DNA Marker-核酸分子標簽原理解析
瀏覽次數:235 發(fā)布日期:2025-3-21
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DNA Marker(DNA標記物)是一種用于核酸電泳的分子量標準工具,通過已知長度的DNA片段幫助研究人員估計樣品DNA的大小、濃度及電泳遷移特性。以下是其核心信息:
一、定義與作用
- 基本定義
DNA Marker由特定分子量的雙鏈DNA片段組成(如100bp、500bp、1kb等),混合含染料的上樣緩沖液,用于電泳中作為分子量參照。
- 廣義:包括可遺傳的DNA序列或蛋白質標記。
- 狹義:特指反映基因組差異的特異性DNA片段。
- 核心作用
- 分子量估算:通過對比Marker條帶與樣品條帶的位置,粗略判斷目標DNA的大小。
- 濃度檢測:利用Marker中高濃度條帶(如750bp)的亮度,輔助估算樣品濃度。
- 電泳條件優(yōu)化:根據目標片段大小選擇凝膠濃度(如大片段用低濃度瓊脂糖,小片段用高濃度)。
二、類型與規(guī)格
- 常見類型
- 預染Marker:含RedView、SYBR Green等染料,可直接電泳觀察。
- 非預染Marker:需后續(xù)染色,靈敏度更高。
- 梯度Marker:覆蓋廣泛分子量范圍(如1000bp、2000bp),適合多目標分析。
- 規(guī)格示例
- 1000bp:含50bp、100bp至1000bp的條帶,適用于常規(guī)PCR產物分析。
- 12000bp:覆蓋12000bp以上大分子DNA,用于質粒完整性檢測。
三、選擇標準
- 目標片段匹配
- 選擇Marker中與目標片段大小相鄰的密集條帶,以提高估算精度。
- 例如:檢測500bp片段時,優(yōu)先選擇含400bp、600bp條帶的Marker。
- 凝膠濃度適配
- 大片段(>1kb):使用0.8%-1.0%瓊脂糖+1xTAE緩沖液。
- 小片段(<500bp):使用1.5%-2.0%瓊脂糖+0.5xTBE緩沖液。
- 染料類型
- RedView:低毒性,可直接紫外觀察,適合常規(guī)實驗。
- SYBR Green I:靈敏度高,但穩(wěn)定性較差,需避免長時間電泳。
四、應用場景
- 分子生物學實驗
- PCR產物分析、質粒構建驗證。
- 基因組DNA提取質量檢測。
- 醫(yī)學與臨床檢測
- 病原體核酸檢測(如新冠病毒)中評估擴增效率。
- 遺傳病篩查中檢測基因突變。
- 工業(yè)與科研
- 基因組作圖、物種親緣關系分析。
- 腫瘤標志物檢測中的基因表達分析。
五、使用注意事項
- 保存條件
- 常規(guī)Marker(含Loading Buffer):室溫可穩(wěn)定3個月,長期保存需-20℃。
- 預染Marker:避免反復凍融,建議分裝后使用。
- 常見問題解決
- 條帶模糊:檢查DNA降解或電泳電壓過高。
- 遷移異常:確認樣品是否含高鹽或蛋白污染,調整電泳條件。
- Marker丟失:縮短電泳時間(如溴酚藍遷移至凝膠2/3處停止)。
六、市場代表產品
- 達原辰光DNA Marker:覆蓋50bp-12000bp,條帶清晰,適合各種應用。
- 諾唯贊DL2000:覆蓋100bp-2000bp,適合常規(guī)PCR