的細(xì)胞骨架結(jié)構(gòu)的微小變化與細(xì)胞收縮情況進(jìn)行準(zhǔn)確測定。
通過與細(xì)胞漿鳥嘌呤核苷結(jié)合蛋白或 G 蛋白結(jié)合偶聯(lián),GPCRs 可進(jìn)行細(xì)胞的信號傳導(dǎo)活動。所有主要的與 G 蛋白偶聯(lián)的第二信使通路,都已被發(fā)現(xiàn)會激活環(huán)化AMP/蛋白激酶 A、鈣離子/磷酸酶 C、β-抑制蛋白/MAPK,以及 Rho 家族 GTP酶,使細(xì)胞發(fā)生形態(tài)學(xué)改變。而xCELLigence 系統(tǒng)可通過記錄細(xì)胞阻抗,很容易對形態(tài)學(xué)改變進(jìn)行檢測(2),從而完成對GPCR的檢測。
與傳統(tǒng)檢測方法相比,形態(tài)學(xué)阻抗測定可對多個信號途徑累積效應(yīng)進(jìn)行捕獲。內(nèi)源性GPCR 功能測定的優(yōu)勢包括(1)對靶受體進(jìn)行評價是在其正常表達(dá)水平上;(2)在調(diào)節(jié)因子包括激素或異源性二聚體存在情況下,對受體之間的天然相互作用情況進(jìn)行分析;(3)允許 GPCR 與細(xì)胞內(nèi) G 蛋白的天然偶聯(lián)。同時,應(yīng)用實時無標(biāo)記xCELLigence 檢測系統(tǒng),可動態(tài)實時地記錄實驗期間的所有阻抗信息,從而對所有GPCR的反應(yīng)進(jìn)行檢測。通過單一檢測即可對 GPCR 激活導(dǎo)致的所有第二信使途徑進(jìn)行測定,從而有效降低試劑成本。
本研究中,我們發(fā)現(xiàn) xCELLigence 系統(tǒng)是一種靈敏的、可靠的檢測系統(tǒng),用于持續(xù)內(nèi)源性 GPCR 功能測定。研究中我們對涉及 24 個治療相關(guān)受體家族的一組 43 個配體(參見表 1)進(jìn)行了測定,并生成了相關(guān)GPCR功能圖譜。實驗涉及通用的腫瘤細(xì)胞系、HeLa、U2OS、SH-SY5Y 與 CHO-K1,以及疾病相關(guān)的原代細(xì)胞:人血管內(nèi)皮細(xì)胞與混合腎上皮細(xì)胞。
目標(biāo)家族 | 配體 | HeLa | CHOK1 | U2OS | SH-SY5Y | MREC | HUVEC |
組織胺 | 組織胺 | ||||||
乙酰膽堿 | 卡巴膽堿 | ||||||
腎上腺素 | 異丙基腎上腺素 | ||||||
谷氨酸 | L-谷氨酸 | ||||||
谷氨酸 | (S)-3,5-DHPG | ||||||
谷氨酸 | (S)-MCPG | ||||||
谷氨酸 | DCGIV | ||||||
谷氨酸 | L-AP4 | ||||||
谷氨酸 | LY342495 | ||||||
多巴胺 | 多巴胺 | ||||||
血清素 | 血清素 | ||||||
血清素 | 8-OH-DPAT-HBr | ||||||
GABA | GABA | ||||||
前列腺素 | PGE1 | ||||||
前列腺素 | PGE2 | ||||||
前列腺素 | Iloprost | ||||||
胰高血糖素 | 胰高血糖素 | ||||||
胰高血糖素 | GLP-1 | ||||||
胰高血糖素 | Exodus-2 | ||||||
CC 趨化因子 | RANTES | ||||||
CC趨化因子 | MIP-3b | ||||||
CXC趨化因子 | AMD3 100 | ||||||
CXC趨化因子 | SDF1a | ||||||
降鈣素 | 降鈣素 | ||||||
黑素細(xì)胞刺激素 | a-MSH | ||||||
緩激肽 | 緩激肽 | ||||||
腦腸肽 | 腦腸肽 | ||||||
大麻素 | 花生四烯酸乙醇胺 | ||||||
大麻素 | ACEA | ||||||
內(nèi)皮素 | 內(nèi)皮素1 | ||||||
內(nèi)皮素 | [Ala1,3,11,15]-ET | ||||||
溶血磷脂 | LPA | ||||||
溶血磷脂 | S1P | ||||||
溶血磷脂 | SEW 2871 | ||||||
催產(chǎn)素 | 催產(chǎn)素 | ||||||
褪黑素 | 褪黑素 | ||||||
生長抑素 | 生長抑素 | ||||||
加壓素 | AVP | ||||||
嘌呤 | ATP | ||||||
游離脂肪酸 | GW 9508 | ||||||
游離脂肪酸 | 月桂酸 | ||||||
游離脂肪酸 | 乙酸 | ||||||
游離脂肪酸 | 丁酸 |
= 最大細(xì)胞指數(shù)值超出緩沖液對照的3倍標(biāo)準(zhǔn)差 | |
= 最小細(xì)胞指數(shù)值低于緩沖液對照的3倍標(biāo)準(zhǔn)差 |
表 1:GPCR 功能圖概述
材料與方法
細(xì)胞系與培養(yǎng)條件:細(xì)胞系來自于ATCC。按照 ATCC 的建議進(jìn)行HeLa(#CCL-2)、U2OS (#HTB-96)、SH-SY5Y(#CRL-2266)、CHO-K1 (#CCL-61)、人血管內(nèi)皮細(xì)胞(HUVEC;# PCS-100-010 批號 58570370)與混合腎原代上皮細(xì)胞(MREC;ATCC # PCS-400-012 lot # 58488854)的培養(yǎng),腫瘤細(xì)胞系傳代至 10 代以上,原代細(xì)胞系傳代至 4 代。
檢測程序:所有檢測均于組織培養(yǎng)器(5% CO2,37°C )中進(jìn)行。細(xì)胞培養(yǎng)基為生長培養(yǎng)基,細(xì)胞接種密度是 1-2 x 104 細(xì)胞每孔,接種于96孔E-Plates 中,并通過xCELLigence 系統(tǒng)進(jìn)行過夜監(jiān)測,直至細(xì)胞生長至接近滿板,復(fù)孔檢測。預(yù)先在另一普通96孔板中每孔中添加 2 µl 藥物,并儲存于 -20℃。待細(xì)胞培養(yǎng) 18-24 小時后,進(jìn)行藥物稀釋反應(yīng)。將藥物融解,并添加 132 µl 檢測緩沖液(1 x HBSS,Sigma H8264、20mM HEPES,Cellgro 25-060-Cl、0.1% BSA,F(xiàn)isher Scientific #BP1600)對其進(jìn)行稀釋處理。從培養(yǎng)箱中移除 E-Plates 96,使用檢測緩沖液進(jìn)行洗滌,洗滌一次,并使用Biotek MicroFlo Select,于每孔中添加 140 µl 檢測緩沖液。將 E-Plates 96 放回至RTCA MP 站,放置15 分鐘,進(jìn)行細(xì)胞平衡。然后使用 Beckman Multimek 96,同時在各孔添加10 µl的藥物緩沖液。小分子藥物實驗最終濃度為10 µM,多肽為1 µM。
數(shù)據(jù)分析:使用 RTCA 軟件,對每孔的數(shù)據(jù)在藥物添加前時間點進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理。對于各種藥物,在計算時需減去只含藥物溶劑時對照細(xì)胞表現(xiàn)出的背景值。小分子藥物相應(yīng)溶劑為DMSO,多肽藥物相應(yīng)溶劑為0.1% 的BSA 。
將檢測結(jié)果數(shù)據(jù)導(dǎo)出至Microsoft Excel,進(jìn)行后續(xù)計算。確定每孔細(xì)胞的最大與最小細(xì)胞指數(shù)值,計算重復(fù)檢測(n=2)的均值標(biāo)準(zhǔn)差與平均值。對于對照孔細(xì)胞來說,對重復(fù)檢測 8 個孔的均值標(biāo)準(zhǔn)差進(jìn)行測定。將這些數(shù)值平均并乘以 3 以計算“hit”閾值。對于 Z 因子與 EC50 計算來說,使用RTCA MP提供的動態(tài)反應(yīng)曲線,選擇一時間點作為細(xì)胞系及藥物綜合反應(yīng)的最佳時間點。
結(jié)果
為確保研究的重現(xiàn)性,細(xì)胞為可靠來源,并可確保細(xì)胞的質(zhì)量與類別。所有實驗細(xì)胞均來自于美國細(xì)胞菌種庫(ATCC)。檢測前,進(jìn)行有限傳代,按照 ATCC 的建議進(jìn)行細(xì)胞的保存。
內(nèi)源性GPCR檢測穩(wěn)定性。檢測各種條件下HeLa細(xì)胞對內(nèi)源性GPCRs激活劑的反應(yīng)性。且將鈣離子載體 A23187作為陽性對照,并對其進(jìn)行檢測。低濃度情況下,由于 Gq-偶聯(lián) GPCR 的激活,A23187可模擬鈣離子的活化過程。由于其獨立于GPCRs的表達(dá),這種反應(yīng)有助于細(xì)胞檢測條件的研發(fā)。最強烈反應(yīng)出現(xiàn)于過夜長滿平板的細(xì)胞。此時使用 GPCR 檢測通用緩沖液更換掉生長培養(yǎng)基(參見詳細(xì)檢測條件中的材料與方法)。
按照這些檢測條件對幾種不同細(xì)胞系對 A23187 與1-磷酸鞘氨醇(SIP)的反應(yīng)進(jìn)行評價,SIP 是無所不在的 GPCR 表達(dá)家族、溶血磷脂或內(nèi)皮分化基因(EDG)受體的內(nèi)源性激活劑。Z量測因子考慮有信噪比與檢測的變異性,用于對檢測強度進(jìn)行評價(3)。使用終濃度 1 µM 或與緩沖試劑(0.1% BSA)相同濃度的 S1P 與 終濃度 100 nM 或與其緩沖試劑(DMSO)相同濃度的 A23187 對 8 個重復(fù)多孔培養(yǎng)的細(xì)胞進(jìn)行處理。使用xCELLigence 系統(tǒng),對細(xì)胞反應(yīng)進(jìn)行實時監(jiān)測,間隔時間1分鐘。
激活劑添加后最初幾分鐘期間,即開始檢測細(xì)胞反應(yīng)。每種細(xì)胞系中,添加激活劑后的最初 30-40 分鐘期間細(xì)胞反應(yīng)最大(參見圖 1)。如圖所示,處理后接近 30 分鐘時,HeLa 細(xì)胞對A23187 的反應(yīng)最大,對S1P 的反應(yīng)接近最大。此時,A23187 與 S1P 的 Z 因子分別是0.83與 0.90。所檢測的細(xì)胞類型中,兩種處理中至少一種 Z 因子分值超出0.5,表明檢測可靠性高(參見表 2)。相反,兩種配體混合的原代腎上皮細(xì)胞(RMEC) Z 因子接近 0.25,表明檢測可靠性不顯著。但后續(xù) GPCR 篩查檢測結(jié)果表明,該細(xì)胞類型其他 GPCRs 可靠性更高。
圖 1:GPCR 檢測可靠性評價。HeLa 細(xì)胞接種密度是 10000 細(xì)胞每孔,接種于E-Plate 96 上,放置于xCELLigence RTCA MP 儀器,并在培養(yǎng)箱中過夜。然后去除生長培養(yǎng)基,添加檢測緩沖液,持續(xù)細(xì)胞監(jiān)測 15 分鐘后,添加 GPCR調(diào)節(jié)藥物,記錄每分鐘細(xì)胞反應(yīng)情況,記錄 1.5 小時。獲得時間依賴性細(xì)胞反應(yīng)曲線。八復(fù)孔,誤差列代表均值標(biāo)準(zhǔn)差。藥物添加后 30 分鐘,計算單一時間點 Z 因子值檢測質(zhì)量。DMSO 是 A23187 試劑對照;0.1% BSA 用于 S1P。SD = 標(biāo)準(zhǔn)差;ABS = 絕對值。
圖 2:GPCR 檢測靈敏性評價。如圖 1 方法,對 HeLa 細(xì)胞進(jìn)行檢測,每種藥物以8個濃度處理細(xì)胞。使用 RTCA 軟件,通過計算藥物添加30分鐘后每種藥物的EC50值,對檢測靈敏性進(jìn)行測定。
內(nèi)源性GPCR檢測靈敏性。我們也使用 A23187 與 S1P,以及 8 點劑量反應(yīng)曲線檢測實驗靈敏性(參見圖 2)。于 Z 因子測定相同時間點,通過 RTCA 軟件計算產(chǎn)生 50% 最大反應(yīng)(EC50 值)的激活劑濃度。
每種細(xì)胞系的 EC50 值見表 2。每種細(xì)胞對 A23187 的處理均比較敏感,除CHO-K1外,所有細(xì)胞類型對 S1P 的處理均非常敏感,產(chǎn)生的 EC50 值低限為 10-7 至 10-9。盡管 CHO-K1 細(xì)胞表達(dá)EDG 受體(4),后續(xù)檢測S1P 與溶血磷脂酸(LPA)反應(yīng)分值為陽性(見下文),但是為生成準(zhǔn)確的 EC50,很明顯,這里所用的劑量不足以飽和生物反應(yīng)。
表 2:檢測開發(fā)與評價概述
內(nèi)源性GPCR功能圖。優(yōu)化檢測參數(shù)后,使用治療相關(guān) GPCRs 的一組 43 個小分子與多肽調(diào)節(jié)子,對本研究中所用的細(xì)胞類型的功能反應(yīng)進(jìn)行檢測(參見表 1)。該組藥物指向的24 個受體家族,包括 50種潛在性反應(yīng)受體,代表所有主要的 GPCR 偶聯(lián)類型(Gs、Gi、Gq、G12/13)。使用上文程序進(jìn)行復(fù)孔檢測各細(xì)胞類型。
四種腫瘤細(xì)胞系HeLa、CHO-K1、U2OS 與 SH-SY5Y 對每種藥物都會生成獨特的時間依賴性細(xì)胞曲線(time-dependent cellular response profile,TCRP)(數(shù)據(jù)未顯示)。我們對每孔最大與最小細(xì)胞指數(shù)值進(jìn)行測定,該指數(shù)值與時間點無關(guān),并以該數(shù)值均值與標(biāo)準(zhǔn)差作圖(參見圖 3)。GPCR 功能圖表明,對能引發(fā)反應(yīng)的配體而言,細(xì)胞指數(shù)值的增加或降低具有顯著差異。例如,HeLa 細(xì)胞顯示的細(xì)胞指數(shù)正向改變程度較大,CHO-K1 細(xì)胞顯示的細(xì)胞指數(shù)負(fù)向改變程度較大,包括同樣受體家族中的 GPCRs,如PGE1、2 與 Iloprost 激活前列腺素類受體(參見圖 3)。這些結(jié)果表明,細(xì)胞背景差異可顯著改變對同樣刺激物的形態(tài)學(xué)反應(yīng),這可能是由于 G 蛋白偶聯(lián)的差異,或下游信號傳導(dǎo)途徑的差異,這些差異可使細(xì)胞形態(tài)學(xué)發(fā)生改變。細(xì)胞指數(shù)值的總體模式同樣也可反映出不同 GPCR 配體的相對特異性。SDF1a,即 CXCR4 內(nèi)源性激活劑,僅可于 HeLa細(xì)胞中,誘導(dǎo)出強大的正向細(xì)胞指數(shù)反應(yīng),而降鈣素僅可誘導(dǎo)出 CHO-K1 細(xì)胞的強大的負(fù)向細(xì)胞指數(shù)反應(yīng)。我們也對兩種附加腫瘤細(xì)胞系:SH-SY5Y神經(jīng)母細(xì)胞瘤與 U2OS骨肉瘤細(xì)胞,以及兩種原代細(xì)胞類型:人血管內(nèi)皮細(xì)胞(HUVEC)與混合原代腎上皮細(xì)胞(這里簡稱 MREC)的 GPCR 配體進(jìn)行檢測。
為測定細(xì)胞系的相應(yīng)活性配體,我們將 8 個對照孔的最大與最小細(xì)胞指數(shù)反應(yīng)值與固有變異性進(jìn)行比較。細(xì)胞指數(shù)值超出或低于對照孔細(xì)胞檢測值的三個標(biāo)準(zhǔn)差的檢測孔細(xì)胞被視為呈活性反應(yīng)。配體誘導(dǎo)活性反應(yīng)見圖3 與 4。每種細(xì)胞相應(yīng)內(nèi)源性 GPCR 見表 1。
一種或更多細(xì)胞類型中,有14種受體家族被確認(rèn)為活性反應(yīng)。多種情況下,本研究中使用的內(nèi)源性配體可激活同樣受體家族的多個成員。例如,血清素可激活所有內(nèi)源性血清素受體,包括幾種亞家族,其中幾種亞家族具有多種亞型?傊,研究證實,對一種或更多的腫瘤細(xì)胞,以及本研究所用的原代細(xì)胞中,xCELLigence系統(tǒng)細(xì)胞指數(shù)圖是一種可靠的方式,可用于對 14 種不同 GPCR 家族進(jìn)行功能檢測。
圖 3:腫瘤細(xì)胞系 GPCR 功能圖。指定類型細(xì)胞的檢測如圖 1 所示,于反應(yīng)板單孔中,對細(xì)胞添43 個GPCR調(diào)節(jié)藥物后的反應(yīng)進(jìn)行評價,并進(jìn)行復(fù)孔重復(fù)。測定每孔最大與最小的細(xì)胞指數(shù)值(參見材料與方法)。使用 RTCA 軟件,減去每時間點緩沖液對照孔的平均基線細(xì)胞指數(shù)值,從而對數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理(參見詳細(xì)文本說明)。因此對照孔細(xì)胞指數(shù)值為零。誤差列代表監(jiān)測時間窗內(nèi)培養(yǎng)孔的標(biāo)準(zhǔn)差。以反應(yīng)孔的處理細(xì)胞的重復(fù)多個細(xì)胞指數(shù)值(兩個重復(fù)多個反應(yīng)板,n=2)均值作圖。誤差列代表重復(fù)多個細(xì)胞指數(shù)值的一個標(biāo)準(zhǔn)差。紅色虛線代表對照孔的3倍標(biāo)準(zhǔn)差。明確導(dǎo)致細(xì)胞指數(shù)值增加(綠色線)或降低(紅色線)的藥物以實線框加強;無顯著統(tǒng)計學(xué)意義的數(shù)據(jù)(低于3倍標(biāo)準(zhǔn)差-臨界值)以虛線框顯示。
圖 4:原代細(xì)胞 GPCR 功能圖。如圖 3 所示,對指定細(xì)胞類型的原代細(xì)胞進(jìn)行檢測。
討論
xCELLigence系統(tǒng)的實時無標(biāo)記細(xì)胞檢測技術(shù)可加速藥物開發(fā)進(jìn)程,并使基礎(chǔ)研究成果更快的應(yīng)用至臨床中。我們的研究顯示,通過 xCELLigence 系統(tǒng),可對腫瘤細(xì)胞系與原代細(xì)胞的 GPCRs 功能進(jìn)行檢測。目前研究顯示,一種或更多的細(xì)胞系中,檢測的大多數(shù)受體靶 GPCR 家族可產(chǎn)生穩(wěn)定反應(yīng),反應(yīng)強度高于對照孔細(xì)胞均值的三倍標(biāo)準(zhǔn)差。以同樣方式對多種細(xì)胞類型進(jìn)行檢測,除本文列出外,還可發(fā)現(xiàn)更多的內(nèi)源性 GPCR檢測數(shù)量。已檢測的部分配體可激活 GPCR 家族多個成員。通過所選基因表達(dá)圖的激動劑與拮抗劑附加實驗,以及單一受體siRNA 敲除檢測,可對xCELLigence系統(tǒng)檢測到的,引發(fā)形態(tài)學(xué)改變的特異性受體亞型進(jìn)行確認(rèn)。
結(jié)論
• xCELLigence 系統(tǒng)可對廣泛的內(nèi)源性 GPCRs 功能進(jìn)行檢測。
• xCELLigence 系統(tǒng)進(jìn)行的GPCR 檢測,靈敏性與穩(wěn)定性非常高。
• xCELLigence 系統(tǒng)進(jìn)行的GPCR 檢測GPCR 檢測,可用于癌細(xì)胞系與原代培養(yǎng)細(xì)胞系。
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