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iTRAQ/IBT/TMT蛋白定量分析
定量蛋白質(zhì)組學(xué)(Quantitative Proteomics)是對(duì)一個(gè)基因組表達(dá)的全部蛋白質(zhì)或一個(gè)復(fù)雜混合體系內(nèi)所有蛋白質(zhì)進(jìn)行精確鑒定和定量。
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最后更新:2022-10-17半年訪問:103
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 定量蛋白質(zhì)組學(xué)(Quantitative Proteomics)是對(duì)一個(gè)基因組表達(dá)的全部蛋白質(zhì)或一個(gè)復(fù)雜混合體系內(nèi)所有蛋白質(zhì)進(jìn)行精確鑒定和定量?捎糜诤Y選和尋找任何因素引起的樣本之間的差異表達(dá)蛋白,結(jié)合生物信息學(xué)揭示細(xì)胞生理病理功能,同時(shí)也可對(duì)某些關(guān)鍵蛋白進(jìn)行定性和定量分析。
  iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)技術(shù)是由AB SCIEX公司研發(fā)的一種體外同重同位素標(biāo)記的相對(duì)與絕對(duì)定量技術(shù)。蛋白定量iTRAQ技術(shù)利用多種同位素試劑標(biāo)記蛋白多肽N末端或賴氨酸側(cè)鏈基團(tuán),經(jīng)高精度質(zhì)譜儀串聯(lián)分析,可同時(shí)比較多達(dá)8種樣品之間的蛋白組表達(dá)量差異,是近年來定量蛋白質(zhì)組學(xué)常用的高通量篩選技術(shù)。
IBT(Isobaric Tags)蛋白定量分析,作為常規(guī)iTRAQ蛋白定量分析的升級(jí)版,是華大基因首推的蛋白定量領(lǐng)域新產(chǎn)品。它基于華大基因與合作伙伴共同開發(fā)的IBT標(biāo)記技術(shù),通過深入優(yōu)化實(shí)驗(yàn)步驟和信息分析流程,將原本iTRAQ技術(shù)的標(biāo)記上限8個(gè)樣本/批次,增加至16個(gè)樣本/批次甚至更多,結(jié)合高分辨率質(zhì)譜儀高效快速的掃描效率,全面解決多于8個(gè)比較組的蛋白樣本定量問題。IBT蛋白定量分析產(chǎn)品能夠提供優(yōu)于常規(guī)iTRAQ技術(shù)的鑒定、定量結(jié)果,為廣大客戶提供一種性價(jià)比更高的蛋白組定量分析新選擇。
TMT(Tandem Mass Tag)串聯(lián)質(zhì)譜標(biāo)記技術(shù)是由Thermo公司研發(fā)的一種體外同重同位素標(biāo)記的相對(duì)與絕對(duì)定量技術(shù)。蛋白定量TMT技術(shù)利用多種同位素試劑標(biāo)記蛋白多肽N末端或賴氨酸側(cè)鏈基團(tuán),包括4plex、8plex、16plex等不同數(shù)量標(biāo)簽的產(chǎn)品,經(jīng)高精度質(zhì)譜儀串聯(lián)分析,最新推出的TMTpro 18plex可同時(shí)比較多達(dá)18個(gè)樣品之間的蛋白組表達(dá)量差異,是近年來定量蛋白質(zhì)組學(xué)常用的高通量篩選技術(shù)。

標(biāo)記定量1

圖1 TMT試劑結(jié)構(gòu) 

 

產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)

  • 通量高:可同時(shí)對(duì)2-18種以內(nèi)實(shí)驗(yàn)樣本進(jìn)行蛋白組定量分析和比較;
  • 周期短:標(biāo)記混合上樣大幅度壓縮機(jī)時(shí),縮短項(xiàng)目周期;
  • 重復(fù)性高:采用多個(gè)標(biāo)記樣本同時(shí)上機(jī)的方法,避免樣本分別上機(jī)檢測(cè)和傳統(tǒng)制膠實(shí)驗(yàn)重復(fù)性差的問題;
  • 經(jīng)驗(yàn)豐富:10余年豐富項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),40+項(xiàng)質(zhì)控保障,200+篇質(zhì)譜文章發(fā)表;
  • 云平臺(tái)交付:采用Dr. Tom云平臺(tái)進(jìn)行數(shù)據(jù)交付,便于開展零生信基礎(chǔ)的數(shù)據(jù)挖掘,以及同轉(zhuǎn)錄組的自主關(guān)聯(lián)分析;
  • 一站式、多組學(xué)服務(wù):提供經(jīng)典的蛋白質(zhì)組非靶向發(fā)現(xiàn)+靶向驗(yàn)證一站式服務(wù);以及蛋白質(zhì)組+轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組+代謝組、常規(guī)蛋白質(zhì)組+磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)等一系列多組學(xué)關(guān)聯(lián)分析服務(wù)。

產(chǎn)品應(yīng)用

  •  人類疾病研究:

        疾病生物標(biāo)志物篩選和驗(yàn)證

        疾病發(fā)生發(fā)展過程中的蛋白表達(dá)調(diào)控機(jī)制

        藥效評(píng)估

  • 動(dòng)植物基礎(chǔ)研究:

        重要農(nóng)作物農(nóng)藝性及其改良措施

        動(dòng)植物生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制研究

        抗逆抗病機(jī)制研究

  • 微生物領(lǐng)域研究:

        致病機(jī)理研究

        耐藥性研究

        宿主-微生物的相互作用機(jī)制研究

技術(shù)路線

  標(biāo)記定量2

信息分析

信息分析條款

信息分析條款

標(biāo)準(zhǔn)信息分析

標(biāo)準(zhǔn)信息分析內(nèi)容

1.1 數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計(jì)

1.2 蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果

1.3 蛋白質(zhì)定量結(jié)果

1.4 蛋白質(zhì)GO分析

1.5 蛋白質(zhì)KOG/COG/eggNOG分析

1.6 蛋白質(zhì)Pathway代謝通路分析

1.7 差異蛋白的GO富集分析

1.8 差異蛋白的Pathway富集分析

1.9 差異蛋白KOG/COG/eggNOG富集分析

1.10 重復(fù)性分析(僅針對(duì)設(shè)計(jì)了重復(fù)的實(shí)驗(yàn))

1.11多樣品間表達(dá)模式聚類(三個(gè)或三個(gè)以上樣品可提供)

1.12 差異表達(dá)蛋白互作分析

1.13 差異表達(dá)蛋白亞細(xì)胞定位

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