ROX是一種廣泛使用的惰性熒光染料,通常添加到qPCR反應液中以校正熒光信號。然而,隨著熒光技術在儀器中的發(fā)展,比如在Azure Cielo™實時熒光定量PCR系統(tǒng),為了標準化而單獨使用染料的步驟已不再需要。當實時熒光定量PCR系統(tǒng)首次引入市場時,許多產品使用固定光源和檢測系統(tǒng)對96孔整板進行同時成像,導致熱塊中每個孔的光路不同(圖1)。光程差異將導致每個孔的絕對熒光測量值發(fā)生變化,這取決于它們在板上的位置。例如,具有較短光程的孔可能比具有較長光程的孔具有更高的熒光讀數(shù),從而導致兩孔之間的熒光值偏差增大。因此,許多研究者開始使用參考染料(如ROX)對這種信號變化進行標準化校正。
Azure Cielo™實時熒光定量PCR的光學系統(tǒng)
由圖1可知,在傳統(tǒng)實時PCR系統(tǒng)的全板成像中,與角落的孔相比,中心區(qū)域的孔可以檢測到更高的熒光信號。由于ROX信號不受qPCR反應的影響,只要qPCR混合液的屬性保持不變,那么它在整個qPCR過程中也會保持穩(wěn)定;谶@個原因以及ROX更優(yōu)越的光譜特性,ROX被視為一個很好的參考染料,可用于熒光信號的歸一化處理,以校準光程差引起的熒光變化。但是ROX作為參考染料的挑戰(zhàn)在于,它占用了一個可能用于檢測靶標的熒光通道。隨著流感病毒和COVID-19新冠病毒(參照ANDiS SARS-CoV-2 and Influenza A/B RT-qPCR Detection Kit)等應用變得越來越普遍,多重反應也越來越常規(guī),這也說明了多通道檢測的重要性。
Azure Cielo™實時熒光定量PCR系統(tǒng)采用新型的高性能光學系統(tǒng),在qPCR實驗中無需ROX校準。該光學系統(tǒng)采用16組光纖單孔掃描設計,一根光纖用于高能LED激發(fā),另一根用于光信號檢測,可16孔同時采集,確保數(shù)據采集的一致性(圖2)。此外采用“全孔檢測”技術,每個孔可采集大約100,000個數(shù)據點,檢測時取讀數(shù)的平均值,精準測定每個孔的熒光強度(圖3)。這種“全孔檢測”為每個采集時間點提供了比單孔掃描系統(tǒng)更具重現(xiàn)性和可靠性的數(shù)據,因為單孔掃描系統(tǒng)僅僅采集少量的數(shù)據點。
應用實例:
1、方法:
配制20µl反應體系,在Azure Cielo™實時熒光定量PCR系統(tǒng)進行10個重復孔的qPCR擴增。
2、結果與討論:
結果表明,Azure Cielo™實時熒光定量PCR系統(tǒng)能很好地檢測到每個qPCR擴增產物。由圖4可知,10個重復孔的擴增曲線高度一致,說明所有孔檢測到的信號均勻增加;計算得出Cq平均值為17.54,標準偏差低至0.02。Cq值的變異系數(shù)(CV)為0.13%,也反映了數(shù)據的高精準度。
光纖檢測系統(tǒng)與Marlow-Peltier溫度模塊相結合,在qPCR實驗中實現(xiàn)了孔間信號檢測的均勻性和加熱溫度的均勻性,并且由于每個樣品都是單孔激發(fā)和掃描,因此避免了背景信號的干擾。通過10個重復反應的低標準偏差和CV值進一步證明了Azure Cielo™實時熒光定量PCR系統(tǒng)的產品特點,即可完全消除光程差,不需要使用ROX進行均一化處理,Azure Cielo™實時熒光定量PCR系統(tǒng)仍能獲得高精準度的可靠數(shù)據。
Azure Cielo™實時熒光定量PCR系統(tǒng)
Azure Cielo™ 實時熒光定量PCR系統(tǒng)來自于美國Azure Biosystems公司,可為您提供3/6檢測通道,根據實驗需求靈活配置。這款產品采用了高能LED作為光源系統(tǒng),可保證光源強度高,光源一致性好;高品質的帕爾貼溫度模塊作為溫控系統(tǒng),升降溫速率快,可設置12列跨度30°C的溫度梯度;卓越的CMOS拍照+光纖信號傳輸作為檢測系統(tǒng),CMOS檢測靈敏度高,光纖傳輸速度快,無光損失和噪音干擾,無需ROX校準。Azure Cielo™實時熒光定量PCR系統(tǒng)可為您的科學研究提供高精準度、高靈敏度和高可靠性的實驗結果。