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轉(zhuǎn)錄組深度測(cè)序分析服務(wù)
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最后更新:2014-7-25半年訪問(wèn):28
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轉(zhuǎn)錄組測(cè)序概述

轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)廣義上指某一生理?xiàng)l件下,細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合;狹義上指所有mRNA的集合。蛋白質(zhì)是行使細(xì)胞功能的主要承擔(dān)者,蛋白質(zhì)組是細(xì)胞功能和狀態(tài)的最直接描述,而由于目前蛋白質(zhì)實(shí)驗(yàn)技術(shù)的限制,轉(zhuǎn)錄組成為研究基因表達(dá)的主要段。轉(zhuǎn)錄組是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質(zhì)組的必然紐帶,轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控是目前研究最多的,也是生物體最重要的調(diào)控方式。

轉(zhuǎn)錄組研究是基因功能及結(jié)構(gòu)研究的基礎(chǔ)和出發(fā)點(diǎn),通過(guò)新一代高通量測(cè)序,能夠全面快速地獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態(tài)下的幾乎所有轉(zhuǎn)錄本及基因序列,已廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)研究、臨床診斷和藥物研發(fā)等領(lǐng)域。

     基礎(chǔ)服務(wù)包

1.測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量控制(QC)

2.參考基因組比對(duì)服務(wù)及統(tǒng)計(jì)分析

3.無(wú)參考基因組的轉(zhuǎn)錄組拼接分析

4.新轉(zhuǎn)錄本基因注釋

5.表達(dá)水平正則化及計(jì)算

6.表達(dá)水平統(tǒng)計(jì)分析(PCA,熱圖等)

7.樣本間基因差異分析

8.樣本間差異基因統(tǒng)計(jì)分析(火山圖,熱圖)

增殖分析包(功能注釋)

1.差異基因 Gene Ontology 顯著性分析

2.差異基因代謝通路顯著性分析

增殖分析包(其他分析)

1.尋找新轉(zhuǎn)錄本

2.融合基因預(yù)測(cè)

3.SNP位點(diǎn)尋找

4.可變剪切尋找及統(tǒng)計(jì)

增殖分析包(關(guān)聯(lián)分析)

1.轉(zhuǎn)錄本與基因芯片關(guān)聯(lián)分析

2.轉(zhuǎn)錄本與microRNA關(guān)聯(lián)分析

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