轉(zhuǎn)錄組指某一生理條件下,細胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合,包括codingᅠRNA和多種類型的non-codingᅠRNA。利用illumina 測序技術,首先去除 rRNA 然后進行全轉(zhuǎn)錄組測序可以全面檢測樣本中mRNA、lncRNA表達差異,并且可以同時對測到的circRNA進行分析。
實驗流程

技術參數(shù)
推薦測序方式: illumina 測序平臺, PE150 ,建議數(shù)據(jù)量至少10Gb/樣本
樣本要求:RNA≥1 μg( 最低100ng),濃度≥50ng/μl
各種來源的樣本都可以進行全轉(zhuǎn)錄組測序,包括組織、細胞、血清、血漿、外泌體、FFPE等
數(shù)據(jù)結(jié)果展示

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上海生物芯片有限公司成立于2001年8月,公司由上海科技創(chuàng)業(yè)投資(集團)有限公司、上海張江(集團)有限公司、中科院上海有關院所、上海交通大學等在上海的國內(nèi)知名大學、研究所、醫(yī)院和企業(yè)共同組建而成,經(jīng)國家發(fā)展與改革委員會批準公司建設和運行“生物芯片上海國家工程研究中心”,是我國生物醫(yī)藥領域規(guī)模最大的生物技術國家工程研究中心之一,是全國生物樣本標準化技術委員會(TC559)、中國醫(yī)藥生物技術協(xié)會組織生物樣本庫分會(BBCMBA)與中國抗癌協(xié)會腫瘤樣本整合研究分會的秘書處與主任委員單位。
通過二十余年的建設和發(fā)展,公司(中心)確立了以生物樣本庫、基因芯片、高通量測序、蛋白芯片、組織芯片、數(shù)字化病理、分子病理與生物信息學為核心平臺的技術創(chuàng)新服務體系,以分子醫(yī)學檢測技術和分子診斷產(chǎn)品研發(fā)生產(chǎn)為核心競爭力的產(chǎn)業(yè)化體系,形成科研和藥物研發(fā)技術服務、分子診斷產(chǎn)品研發(fā)生產(chǎn)銷售和分子醫(yī)學檢驗三大主營業(yè)務,公司(中心)具備科研及公共技術平臺服務優(yōu)勢、成熟的科技成果轉(zhuǎn)化服務能力、國家工程研究中心品牌影響力等強大的自身資源及優(yōu)勢。