細胞STR鑒定相關(guān)介紹

  據(jù)統(tǒng)計約30%細胞系被交叉污染或錯誤辨識，只因使用了交叉污染或錯誤辨識的細胞而導(dǎo)致研究結(jié)論錯誤、結(jié)果不可重復(fù)、臨床細胞治療災(zāi)難性后果……，這將浪費大量時間、精力和金錢。

世人皆知，細胞身嬌體貴難養(yǎng)活，養(yǎng)好細胞實屬不易。而這其中最煩的是污染、最怕的是掉包。因為盡管研究僧們有方法把一切污染的源頭扼殺在搖籃之內(nèi)，卻沒有火眼金睛辨別已經(jīng)換了馬甲的錯誤細胞。因而細胞一旦被李代桃僵，再資深的科研者都會陰溝里翻船，所以細胞鑒定顯得尤為重要。

為什么要進行細胞系鑒定？

進行細胞系STR鑒定是很重要的。很多生物醫(yī)藥的研究都采用培養(yǎng)細胞來進行，這些細胞可能是受贈于其它研究人員,也可能是從細胞庫(如美國 ATCC,American Type Culture Collection)得來。據(jù)估計，15-20%的實驗室，實驗中所使用的細胞已經(jīng)不是原來的細胞系，或者與其它細胞系發(fā)生了交叉污染。顯然，細胞系遭到污染、特征鑒別錯誤，將會極大的威脅著基于這些細胞而發(fā)表的論文質(zhì)量和研究發(fā)現(xiàn)的正確性。

什么情況下需要細胞系鑒定?

1. 當(dāng)建立或獲得一個新的細胞系時；
2. 一個涉及到細胞試驗項目開始/結(jié)束時；
3. 在細胞凍存之前，或細胞已連續(xù)培養(yǎng) 2～3 個月時；
4. 發(fā)表文章或申請課題經(jīng)費前；
5. 細胞系表現(xiàn)不穩(wěn)定或結(jié)果與預(yù)期差別較大時；
6. 當(dāng)實驗室使用超過一種細胞系時，所有細胞系最好先鑒定以排除交叉污染的可能。

如何根據(jù)STR數(shù)據(jù)判斷細胞系身份?

收到細胞系鑒定結(jié)果以及 STR 信息，可以與參考數(shù)據(jù)庫進行比對。如果細胞樣本的每個 STR 位點和參考細胞 STR 位點都能重合匹配，即說明該細胞系正確，反之則說明你的細胞系可能被錯誤標記，交叉污染或發(fā)生遺傳不穩(wěn)定。一般說來，匹配度≥80%即可認為該細胞系正確，匹配度＜80%則說明該細胞系的來源需要被懷疑。

如果細胞系被鑒定出發(fā)生交叉污染或錯誤標記，則需要拿更早代數(shù)的細胞進行鑒定，從而找到問題的起源或者直接從可靠的機構(gòu)購買一株新的細胞系。

生物細胞STR鑒定服務(wù)

STR（Short Tandem Repeat，短串聯(lián)重復(fù)序列）基因分型已被ICLAC、ATCC等權(quán)威機構(gòu)作為鑒別細胞身份及交叉污染的金標準。海星生物對人源細胞21個STR位點進行檢測，可方便與權(quán)威數(shù)據(jù)庫進行比對，具有較高的準確性。

 STR基因位點由長度為3～7個堿基對的短串連重復(fù)序列組成， 這些重復(fù)序列廣泛存在于人類基因組中，可作為高度多態(tài)性標記，被稱為細胞的DNA指紋。STR 基因座位上的等位基因可通過擴增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列的拷貝數(shù)的不同來區(qū)分，在毛細管電泳分離之后可通過熒光檢測來識別。隨后通過一定的計算方法，即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與細胞STR數(shù)據(jù)庫比對從而推算出樣品所屬的細胞系或可能的交叉污染的細胞系名稱。