PCR Array——基因表達(dá)分析疾病和信號(hào)通路的利器（一）

靈敏度
RT2 First Strand Kit靈敏度高，每個(gè)芯片使用至少1 ng或至多5 µg總RNA可獲得高于80%的陽性信號(hào)率（參見Positive results with as little as 25 ng RNA）。

可檢測(cè)低達(dá)25 ng的RNA：使用Human Inflammatory Cytokines和Receptors RT2Profiler PCR Array來區(qū)分不同量的通用總RNA，然后計(jì)算各個(gè)量可檢測(cè)基因的百分比。即使細(xì)胞因子的表達(dá)水平很低，25 ng總RNA陽性率>80%。

重復(fù)性
可在各種real-time PCR分析儀上使用。整個(gè)PCR芯片體系與技術(shù)上的重復(fù)性、批次和儀器有很高的相關(guān)性，平均相關(guān)系數(shù)>0.99，確保對(duì)生物樣本間的表達(dá)差異進(jìn)行可靠的檢測(cè)（參見High reproducibility among different users）。
 
不同使用者均能獲得可重復(fù)的結(jié)果：對(duì)比兩位科學(xué)家（A 和B）在不同的時(shí)間使用Human Drug Metabolism RT2 Profiler PCR Arrays重復(fù)進(jìn)行四次實(shí)驗(yàn)，獲得的原始循環(huán)閾限數(shù)據(jù)（1–4）。結(jié)果表明數(shù)據(jù)間相關(guān)性很高（R2 >0.990）。
特異性
PCR芯片體系使用高品質(zhì)RNA，可在預(yù)期位置形成單條帶，無引物二聚體或其他二級(jí)產(chǎn)物，由此可獲得高度準(zhǔn)確的real-time PCR結(jié)果（參見A single gene-specific product in every reaction）。

 
每次反應(yīng)都能檢測(cè)到基因特異性產(chǎn)物：使用TGFβ/BMP Signaling Pathway RT2 Profiler PCR Array區(qū)分通用總RNA，然后進(jìn)行熔解曲線分析。PCR芯片特異性檢測(cè)個(gè)體基因，無論相同RNA樣本中相關(guān)基因家族成員的表達(dá)狀態(tài)如何。

對(duì)多種樣本的多個(gè)基因進(jìn)行準(zhǔn)確的基因表達(dá)比較，需要PCR芯片技術(shù)具有統(tǒng)一的PCR擴(kuò)增效率。將專有的引物設(shè)計(jì)法則與嚴(yán)格的引物分析檢測(cè)相結(jié)合，確保PCR芯片的每次引物分析都具有高性能（參見PCR arrays yield highly accurate results）。

PCR芯片能夠獲得高度準(zhǔn)確的結(jié)果：使用RT2 Profiler PCR Arrays對(duì)4000基因進(jìn)行分析，平均擴(kuò)增效率為99%。持續(xù)的高擴(kuò)增效率確保PCR芯片能夠使用ΔΔCT法準(zhǔn)確的同時(shí)分析多種基因。
數(shù)據(jù)分析便利——免費(fèi)的RT2 Profiler PCR Array的線上數(shù)據(jù)分析軟件可分析原始的CT值，可在幾分鐘內(nèi)得到多種形式的結(jié)果（散點(diǎn)圖、火山圖、群集圖）。 

未完待續(xù)。
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