如何快速查找LncRNA序列
查找LncRNA序列的網(wǎng)站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC數(shù)據(jù)庫等。今天，小編就給大家講講如何通過LncRNA ID號查找LncRNA的序列。
一．根據(jù)LncRNA來源數(shù)據(jù)庫，進(jìn)入相應(yīng)鏈接。
1. Genebank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
2. Ensembl：http://asia.ensembl.org/index.html
3. RefSeq：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/
4. UCSC：http://genome.ucsc.edu/
二．根據(jù)“gene_id”查看LncRNA在所屬數(shù)據(jù)庫的ID號。
1. Genbank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
紅框內(nèi)輸入gene_id號，點(diǎn)擊search。假設(shè)gene_id為AK009210。
點(diǎn)擊FASTA鍵，復(fù)制獲取序列。
2. Ensmbl：http://asia.ensembl.org/index.html
選擇物種類別，詳見Report-Sequence_Results-Supplementary（可選項(xiàng)）。紅框內(nèi)輸入gene_id號，點(diǎn)擊GO。假設(shè)gene_id為ENSMUSG00000099021。
轉(zhuǎn)到Genbank，復(fù)制獲取序列。
3. RefSeq：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/
紅框內(nèi)輸入gene_id號，點(diǎn)擊search。假設(shè)gene_id為C630043F03Rik。
點(diǎn)擊FASTA，獲取序列信息。
4. UCSC：http://genome.ucsc.edu/
Genomes下拉菜單選擇參考基因組，一般人類選擇hg19，鼠選擇mm10。
紅框內(nèi)輸入gene_id號，點(diǎn)擊search。假設(shè)gene_id為Ivns1abp，點(diǎn)擊go。
點(diǎn)擊下圖的紅框。
點(diǎn)擊下圖的紅框。
選擇mRNA，復(fù)制獲取序列信息。
云序相關(guān)產(chǎn)品推薦：
m6A RNA全轉(zhuǎn)錄組甲基化測序
m5C RNA全轉(zhuǎn)錄組甲基化測序
m1A RNA全轉(zhuǎn)錄組甲基化測序
超微量RNA甲基化測序
比色法檢測整體甲基化水平
RIP
RNA Pull Down
Me-DIP測序
往期精彩回顧：
看表觀新修飾-6mA如何助力IF飆升!
10分以上m6A RNA甲基化測序文章----云序生物助力
不得了，大牛告訴你lncRNA甲基化如何研究
RNA甲基化進(jìn)入超微量時(shí)代
小白必看！RNA甲基化整體水平鑒定的方法匯總
20分文章中的RNA甲基化，熱度與實(shí)力并存
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇
云序生物最新“RNA 甲基化”研究匯總-擬南芥篇
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—病毒篇
Plant Cell：擬南芥發(fā)現(xiàn)全新m6A RNA去甲基化修飾酶
云序客戶12分頂級文章，教你如何巧用RIP測序玩轉(zhuǎn)分子機(jī)制！
2018年Nature雜志重磅級突破性研究成果--m5C RNA甲基化 云序生物
Nature突破性研究—RNA甲基化新修飾m1A 云序生物
Hepatology：m6A RNA甲基化酶METTL3促肝癌發(fā)展新玄機(jī)
上海云序生物科技有限公司
Shanghai Cloud-seq Biotech Co., Ltd.
地址：上海市松江區(qū)莘磚公路518號20號樓3樓
電話：021-64878766
傳真：021-64878766
網(wǎng)址：www.cloud-seq.com.cn
郵箱：market@cloud-seq.com.cn
一．根據(jù)LncRNA來源數(shù)據(jù)庫，進(jìn)入相應(yīng)鏈接。
1. Genebank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
2. Ensembl：http://asia.ensembl.org/index.html
3. RefSeq：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/
4. UCSC：http://genome.ucsc.edu/
二．根據(jù)“gene_id”查看LncRNA在所屬數(shù)據(jù)庫的ID號。
1. Genbank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
紅框內(nèi)輸入gene_id號，點(diǎn)擊search。假設(shè)gene_id為AK009210。
點(diǎn)擊FASTA鍵，復(fù)制獲取序列。
2. Ensmbl：http://asia.ensembl.org/index.html
選擇物種類別，詳見Report-Sequence_Results-Supplementary（可選項(xiàng)）。紅框內(nèi)輸入gene_id號，點(diǎn)擊GO。假設(shè)gene_id為ENSMUSG00000099021。
轉(zhuǎn)到Genbank，復(fù)制獲取序列。
3. RefSeq：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/
紅框內(nèi)輸入gene_id號，點(diǎn)擊search。假設(shè)gene_id為C630043F03Rik。
點(diǎn)擊FASTA，獲取序列信息。
4. UCSC：http://genome.ucsc.edu/
Genomes下拉菜單選擇參考基因組，一般人類選擇hg19，鼠選擇mm10。
紅框內(nèi)輸入gene_id號，點(diǎn)擊search。假設(shè)gene_id為Ivns1abp，點(diǎn)擊go。
點(diǎn)擊下圖的紅框。
點(diǎn)擊下圖的紅框。
選擇mRNA，復(fù)制獲取序列信息。
云序相關(guān)產(chǎn)品推薦：
m6A RNA全轉(zhuǎn)錄組甲基化測序
m5C RNA全轉(zhuǎn)錄組甲基化測序
m1A RNA全轉(zhuǎn)錄組甲基化測序
超微量RNA甲基化測序
比色法檢測整體甲基化水平
RIP
RNA Pull Down
Me-DIP測序
往期精彩回顧：
看表觀新修飾-6mA如何助力IF飆升!
10分以上m6A RNA甲基化測序文章----云序生物助力
不得了，大牛告訴你lncRNA甲基化如何研究
RNA甲基化進(jìn)入超微量時(shí)代
小白必看！RNA甲基化整體水平鑒定的方法匯總
20分文章中的RNA甲基化，熱度與實(shí)力并存
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇
云序生物最新“RNA 甲基化”研究匯總-擬南芥篇
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—病毒篇
Plant Cell：擬南芥發(fā)現(xiàn)全新m6A RNA去甲基化修飾酶
云序客戶12分頂級文章，教你如何巧用RIP測序玩轉(zhuǎn)分子機(jī)制！
2018年Nature雜志重磅級突破性研究成果--m5C RNA甲基化 云序生物
Nature突破性研究—RNA甲基化新修飾m1A 云序生物
Hepatology：m6A RNA甲基化酶METTL3促肝癌發(fā)展新玄機(jī)
上海云序生物科技有限公司
Shanghai Cloud-seq Biotech Co., Ltd.
地址：上海市松江區(qū)莘磚公路518號20號樓3樓
電話：021-64878766
傳真：021-64878766
網(wǎng)址：www.cloud-seq.com.cn
郵箱：market@cloud-seq.com.cn
- 商業(yè)化基因合成的發(fā)展歷程、趨勢和人工智能創(chuàng)新
- RNA-BS揭示NONO蛋白通過調(diào)控mRNA的m5C修飾和可變剪切促進(jìn)醫(yī)學(xué)進(jìn)展
- WGBS揭示AtSAMS通過DNA甲基化植物花器官發(fā)育的表觀遺傳機(jī)制
- 合成生物學(xué)：從 ”讀懂生命” 到 “創(chuàng)造生命” 的第三次生物革命
- m5C RNA甲基化測序（m5C MeRIP-seq）技術(shù)介紹與應(yīng)用
- RRBS等分析揭示同卵雙生子與腎小球?yàn)V過率相關(guān)的DNA甲基化位點(diǎn)
- WGBS+ChIP-seq技術(shù)揭示Cdx2轉(zhuǎn)錄因子在發(fā)育與穩(wěn)態(tài)中的動(dòng)態(tài)結(jié)合機(jī)制
- 宏基因組學(xué)揭示豬糞與土壤中抗菌藥物抗性基因與金屬抗性基因的共存
- 2025伯豪生物春季全國巡講開啟，早鳥報(bào)名搶占先機(jī)
- 華大智造副總裁中國區(qū)總經(jīng)理彭歡歡一行到訪伯豪生物
- 伯豪董事長出席專精特新中小企業(yè)發(fā)展壯大論壇并發(fā)言
- 伯豪生物雙11狂歡特惠活動(dòng)來襲，限時(shí)限量搶
- 怡美通德推出成本價(jià)體驗(yàn)單細(xì)胞測序（FFPE或全血）
- 伯豪生物2024系列培訓(xùn)班（陜西站）報(bào)名開啟
- 伯豪單細(xì)胞Flex年中巨惠，1.1W/樣本活動(dòng)價(jià)即將截止
- 藍(lán)景科信DAP-seq技術(shù)相關(guān)文章6連發(fā)，總IF 95.2
Copyright(C) 1998-2025 生物器材網(wǎng) 電話：021-64166852;13621656896 E-mail：info@bio-equip.com