高通量單細胞轉(zhuǎn)錄組測序研究最重要的一個工作是對大數(shù)據(jù)的分析和數(shù)據(jù)挖掘,在第二部分,該綜述詳細介紹了單細胞測序數(shù)據(jù)的后續(xù)數(shù)據(jù)分析過程和常用分析方法。另外,針對單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的特點,本文還重點闡述了細胞軌跡推演,細胞互作預(yù)測和功能富集幾種常見且具有代表性的單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)深入挖掘高級分析內(nèi)容。
在第三部分,綜述重點對單細胞轉(zhuǎn)錄組測序中的常見技術(shù)問題:樣本類型選擇、多細胞率、捕獲效率、罕見亞群缺失問題進行了闡述,并根據(jù)最新的研究進展,提出了可能的解決方案。從這里,我們也可以看到,雖然每種技術(shù)方法有各種不完美的地方,但是,現(xiàn)在對單細胞技術(shù)的廣泛關(guān)注,也使得這些存在的問題在一步步解決。
在隨后一部分,本綜述對單細胞技術(shù)的未來發(fā)展進行了展望。單細胞轉(zhuǎn)錄組測序用于lncRNA、外泌體檢測,用于降低成本的多樣本標簽技術(shù),空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),三代測序用于單細胞轉(zhuǎn)錄組,單細胞多組學技術(shù)等進行了展望。我們相信,在接下來的幾年中,單細胞轉(zhuǎn)錄組研究會為科學研究帶來更多的成果和產(chǎn)出。
參考文獻:高通量單細胞轉(zhuǎn)錄組測序發(fā)展與展望. 生命科學, 2020, 32(12): 1280-1287.