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mRNA測(cè)序使用oligo d(T)富集方法結(jié)合高通量測(cè)序研究mRNA的表達(dá)和調(diào)控,是幾乎所有研究的...
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m6A甲基化修飾是指腺嘌呤的6號(hào)碳原子連接的氨基基團(tuán)中的一個(gè)氫被甲基基團(tuán)所取代。
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染色體外環(huán)狀DNA(extrachromosomal circular DNA,eccDNA)廣泛存...
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circRNA是通過(guò)外顯子反式剪接(back splicing)形成的一類(lèi)共價(jià)閉合環(huán)狀RNA,廣泛存...
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ChIP-seq使用抗體富集的方法在基因組范圍內(nèi)檢測(cè)多種蛋白(例如轉(zhuǎn)錄因子CTCF)和其他染色質(zhì)相關(guān)...
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LncRNA是一類(lèi)長(zhǎng)度大于200 nt的非編碼RNA,通常認(rèn)為它們并不編碼蛋白質(zhì),而是以RNA的形式...
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GEO數(shù)據(jù)庫(kù)(或者ENA數(shù)據(jù)庫(kù))中包含大量芯片、測(cè)序原始數(shù)據(jù)。這些數(shù)據(jù)一般都是可以免費(fèi)下載使用的,充...
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miRNA是一類(lèi)長(zhǎng)約22 nt的非編碼小RNA。miRNA通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)結(jié)合到靶mRNAs 3’U...
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TCGA,The Cancer Genome Atlas Program,癌癥基因組圖譜計(jì)劃,該數(shù)據(jù)...
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腫瘤組織中并不是100%的細(xì)胞都是腫瘤細(xì)胞,還含有基質(zhì)細(xì)胞,成纖維細(xì)胞,免疫細(xì)胞等,這些細(xì)胞構(gòu)成了腫...
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隨著高通量測(cè)序的發(fā)展,越來(lái)越多的物種被測(cè)序。無(wú)參轉(zhuǎn)錄組是指在沒(méi)有參考基因組的情況下,對(duì)真核生物的轉(zhuǎn)錄...
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CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation),是...
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piRNA(PIWI-interacting RNA),是一類(lèi)長(zhǎng)約25-33 nt的非編碼小RNA,...
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ATAC-seq,即利用轉(zhuǎn)座酶研究染色質(zhì)可進(jìn)入性的高通量測(cè)序技術(shù),是染色質(zhì)構(gòu)象研究的主流方法。
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