gDNA提取方法適用于各種濃度的細(xì)菌和酵母

     從微生物中提取基因組DNA，人們多采用異硫氰酸胍進(jìn)行裂解，不過(guò)對(duì)于有些細(xì)菌而言，仍需要繁瑣的預(yù)處理。研究人員開(kāi)發(fā)出一種快速而經(jīng)濟(jì)的gDNA提取方法，適用于各種濃度的細(xì)菌和酵母。

      為了加速微生物的檢測(cè)和分析，許多分子生物學(xué)技術(shù)都經(jīng)過(guò)了優(yōu)化，如PCR、質(zhì)譜和測(cè)序。然而，DNA提取方法卻始終未見(jiàn)大的進(jìn)展。異硫氰酸胍處理和硅膠柱的方法能夠從革蘭氏陰性菌中很好地提取DNA，但革蘭氏陽(yáng)性菌或抗酸的細(xì)菌和酵母仍需要酶學(xué)或機(jī)械預(yù)處理。對(duì)于血液或尿液這種存在不同類(lèi)型微生物的樣品而言，這很麻煩。

      人們也嘗試了各種策略來(lái)增強(qiáng)異硫氰酸胍對(duì)微生物的裂解，包括機(jī)械法、酶學(xué)或化學(xué)處理。機(jī)械處理也許是zui常用的方法，但可能將gDNA剪切成小的片段，限制PCR擴(kuò)增子的量。對(duì)于含有不同類(lèi)型微生物的樣品，這個(gè)問(wèn)題就變得更加復(fù)雜，因?yàn)椴煌�微生物可能需要不同的微珠和處理時(shí)間。酶學(xué)和化學(xué)裂解通常也是因微生物而異，往往更耗時(shí)。

      在這項(xiàng)研究中，采用了一種稱(chēng)為EtNa的新方法。它通過(guò)加熱乙醇?jí)A性溶液而釋放出細(xì)菌和酵母中的單鏈DNA，關(guān)鍵是不同微生物的提取效率相似。當(dāng)微生物的身份未知，或提取不得忽視或偏向特定微生物時(shí)，這種方法就很有用。