高通量測序服務

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solexa實驗方案

  敏芯測序平臺包括：

1、基因組測序與重測序
2、數(shù)字表達譜分析
3、轉錄組測序
4、小RNA測序
5、ChIP-Seq
6、宏基因組測序（Meta-Genomics DNA測序）

＊ 實驗步驟:  （以tag profiling測序為例）

      對客戶提供的mRNA(或總RNA)進行樣品檢測，樣品檢測合格后采取如下技術路線進行測序： 
      基因表達方法采用Illumina Digital Gene Expression試劑盒。選取起始1～2μg總RNA，利用OligodT的beads富集總RNA樣本中mRNA，并逆轉錄為雙鏈cDNA，采用4堿基識別酶DpnII酶切雙鏈cDNA，鏈接Illumina adapter1，利用MmeI酶切3’端20堿基，并在3’端鏈接Illumina adapter2。 
    再加入Primer GX1和Primer GX2, 進行15個循環(huán)的PCR擴增（10 seconds at 98°C， 30 seconds at 60°C， 15 seconds at 72°C ，10 minutes at 72°C）。擴增后樣本通過6% TBE PAGE膠回收85堿基條帶，純化后通過Illumina基因表達測序法測序。 

＊ 技術參數(shù)： 

每個通道，測序片段35個bp。 
保證測量500萬Read。 
簡單的數(shù)據(jù)分析： 
1）、Reads數(shù)目統(tǒng)計及頻率分布圖，將Reads比對到參考基因、基因組。 
2）、Reads在所有已知的參考基因中的位置分布情況。 
3）、不同長度的所有已知的miRNA基因被Reads覆蓋的情況。 
進一步的數(shù)據(jù)分析參見詳細數(shù)據(jù)分析方案。 

所有解釋權歸上海敏芯信息科技有限公司所有；根據(jù)客戶的要求可以繼續(xù)進行其他的深入分析。