
轉(zhuǎn)錄組測(cè)序概述
轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)廣義上指某一生理?xiàng)l件下,細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合;狹義上指所有mRNA的集合。蛋白質(zhì)是行使細(xì)胞功能的主要承擔(dān)者,蛋白質(zhì)組是細(xì)胞功能和狀態(tài)的最直接描述,而由于目前蛋白質(zhì)實(shí)驗(yàn)技術(shù)的限制,轉(zhuǎn)錄組成為研究基因表達(dá)的主要段。轉(zhuǎn)錄組是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質(zhì)組的必然紐帶,轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控是目前研究最多的,也是生物體最重要的調(diào)控方式。
轉(zhuǎn)錄組研究是基因功能及結(jié)構(gòu)研究的基礎(chǔ)和出發(fā)點(diǎn),通過(guò)新一代高通量測(cè)序,能夠全面快速地獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態(tài)下的幾乎所有轉(zhuǎn)錄本及基因序列,已廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)研究、臨床診斷和藥物研發(fā)等領(lǐng)域。
基礎(chǔ)服務(wù)包
1.測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量控制(QC)
2.參考基因組比對(duì)服務(wù)及統(tǒng)計(jì)分析
3.無(wú)參考基因組的轉(zhuǎn)錄組拼接分析
4.新轉(zhuǎn)錄本基因注釋
5.表達(dá)水平正則化及計(jì)算
6.表達(dá)水平統(tǒng)計(jì)分析(PCA,熱圖等)
7.樣本間基因差異分析
8.樣本間差異基因統(tǒng)計(jì)分析(火山圖,熱圖)
增殖分析包(功能注釋)
1.差異基因 Gene Ontology 顯著性分析
2.差異基因代謝通路顯著性分析
增殖分析包(其他分析)
1.尋找新轉(zhuǎn)錄本
2.融合基因預(yù)測(cè)
3.SNP位點(diǎn)尋找
4.可變剪切尋找及統(tǒng)計(jì)
增殖分析包(關(guān)聯(lián)分析)
1.轉(zhuǎn)錄本與基因芯片關(guān)聯(lián)分析
2.轉(zhuǎn)錄本與microRNA關(guān)聯(lián)分析
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蘇州帕諾米克生物醫(yī)藥科技有限公司(簡(jiǎn)稱:諾米代謝)于 2013 年在蘇州工業(yè)園區(qū)成立,是中國(guó)最早成立、規(guī)模最大的代謝組學(xué)公司之一,致力于打造代謝組學(xué)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)與營(yíng)養(yǎng)全方案提供商,成為每個(gè)人的代謝管家。諾米代謝業(yè)務(wù)板塊包括組學(xué)技術(shù)服務(wù)、臨床質(zhì)譜、組學(xué)臨床產(chǎn)品與生物大數(shù)據(jù)平臺(tái),為全球客戶提供更快更精準(zhǔn)的代謝組學(xué)技術(shù)服務(wù)、臨床產(chǎn)品及大數(shù)據(jù)服務(wù)。
諾米代謝由“國(guó)家千人”計(jì)劃人才、金雞湖科技領(lǐng)軍人才領(lǐng)銜,創(chuàng)始及核心團(tuán)隊(duì)來(lái)自于哈佛大學(xué)、MD Anderson Cancer Center、UC Davis、加拿大 TMIC、北京大學(xué)、中科院等國(guó)內(nèi)外知名高?蒲性核w代謝組學(xué)、生物信息學(xué)、生物大數(shù)據(jù)、質(zhì)譜、藥學(xué)等領(lǐng)域的科學(xué)家團(tuán)隊(duì)。諾米代謝在蘇州、南京、北京、南昌、成都、金華、東莞的實(shí)驗(yàn)室共運(yùn)行 80 余臺(tái)全型號(hào)進(jìn)口質(zhì)譜設(shè)備,覆蓋代謝組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)檢測(cè)服務(wù)、臨床研發(fā)與檢驗(yàn)等領(lǐng)域。
基于自身完整的樣品預(yù)處理平臺(tái)、高分辨率質(zhì)譜平臺(tái)、海量代謝物庫(kù)與核心匹配算法、臨床大隊(duì)列樣本與組學(xué)大數(shù)據(jù)、獨(dú)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)“全靶”技術(shù)平臺(tái)、及領(lǐng)先的云數(shù)據(jù)分析系統(tǒng) BioDeep™ ,諾米代謝已為國(guó)內(nèi)外 400 余家知名科研院所、400 余家三甲醫(yī)院以及食品與制藥企業(yè)提供全面、專業(yè)的代謝組學(xué)技術(shù)服務(wù)。服務(wù)項(xiàng)目囊括非靶向代謝組學(xué)、靶向代謝組學(xué)、全靶、脂質(zhì)組學(xué)、蛋白組學(xué)、風(fēng)味組學(xué)、空間及單細(xì)胞代謝組學(xué),應(yīng)用領(lǐng)域包括農(nóng)業(yè)、環(huán)境、食品、營(yíng)養(yǎng)、腫瘤、心血管疾病、代謝類疾病及腸道微生物相關(guān)的研究領(lǐng)域,覆蓋 100 余項(xiàng)細(xì)分檢測(cè)分析服務(wù)內(nèi)容,為客戶提供個(gè)性化的代謝組學(xué)科研及臨床解決方案。
在質(zhì)譜精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)及組學(xué)臨床方面,諾米代謝有多個(gè)創(chuàng)新產(chǎn)品研發(fā)管線,涵蓋心血管疾病、腦卒中、腫瘤與腸道微生物方向的診斷、輔助診斷、早篩及用藥指導(dǎo)應(yīng)用。 基于自主國(guó)際領(lǐng)先的 MetaDiscovery™ 組學(xué)臨床技術(shù)平臺(tái),諾米代謝在 2021 年啟動(dòng)和實(shí)施了中國(guó) 10 萬(wàn)人群前瞻性腦卒中大隊(duì)列代謝組學(xué)研究計(jì)劃,將持續(xù)轉(zhuǎn)化多個(gè)臨床診斷與早篩產(chǎn)品,著力于利用代謝組學(xué)技術(shù)降低中國(guó)腦卒中的發(fā)病率。 諾米代謝目前已獲得元生創(chuàng)投、薄荷天使及沃生投資等行業(yè)知名基金的多輪投資,并取得科技領(lǐng) 軍企業(yè)、CMA 認(rèn)證企業(yè)、高新技術(shù)企業(yè)、江蘇省民營(yíng)科技企業(yè)、ISO-9001 質(zhì)量管理體系認(rèn)證、 GLP 實(shí)驗(yàn)室、第三方醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所等資質(zhì),知識(shí)產(chǎn)權(quán) 30 余項(xiàng),臨床注冊(cè)產(chǎn)品 20 余項(xiàng)。諾米代謝 將在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)與精準(zhǔn)營(yíng)養(yǎng)領(lǐng)域持續(xù)發(fā)力,為健康中國(guó) 2030 做貢獻(xiàn)。