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10X單細(xì)胞免疫組庫(kù)測(cè)序
10x Genomics單細(xì)胞免疫組庫(kù)測(cè)序又稱10x單細(xì)胞V(D)J測(cè)序，揭示免疫細(xì)胞的復(fù)雜性，有助于在傳染病、自身免疫性疾病、免疫療法開(kāi)發(fā)和癌癥研究中獲得切實(shí)可行的深入見(jiàn)解。
服務(wù)類別：芯片與生物信息學(xué)總訪問(wèn)：274
最后更新：2024-3-22半年訪問(wèn)：37
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10x Genomics單細(xì)胞免疫組庫(kù)測(cè)序又稱10x單細(xì)胞V(D)J測(cè)序，一次性能夠分離500~10000個(gè)單細(xì)胞，利用5'端接頭的通用引物和免疫分子恒定區(qū)的巢式引物進(jìn)行V(D)J富集，并可以同時(shí)測(cè)定同一細(xì)胞的TCR、B細(xì)胞免疫球蛋白和5’基因表達(dá)，獲得單個(gè)T細(xì)胞TCR的α鏈和β鏈的配對(duì)序列信息，單個(gè)B細(xì)胞的重鏈和輕鏈免疫球蛋白（Ig）配對(duì)序列，以及基因表達(dá)等信息，揭示免疫細(xì)胞的復(fù)雜性，有助于在傳染病、自身免疫性疾病、免疫療法開(kāi)發(fā)和癌癥研究中獲得切實(shí)可行的深入見(jiàn)解。

技術(shù)優(yōu)勢(shì)
  • 分析數(shù)百至數(shù)萬(wàn)個(gè)淋巴細(xì)胞，以檢測(cè)罕見(jiàn)的全長(zhǎng)V（D）J轉(zhuǎn)錄物和細(xì)胞類型亞群；
  • 同時(shí)測(cè)量來(lái)自相同單細(xì)胞的配對(duì)的TCRα/β和BCR重鏈/輕鏈信息和基因表達(dá)，精確的H鏈和L鏈的組合、α鏈和β鏈的組合，性價(jià)比更高；
  • 細(xì)胞通量高：500-10000個(gè)；
  • 使用直觀的軟件工具顯示免疫庫(kù)的克隆性，多樣性和細(xì)胞環(huán)境，對(duì)應(yīng)分析軟件工具可視化：Cell Ranger Analysis Pipeline和Loupe V（D）J Cell Browser;
  • 單個(gè)細(xì)胞成本最低

技術(shù)路線

技術(shù)參數(shù)
  • 組織樣本：0.2g新鮮組織，置于美天旎組織保存液中，2-8℃保存，48h以內(nèi)運(yùn)輸
  • 細(xì)胞總量：5 x 105個(gè)
  • 活細(xì)胞濃度：＞400 cell/ul
  • 細(xì)胞大�。�5um≤細(xì)胞直徑≤30um
  • 細(xì)胞活性：活細(xì)胞比例85%以上
  • 測(cè)序細(xì)胞個(gè)數(shù)：1000-10000
  • 測(cè)序數(shù)據(jù)量：?jiǎn)渭?xì)胞轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)：100k Reads/細(xì)胞（30M bp/細(xì)胞）；10x TCR或者BCR文庫(kù)：10k Reads/細(xì)胞（3M bp/細(xì)胞）
  • 測(cè)序模式：Illumina Novaseq6000，PE150測(cè)序模式

部分結(jié)果展示
clonotype頻率分布圖

V-J paired豐度分布熱圖

V-J paired 頻率Circos圖

樣本間Clonotypes數(shù)目比較韋恩圖













 
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