主要原理是基于RNA與其相應的RNA結(jié)合蛋白會在紫外照射下會發(fā)生共價結(jié)合,以RNA結(jié)合蛋白的特異性抗體將RNA-蛋白復合物沉淀之后,回收其中的RNA片段,進行qRT-PCR檢測或測序分析。最近,這項技術也被應用于microRNA的靶標鑒定。
服務優(yōu)勢
1經(jīng)紫外照射,細胞內(nèi)的RNA與相應的RNA結(jié)合蛋白交聯(lián),增強RNA與蛋白的結(jié)合能力
2可檢測多種RNA,如LncRNA、mRNA、microRNA。
3可通過mRNA的差異表達,檢測microRNA的靶標mRNA。
4 PAR-Clip可精確定位RNA與蛋白的結(jié)合位點。
服務內(nèi)容
研究RNA與RNA結(jié)合蛋白的相互作用
研究microRNA的靶標mRNA
服務流程
1狀態(tài)良好的細胞在356nm的紫外燈下照射一定時間
2收集細胞,制成蛋白提取液
3磁珠與抗體孵育
4帶有抗體的磁珠與蛋白提取液孵育
5清洗磁珠,加Trizol提取RNA,進行qRT-PCR或測序分析
Clip與RIP的區(qū)別
Clip與RIP的共同點:都是用于研究RNA與RNA結(jié)合蛋白互作的實驗方法
Clip的優(yōu)勢:Clip與RIP的實驗方法基本一致,Clip在細胞裂解前要經(jīng)過紫外的照射;罴毎(jīng)紫外照射后,RNA與RNA結(jié)合蛋白會發(fā)生共價結(jié)合,結(jié)合能力強。而RIP細胞中的RNA與RNA結(jié)合蛋白通過氫鍵和范德華力結(jié)合,結(jié)合能力較弱。因此,RIP實驗的洗脫過程中,會損失大量的RNA,而Clip實驗有效的避免了這一點。
客戶提供
IP級別的蛋白抗體
所研究的細胞株
如期提供
qPCR原始數(shù)據(jù)及處理結(jié)果,測序分析原始數(shù)據(jù)及處理結(jié)果
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廣州如期生物技術有限公司成立于2016年10月,始終以探索科學、服務客戶為己任,專注于模式生物領域,專業(yè)從質(zhì)譜檢測方法的研發(fā)、物種測序分析和細胞培養(yǎng)與純化。廣州如期生物技術有限公司已經(jīng)建立起基因組學、轉(zhuǎn)錄組學、代謝組學、蛋白組學等多個科研平臺。在產(chǎn)品方面,自主研究多種類型科研試劑盒20多項,致力于為高校、科研院所、醫(yī)院、制藥企業(yè)提供全面、便捷、專業(yè)的模式生物技術服務和產(chǎn)品。