菲沙一體化生物信息分析服務(wù)

隨著測序技術(shù)的發(fā)展，能夠更加容易的獲取基因組數(shù)據(jù)和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。然而，在海量數(shù)據(jù)中，您將需要的不僅僅是一面放大鏡去尋找研究問題的答案，更重要的是需要有一個(gè)實(shí)力生物信息學(xué)團(tuán)隊(duì)幫您排憂解難。菲沙基因?qū)嵙�科研團(tuán)隊(duì)可以幫助您挖掘數(shù)據(jù)中的豐富潛能。

成功案例
- 甜橙基因組序列分析分析其物種起源 (圖1, Nature Genetics1).
- 瘧疾寄生蟲的基因組對比發(fā)現(xiàn)關(guān)鍵酶可能與人類疾病有關(guān) (圖2, PLoS Computational Biology2).
- 100個(gè)肝癌組織的突變分析發(fā)現(xiàn)了獨(dú)特的突變特征 (Nature Genetics, under review).
- 利用全基因組測序挖掘出模式生物表型差異的遺傳基礎(chǔ) (Genetics3; BMC Genomics, in press).
- 松材線蟲腸道微生物的宏基因組分析揭示了松木樹脂降解過程中的關(guān)鍵共生關(guān)系 (Scientific Reports4).

菲沙優(yōu)勢
1. 際領(lǐng)先視野和影響力專家阮一駿，陳楠生，和Jeffrey Chu博士組成的頂尖的科學(xué)技術(shù)團(tuán)隊(duì)
2. 與專家面對面會(huì)談并協(xié)助項(xiàng)目方案設(shè)計(jì)
3. 算法、流程開發(fā)與個(gè)性化信息分析能力強(qiáng)
4. 快速解決問題和成果產(chǎn)出能力強(qiáng)

我們的服務(wù)
疾病研究                                                                                           農(nóng)作物和模式生物
癌癥驅(qū)動(dòng)基因分析                                                                            基因組重測序和新基因組組裝
遺傳病、罕見疾病致病基因以及機(jī)理檢測                                    全基因組和轉(zhuǎn)錄組研究
基因組SNV, CNV, 基因融合, 和復(fù)雜突變檢測                              表型和基因型的相關(guān)性分析
疾病獨(dú)特基因譜檢測                                                                        基因表達(dá)分析
…                                                                                                        物種進(jìn)化過程分析
                                                                                                            …

病原體                                                                                               宏基因組學(xué)
潛在的致病因素檢測                                                                        環(huán)境和組織微生物種類和豐度分析
基因家族變化分析                                                                            重要代謝通路構(gòu)建
病原體宿主相互作用                                                                        微生物meta特殊功能相關(guān)基因及機(jī)理分析
…   

                                                                                                    …

參考文獻(xiàn)
1. Xu, Q. et al. The draft genome of sweet orange (Citrus sinensis). Nature Genetics 45, 59-66 (2013).
2. Frech, C. & Chen, N. Genome comparison of human and non-human malaria parasites reveals species subset-specific genes potentially linked to human disease. PLoS Computational Biology 7, e1002320 (2011).
3. Chu, J.S. et al. Allelic ratios and the mutational landscape reveal biologically significant heterozygous SNVs. Genetics 190, 1225-33 (2012).
4. Cheng, X.Y. et al. Metagenomic analysis of the pinewood nematode microbiome reveals a symbiotic relationship critical for xenobiotics degradation. Scientific Reports 3, 1869 (2013).

個(gè)性化生物信息分析

生命世界充滿各種耐人尋味的奧秘，大量生物科學(xué)家著迷與此，致力于剖析生命現(xiàn)象的本質(zhì)，而高通量測序技術(shù)成為了生物研究領(lǐng)域的新星。相比后續(xù)生物信息分析而言，測序數(shù)據(jù)的產(chǎn)出變得越來越容易。鑒于研究目的和研究對象的不同，單一套路式的信息分析流程已經(jīng)無法滿足科研人員的需求。

菲沙基因擁有多名海內(nèi)外知名的生物信息專家，以及大量經(jīng)驗(yàn)豐富的生物信息分析工程師，可以從合作伙伴的研究熱點(diǎn)、材料特殊性、關(guān)注的生物學(xué)核心問題出發(fā)，為您提供定制化的生物信息分析服務(wù)。

軟件和算法開發(fā)

菲沙基因擁有一批高水平的生物信息研發(fā)團(tuán)隊(duì)，團(tuán)隊(duì)核心成員均擁有生物學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)雙學(xué)位，具有極強(qiáng)的專業(yè)素養(yǎng)和軟件開發(fā)能力，具有生物軟件自主開發(fā)的能力。目前公司已經(jīng)開發(fā)了如下生物信息軟件：

        基因建模軟件genBlast系列，包括genBlastA和genBlastG
        用于尋找并分析基因組共線性的生物信息學(xué)軟件OrthoCluster以及OrthoClusterDB
        用于比對基因和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的生物信息學(xué)軟件FeatureStack
        分析遺傳多樣性對基因突變作用的生物信息學(xué)軟件CooVar
        第三代DNA測序方法的生物信息學(xué)軟件VariationBlast
      
菲沙基因提供專業(yè)的生物信息軟件的開發(fā)和使用服務(wù)，并可以幫助客戶開發(fā)指定功能的生物信息學(xué)軟件。
 

生物數(shù)據(jù)庫的開發(fā)和維護(hù)

菲沙基因核心技術(shù)團(tuán)隊(duì)人員參與構(gòu)建了大型生物信息學(xué)平臺 WormBase，擁有大型生物數(shù)據(jù)庫開發(fā)的經(jīng)驗(yàn)，可以幫助科研人員構(gòu)建特定物種的生物數(shù)據(jù)庫。
 

高質(zhì)量論文修改  

三代測序數(shù)據(jù)信息分析  

生物信息培訓(xùn)