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AFLP  遺傳標(biāo)記技術(shù)服務(wù)
您只要提供原始樣本,反饋給您:01矩陣;聚類分析;多樣性分析;
服務(wù)類別:分子與細(xì)胞總訪問:234
最后更新:2022-2-8半年訪問:22
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AFLP 技術(shù)服務(wù)
 
AFLP標(biāo)記技術(shù)是1993年由荷蘭的Zabeau和Vos博士提出并完善的。現(xiàn)已廣泛應(yīng)用于生物多樣性,指紋圖譜的構(gòu)建,遺傳圖譜的構(gòu)建,基因克隆等諸多研究領(lǐng)域,顯示了廣闊的應(yīng)用前景。AFLP與其他分子標(biāo)記相比具有:1、DNA 用量少;2、可重復(fù)性好;3、多態(tài)性強(qiáng);4、分辨率高;5、樣品適用性廣,6、對(duì)基因組序列信息依賴性低等優(yōu)點(diǎn)。在物種的多態(tài)性分析中獲得廣泛的應(yīng)用。AFLP的選擇擴(kuò)增產(chǎn)物目前主要通過兩種方法進(jìn)行分離檢測(cè),傳統(tǒng)的聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)的方法和自動(dòng)化程度較高的毛細(xì)管凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè)。
PAGE方法主要是AFLP的選擇擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)過聚丙烯酰胺凝膠電泳得到分離,然后通過銀染將條帶顯現(xiàn)出來(lái),然后通過照相得到相應(yīng)的圖片,優(yōu)點(diǎn)是引物可以是普通引物,價(jià)格相對(duì)較低,做少量樣本或者大量樣本的引物篩選比較合適,另外還可以對(duì)差異條帶進(jìn)行克隆測(cè)序,獲得差異條帶的序列信息。
毛細(xì)管電泳檢測(cè)方法的優(yōu)點(diǎn)是自動(dòng)化,可以對(duì)大量樣本進(jìn)行實(shí)驗(yàn),速度快,后期的條帶讀取可以依靠軟件,降低了人為讀取的標(biāo)準(zhǔn)不一。
1)AFLP實(shí)驗(yàn)路線
前期確認(rèn)階段:試驗(yàn)樣本類型,數(shù)量,引物,簽訂試驗(yàn)合作合同;
試驗(yàn)階段:DNA提取,酶切,預(yù)擴(kuò)增,選擇性擴(kuò)增,電泳檢測(cè);若需要克隆,進(jìn)行目的條帶的回收并測(cè)序(周期視工作量而定);
數(shù)據(jù)分析:和客戶詳細(xì)溝通,確認(rèn)分析方案:讀取01矩陣;聚類分析;多樣性分析;多態(tài)位點(diǎn)數(shù)(AP) 、多態(tài)位點(diǎn)百分率( P) 、平均等位基因數(shù)(N a) 、有效等位基因數(shù)(N e) 、Nei′s基因多樣性指數(shù)(H) 、Shannon′s信息指數(shù)( I) 、遺傳分化度(Fst)等。利用NTSYS進(jìn)行聚類分析。
2目前已經(jīng)進(jìn)行的樣本類型樹木,草,花卉,昆蟲,魚類,蝦類,真菌
3)客戶須知:
本公司需要簽訂技術(shù)服務(wù)合作合同;
本公司再試驗(yàn)結(jié)束后,如沒要求,試驗(yàn)樣本將統(tǒng)一銷毀;
本公司不接受具有致病性和潛在危險(xiǎn)的原始樣本,此類樣本請(qǐng)您提供樣本DNA。。
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

圖1 PAGE檢測(cè)引物篩選圖
 

圖2 毛細(xì)管電泳檢測(cè)大量樣本圖
 
圖4 序列測(cè)定
 
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