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原核轉(zhuǎn)錄組針對(duì)原核微生物,用新一代高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)該物種的特定組織或細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,與參考基因組比較,可以得到基因表達(dá)差異、GO功能分類、以及代謝通路分析等信息。
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原核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
原核轉(zhuǎn)錄組針對(duì)原核微生物,用新一代高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)該物種的特定組織或細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,與參考基因組比較,可以得到基因表達(dá)差異、GO功能分類、以及代謝通路分析等信息。原核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序通過(guò)對(duì)原核total RNA樣本去rRNA后進(jìn)行文庫(kù)制備,采用Illumina公司高通量測(cè)序平臺(tái)測(cè)序,通過(guò)信息分析,可以獲得基因表達(dá)差異信息、SNP分析、預(yù)測(cè)新轉(zhuǎn)錄本等信息,這為研究基因的結(jié)構(gòu)和基因的表達(dá)調(diào)控提供了一個(gè)重要的手段。
原核鏈特異性全譜轉(zhuǎn)錄組測(cè)序通過(guò)對(duì)原核total RNA樣本去rRNA后進(jìn)行文庫(kù)制備,采用Illumina公司高通量測(cè)序平臺(tái)測(cè)序,通過(guò)信息分析,可以確定一條轉(zhuǎn)錄本是來(lái)自正義鏈還是反義鏈并且可以確定轉(zhuǎn)錄本的邊界,能比普通轉(zhuǎn)錄組更精確地統(tǒng)計(jì)轉(zhuǎn)錄本的數(shù)量,還可同時(shí)可以挖掘non-coding RNA的信息,這為研究基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)調(diào)控提供了技術(shù)支持。菲沙基因可以為您提供普通原核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、特異性全譜轉(zhuǎn)錄組測(cè)序以及sRNA分析。
項(xiàng)目流程(參照如下)
信息分析(參照如下)
交付結(jié)果
數(shù)據(jù):按照Fastq等國(guó)際公認(rèn)的數(shù)據(jù)格式進(jìn)行存儲(chǔ),被大多數(shù)軟件支持,方便后續(xù)分析
報(bào)告:詳細(xì)的統(tǒng)計(jì)圖表和方法描述
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