泛腫瘤800 gDNA標(biāo)準(zhǔn)品帶你了解兩大平臺(tái)檢測(cè)結(jié)果差異

2019年，菁良基因重磅推出了泛腫瘤800 gDNA標(biāo)準(zhǔn)品，該產(chǎn)品專(zhuān)為滿(mǎn)足檢測(cè)機(jī)構(gòu)日常質(zhì)控而研發(fā)，涵蓋了多種腫瘤類(lèi)型如肺癌、結(jié)直腸癌、乳腺癌、血液病等，一經(jīng)推出，即受到廣大用戶(hù)的關(guān)注和歡迎。

 

作為全球最大腫瘤基因檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)品，為了滿(mǎn)足檢測(cè)機(jī)構(gòu)多種平臺(tái)不同方法下標(biāo)準(zhǔn)的統(tǒng)一性，菁良基因?qū)υ摦a(chǎn)品進(jìn)行了多平臺(tái)方法比較供用戶(hù)參考。

 

菁良選擇了市面上常用的進(jìn)口檢測(cè)Illumina平臺(tái)X10、和MGISEQ-2000RS測(cè)序平臺(tái)搭配,CoolMPS 高通量測(cè)序試劑套裝 (MGISEQ-2000RS FCL PE100）進(jìn)行驗(yàn)證。

 

700X WES

 

Illumina：Illumina 測(cè)序平臺(tái),X10

MGI: MGISEQ-2000RS,CoolMPS 高通量測(cè)序試劑套裝 (MGISEQ-2000RS FCL PE100）
 

結(jié)果表明，Q30，mapping rate，coverage結(jié)果在國(guó)內(nèi)外兩大平臺(tái)的表現(xiàn)基本一致，兩次結(jié)果下MGI平臺(tái)的duplication更低。

 

GENE

 

將ddPCR驗(yàn)證過(guò)的其中13個(gè)位點(diǎn)單獨(dú)列出來(lái)分析，在相同測(cè)序深度情況下，兩個(gè)平臺(tái)檢測(cè)準(zhǔn)確率差別不大，甚至MGI平臺(tái)搭配CoolMPS測(cè)序試劑能檢測(cè)出的突變位點(diǎn)更多。
 

 

 

菁良基因泛腫瘤800

 

產(chǎn)品特點(diǎn)

☆樣本來(lái)源于人類(lèi)細(xì)胞系

☆覆蓋多種癌癥有關(guān)變異位點(diǎn)

☆驗(yàn)證位點(diǎn)多（大于320個(gè)基因、720個(gè)突變）

☆變異類(lèi)型全

☆變異位點(diǎn)多為已知數(shù)據(jù)庫(kù)位點(diǎn)

☆突變位點(diǎn)頻率范圍寬(1-100%)

☆ddPCR驗(yàn)證位點(diǎn)突變頻率呈梯度(1-7%)

☆變異位點(diǎn)分布范圍廣

☆多種平臺(tái)驗(yàn)證變異位點(diǎn)

☆全外顯子測(cè)序采用業(yè)內(nèi)公認(rèn)度極高的捕獲芯片及測(cè)序平臺(tái)

☆涵蓋位點(diǎn)包含多個(gè)國(guó)際知名腫瘤檢測(cè)Panel

 

GeneWell
 

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